大连为什么不能忽视人体中的噬菌体和古细菌

发布时间：2020-07-13 来源：大连胃肠医院

为什么不能忽视人体中的噬菌体和古细菌？

今天是第584期日报。

Science：每天或有300亿噬菌体影响着人的健康

Science[IF:37.205]

① Barr等人的研究发现，在培养皿中，人上皮细胞可摄取噬菌体；② 估算人体每天通过肠道吸收300亿噬菌体，但培养皿不同于活体动物的肠道，且部分细胞为癌细胞，其噬菌体摄取率可能不同于正常细胞；③ 稳定的噬菌体流入，产生“体内噬菌体组”，可调控免疫应答，可能警示免疫系统存在潜在的病原体；④ 噬菌体组可能通过调控免疫系统而影响生理学；⑤ 噬菌体生物学范围狭窄但非常艰深，采用噬菌体操控体内的菌群甚而控制体内细胞，任重而道远。

Do bacteriophage guests protect human health?

2017-11-24 DOI: 10.1126/science.358.6366.982

Science：人体内的古细菌，不可忽视的菌群成员

Science[IF:37.205]

① 古细菌不仅位于温泉、碱性湖和废水处理厂，亦存在于房屋，人类的鼻子、肺、肠道和皮肤中；② 既往菌群分类研究遗漏了这些微生物，人类菌群研究不应仅限于细菌；③ 身体不同部位具有不同古细菌，部分可重叠，史氏甲烷短杆菌等产生的甲烷，减缓食物通过胃肠道的速度，引起便秘，可能参与炎症和肥胖；④ 目前古细菌的相关研究不全面，未来需研究人类古菌组；⑤ 靶向古细菌比靶向人类自身的副反应可能更少，有望成为新药研发的方向。

Survey of archaea in the body reveals other microbial guests

2017-11-24 DOI: 10.1126/science.358.6366.983

TI：长寿命浆细胞在维持肠道菌群稳态中的作用

Trends in Immunology[IF:13.287]

① 分泌型IgA可直接结合肠腔中的细菌，在免疫系统-菌群互作中起到关键作用；② 菌群特异性IgA反应在婴儿时期与肠道菌群共同发育，在2岁时与成人类似；③ 表面结合较多IgA的细菌可能表现出致结肠炎特性，另一方面，IgA可通过抑制分裂而控制侵入性致病菌；④ 提出假设：婴儿时期产生的可分泌菌群特异性IgA的浆细胞，可存活数十年，并促进了菌群群落的稳定性；⑤ 肠道菌群中的某些细菌可诱导持久性IgA反应，这些细菌可作为治疗的潜在靶点。

Do Long-Lived Plasma Cells Maintain a Healthy Microbiota in the Gut?

2017-11-20 DOI: 10.1016/j.it.2017.10.006

TM：革兰氏阳性菌中的抗菌性分泌系统

Trends in Microbiology[IF:11.020]

① 具有抗菌效应的5型（T5SS）及6型（T6SS）分泌系统仅存在于革兰氏阴性菌中；② 在结核分枝杆菌中存在的7型分泌系统（T7SS）可分泌约100个氨基酸大小的毒力因子，属于WXG100蛋白家族；③ 类似的小WXG100蛋白也存在于革兰氏阳性菌中，但尚未鉴定出抗菌活性；④ 革兰氏阳性菌的T7SS可能分泌一类具有WXG100蛋白结构域及C端延长部分的假定抗菌毒素；⑤ 包括芽孢杆菌属、葡萄球菌属、链球菌属在内的革兰氏阳性菌中具有与分枝杆菌类似的T7SS。

Antibacterial Toxins: Gram-Positive Bacteria Strike Back!

2017-11-21 DOI: 10.1016/j.tim.2017.11.003

FI：NKG2D受体及其配体在粘膜上皮炎症中的作用（综述）

Frontiers in Immunology[IF:6.429]

① NKG2D是自然杀伤细胞、CD8+αβT细胞、γδT细胞及iNKT细胞等先天性和获得性淋巴细胞表达的、C型植物血凝素样活化/共刺激受体；② NKG2D受体的活化参与免疫系统识别应激细胞，驱动效应性CD8+T细胞的细胞溶解功能，直接激活NK细胞，释放细胞溶解颗粒、分泌IFN-γ；③ 菌群调控NKG2D轴，NKG2D及配体在塑形先天性和获得性淋巴细胞群中发挥重要作用，参与粘膜免疫系统的稳态调控；④ 病毒及细胞感染、慢性炎症、吸烟等可调节NKG2D受体的活化。

How Mucosal Epithelia Deal with Stress: Role of NKG2D/NKG2D Ligands during Inflammation

2017-11-20 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01583

FM：与干酪乳杆菌Zhang的庆大霉素耐药性相关的碱性休克蛋白

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 分离出庆大霉素耐药性干酪乳杆菌Zhang，分析其耐药机制；② 在抗生素环境下培养干酪乳杆菌Zhang的亲本及子代细胞，72个蛋白在子代中显著上调，32个蛋白显著下调；③ 某些碳水化合物、氨基酸、嘌呤代谢通路表达提升，某些压力相关蛋白差异表达；④ 一种碱性休克蛋白（asp23）在庆大霉素耐药性菌株中上调倍数最高（21.9倍），asp23基因被破坏的突变体对庆大霉素的敏感性高于野生型菌株。

Adaptation of Lactobacillus casei Zhang to gentamicin involves an alkaline shock protein

2017-11-23 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02316

FM：如何清除乳酸菌发酵过程中产生的乳酸（综述）

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 乳酸菌（LAB）发酵产生乳酸，胞膜上未解离乳酸的溶解度和解离乳酸的不可溶性，致胞浆酸化和质子动力势能耗散，影响跨膜pH梯度，减少用于细胞生长的能量；② 终产物抑制致LAB的产量减少及生物量浓度下降，影响其作为益生菌的应用；③ 克服终产物抑制的萃取发酵方法包括溶剂萃取、电渗析、双水相系统（ATPS）和吸附；④ 从培养中清除乳酸，并作为发酵和分离完整过程中的乳酸纯化步骤，可望提高细胞浓度，同时以最低的代价原位复原乳酸。

Extractive Fermentation of Lactic Acid in Lactic Acid Bacteria Cultivation: A Review

2017-11-20 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02285

Microbiome：牛的上下呼吸道菌群特征

Microbiome[IF:8.496]

① 样本来自6个牧场的19头断奶皮埃蒙特牛，其中8头临床表现有呼吸疾病，并对上呼吸道（NS）和下呼吸道（TTA）菌群进行16S测序分析；② 共鉴定出29个门305个菌属（NS与TTA分别有29、21个门，289、182个属），③ 在NS与TTA中，支原体属均是占比最大的菌属（60.8%），而占比最大的菌种分别是嗜冷菌血和多杀巴斯德菌；④ α和β多样性分析都显示NS和TTA的菌群有显著性的差异；⑤ 但牧场来源和临床症状对NS/TTA菌群似乎没有影响。

Characterization of the upper and lower respiratory tract microbiota in Piedmontese calves

2017-11-21 DOI: 10.1186/s40168-017-0372-5