大连被忽视的米糠：或能预防胃肠道癌症~

发布时间：2020-07-16 来源：大连胃肠医院

被忽视的米糠：或能预防胃肠道癌症~

今天是第556期日报。

IJMS：米糠或可预防胃肠道癌症（综述）

International Journal of Molecular Sciences[IF:3.226]

① 米糠作为碾米的副产物，含有丰富的植物化学成分，包括γ-生育三烯酚、植酸、阿魏酸、γ-谷维素、β-谷甾醇、麦黄酮等，具有抗氧化作用；② 因其抗氧化特性，摄入米糠可能通过与氧化应激相关的机制预防胃肠道癌症；③ 在大鼠、小鼠模型及细胞系的研究中，米糠或米糠提取物可能通过降低NADPH氧化酶表达、减少过氧化物形成、增加谷胱甘肽-S-转移酶活性、降低肝脏中的丙二醇及蛋白质羰基水平等机制起到抗氧化作用。

Hypotheses on the Potential of Rice Bran Intake to Prevent Gastrointestinal Cancer through the Modulation of Oxidative Stress

2017-06-24 DOI: 10.3390/ijms18071352

Cell子刊：对患病的肺部进行3D菌群+代谢组分析

Cell Host and Microbe[IF:14.946]

① 开发Invesalius 3.0、Geomagic软件包等工作流程，采用CT扫描图像重建肺的3D组学数据图谱，从囊性肺纤维化（CF）患者的肺获得菌群和代谢组学数据，建立3D肺模型上的组学数据点图；② 制作全肺的菌群和代谢的图谱，直接观察到CF的主要致病菌为假单胞菌，与对照组相比，其他细菌在肺内具有空间异质性，但并未观察到假单胞菌相关毒力因子的分布；③ 无色杆菌与亚胺培南的空间分布负相关；④ 抗生素及其代谢产物在肺内的分布具有空间特异性。

Three-Dimensional Microbiome and Metabolome Cartography of a Diseased Human Lung

2017-10-19 DOI: 10.1016/j.chom.2017.10.001

COHA：HIV感染后，肠道菌群怎么变？(综述)

Current Opinion in HIV and AIDS[IF:4.050]

① HIV感染患者的肠道菌群组成与未感染者显著不同，HIV感染期间的肠道生态改变与免疫缺陷及慢性炎症的持续存在相关；② HIV感染患者的粪便菌群多样性降低与菌群易位及单核细胞活化标记物高度相关；③ 粘膜相关细菌的改变与炎症及T细胞活化显著相关；④ 抗逆转录病毒治疗（ART）可独立于HIV感染影响菌群组成，ART可能增强肠道菌群的失调；⑤ 一些研究及临床试验表明益生菌、益生元具有对炎症标记物及免疫细胞活化的潜在益处。

Altered gut microbiome composition in HIV infection: causes, effects and potential intervention

2017-10-17 DOI: 10.1097/COH.0000000000000429

JV：与特发性慢性腹泻相关的恒河猴肠道病毒组

Journal of Virology[IF:4.663]

① 选取32只健康恒河猴、31只急性腹泻恒河猴、29只特发性慢性腹泻（ICD）恒河猴，比较其肠道病毒组；② 对照组的病毒序列占0.063%，急性腹泻组占0.131%，ICD组占0.297%；③ 检测到的真核细胞病毒可分为6个病毒科，并鉴定出大量编码Rep的环状单链DNA（CRESS DNA）病毒基因组；④ 最常见的病毒为小核糖核酸病毒，占据了所有病毒序列的59-88%；⑤ 相对于健康恒河猴，某些肠道病毒基因型及CRESS DNA基因组与恒河猴的ICD相关。

Case control comparison of enteric viromes in captive rhesus macaques with acute or idiopathic chronic diarrhea

2017-06-28 DOI: 10.1128/JVI.00952-17

STE：处理后的污水中，仍有较多耐药基因存在

Science of the Total Environment[IF:4.900]

① 分析经城市污水处理厂加工后的废水中，抗生素耐药基因（ARG）的定性及定量变化情况；② 在选取的两个污水处理厂中，ARG的变化存在差异；③ 生物处理显著增加了tet并降低了ermB的相对丰度，二次沉降及混凝工艺显著降低了tet的相对丰度；④ 最终处理中，抗生素耐药细菌（ARG）及ARG对紫外杀菌产生不同响应：ARB清除效率在34-75%之间，未检测到ARG的显著减少；⑤ 经处理后的废水中ARG仍有较高水平。

Quantitative and qualitative changes in antibiotic resistance genes after passing through treatment processes in municipal wastewater treatment plants

2017-07-04 DOI: 10.1016/j.scitotenv.2017.06.250

ISME：南极海洋沉积物中的产甲烷菌

ISME Journal[IF:9.664]

① 在有机质富集的南极海洋沉积物中，分析产甲烷菌的组成与功能；② 通过从深层地下沉积环境中组装的宏基因组序列数据，获得首个甲烷丝菌属物种的基因组，鉴定出产甲烷菌的系统发育学及功能标记基因；③ 带有二糖基磷脂酰甘油头部的甘油二烷基甘油四醚是活性产甲烷菌的生物标记物；④ 鉴定出的甲烷丝菌属物种是乙酸分解型产甲烷菌；⑤ 宏基因组及脂质分析提示，奇古菌门及异养细菌与甲烷丝菌属共存，并共同增加溶解无机碳的浓度及δ(13)C数值。

Acetoclastic Methanosaeta are dominant methanogens in organic-rich Antarctic marine sediments

2017-10-17 DOI: 10.1038/ismej.2017.150

EM：氧含量如何影响致病菌空肠弯曲杆菌的毒力因子

Environmental Microbiology[IF:5.395]

① 空肠弯曲杆菌是最常见的食物来源致病菌，利用恒化培养研究氧水平对其生理的影响；② 需氧生活水平下降，与氧调节基因及电子传递链相关的转录组发生改变；③ 在低氧水平下，与宿主中定殖相关的蛋白丰度增加；④ 三羧酸循环相关酶（多肽转运蛋白CstA、PEB1天冬氨酸盐/谷氨酸盐转运蛋白、LutABC乳酸盐脱氢酶、PutA脯氨酸脱氢酶）在氧水平增加时丰度升高；⑤ 关键毒力因子对受限的可用氧、特定转运蛋白、氧水平增加时激活的分解代谢通路产生应答。

Transcriptome and proteome dynamics in chemostat culture reveal how Campylobacter jejuni modulates metabolism, stress responses and virulence factors upon changes in oxygen availability

2017-09-11 DOI: 10.1111/1462-2920.13930

FM：DNA超螺旋改变如何影响肺炎链球菌的基因转录

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① DNA超螺旋的水平及拟核结合蛋白的存在影响了细菌染色体的压缩程度，DNA拓扑异构酶及DNA旋转酶影响DNA超螺旋的维持；② 靶向DNA旋转酶A亚基及/或拓扑异构酶IV的氟喹诺酮，可局部改变DNA超螺旋，引起氧自由基增加，导致细菌生存能力降低；③ 靶向DNA旋转酶B亚基的新生霉素或拓扑异构酶I抑制剂seconeolitsine可引起DNA超螺旋的总体改变；④ 超螺旋的松弛影响了13%的基因组，超负超螺旋影响了10%的基因组。

The Transcriptome of Streptococcus pneumoniae Induced by Local and Global Changes in Supercoiling

2017-07-31 DOI: 10.3389/fmicb.2017.01447