大连想维持健康的肠道菌群？从饮食入手才靠

发布时间：2020-06-22 来源：大连胃肠医院

想维持健康的肠道菌群？从饮食入手才靠谱

今天是第795期日报。

Cell子刊：饮食决定宿主与细菌的共生关系

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 宿主的营养环境而不是宿主本身，是决定植物乳杆菌维持有利于宿主的共生机制的主要因素；② 植物乳杆菌醋酸激酶基因（ackA）的点突变可以增强植物乳杆菌的适应性，并促进宿主果蝇的生长；③ ackA基因突变的维持主要受宿主饮食的影响，与宿主本身无关；④ ackA基因突变促进N-乙酰化氨基酸的产生，其中包括N-乙酰基谷氨酰胺；⑤ 植物乳杆菌产生的N-乙酰基谷氨酰胺，足以提高该菌对果蝇生长的促进作用。

Bacterial Adaptation to the Host's Diet Is a Key Evolutionary Force Shaping Drosophila-Lactobacillus Symbiosis

06-28 DOI: 10.1016/j.chom.2018.06.001

Immunity：肠道菌群如何保护肠道免疫稳态？

Immunity[IF:19.734]

① 肠道菌群被抗生素破坏的小鼠感染沙门氏菌时，肠道内表达趋化因子受体CX3CR1的单核吞噬细胞（MNP）驱动Th1细胞增殖，促进肠道炎症；② 而肠道菌群存在时，CX3CR1+ MNP可生成抗炎细胞因子IL-10，限制促炎症的Th1和Th17细胞扩增、促进Treg细胞分化，从而抑制对肠道中食物和菌群抗原的炎症性应答；③ CX3CR1+ MNP的这些作用，依赖于其抗原呈递功能；④ 在清除菌群的小鼠肠道内定殖能粘附于肠上皮的大肠杆菌，可以诱导CX3CR1+ MNP的抗炎作用。

Critical Role for the Microbiota in CX3CR1+ Intestinal Mononuclear Phagocyte Regulation of Intestinal T Cell Responses

07-03 DOI: 10.1016/j.immuni.2018.05.009

一类有祖细胞特性的T细胞，可能是引发慢性肠炎的元凶

Journal of Experimental Medicine[IF:10.79]

① 小鼠结肠炎中，CD4效应T细胞有不同的分化状态，与其致病能力有关；② 小鼠过继转移实验表明，不生成IFN-γ的CD4 T细胞中存在具有祖细胞特性的细胞亚群，可引起和维持肠道炎症；③ 这类致病性CD4 T细胞的基因表达特征与干细胞相似，可自我更新和抵抗细胞凋亡，糖基转移酶ST6Gal-I在这些细胞中表达上调，促进表达与细胞干性相关的转录因子TCF1；④ 这些细胞可持续生成分化的IFN-γ+ CD4 T细胞，后者不能长期存留，无法独自引起肠道炎症。

Effector CD4 T cells with progenitor potential mediate chronic intestinal inflammation

06-18 DOI: 10.1084/jem.20172335

Nature子刊：用合成生物学方法设计多菌株群落

Nature Chemical Biology[IF:13.843]

① 合成生物学方法分别设计了六组具有不同互作类型的二菌株群落，包括互利共生、偏利共生、竞争、合作、捕食和共存等；② 设计使用了乳酸链球菌肽和乳球菌素A的生物合成通路元件，在乳酸乳球菌底盘上完成；③ 实验发现，在二菌株群落中，合成生物学模型预测与实际实验结果十分吻合；④ 特别是，将二菌株群落的模块组合成为三菌种和四菌种的系统时，系统的行为同样符合模型预期；⑤ 展示出合成生物学办法在设计菌群方面的光明前景。

Designing microbial consortia with defined social interactions

06-25 DOI: 10.1038/s41589-018-0091-7

炎症和动脉硬化间，肠道菌群可能是桥梁

European Heart Journal[IF:23.425]

① Menni等报道，动脉硬化与肠道菌群的多样性、特定菌种的丰度负相关；② 肠道菌群组成对颈动脉-股动脉脉搏波传导速度（PWV）的作用，仅部分由CRP、HOMA指数、体脂和传统风险因素介导；③ 所有分析均进行了多因素校正，动脉硬化与传统风险因素无关或关系微弱；④ 菌群因素可能成为新的心血管事件风险来源，慢性内毒素血症导致低度炎症可能是重要因素；⑤ 缺点是未检测内毒素血症的标志物、未研究膳食脂肪的作用和遗传学因素对动脉硬化的影响。

Gut microbiome composition, a third player in the inflammation-arterial stiffness relationship

05-31 DOI: 10.1093/eurheartj/ehy300

用高通量方法研究肠道细菌特性

Molecular Cell[IF:14.248]

① Tramontano等人鉴定了96株肠道菌在不同培养基中的生长情况，并揭示短链脂肪酸和粘蛋白等代谢物对特定细菌生长的影响；② Maier等人分析了非抗生素药物对肠道菌的生长抑制作用，揭示了耐药菌可能通过同样的机制实现对不同类型药物的耐药性；③ 引出共生菌在体外和群落内生长的关系、生长介质如何影响细菌的药物敏感性等新问题；④ 用高通量技术，在体外研究菌群中的单个成员与其它共生菌/环境的互作，有助于解析菌群影响健康和疾病的机制。

Cutting the Gordian Knot of the Microbiota

06-07 DOI: 10.1016/j.molcel.2018.05.034

造血干细胞移植引发的败血症，过半与肠道菌有关

Biology of Blood and Marrow Transplantation[IF:4.484]

① 评估同种异体造血干细胞移植后期血流感染（PE-BSI）的发病率、病因、危险因素和预后；② 316名患者有43名发生了57次PE-BSI事件，分离出62种病原菌，其中30种是肠道细菌，6种是肠道真菌；③ 使用甲基强的松龙预防移植物抗宿主病（GvHD）和急性胃肠道（GI）GvHD是发生PE-BSI的危险因素；④ GI-GvHD增加细菌移位和随后的败血症的风险，GI-GvHD患者对皮质类固醇的反应不足，可能与肠道失调相关；⑤ 与没有PE-BSI的患者相比，PE-BSI患者的预后更差。

Gastrointestinal graft-versus-host disease is a risk factor for post-engraftment blood stream infection in allogeneic hematopoietic stem cell transplant recipients

06-14 DOI: 10.1016/j.bbmt.2018.06.002

在基因组水平进行分类学和基因多样性分析的新工具

Nucleic Acids Research[IF:11.561]

① MiGA是一个在基因组水平上进行分类学和基因多样性分析的在线工具；② 比仅用16S rRNA基因分辨率更高，支持分析原始测序数据、完整或部分基因组、宏基因组、不可培养微生物基因组等；③ 方法基于基因组集合平均核酸和氨基酸一致性的概念，通过构建中心参考基因组，确保能够在搜索＞11000个基因组时高效运行；④ 针对相同或相似物种的基因组，提供了分辨率更高的分枝项目流程，可在基因水平计算多样性和演化关系以及进行泛基因组分析等。

The Microbial Genomes Atlas (MiGA) webserver: taxonomic and gene diversity analysis of Archaea and Bacteria at the whole genome level

06-14 DOI: 10.1093/nar/gky467