大连羡煞动物：植物与细菌的亲密相互喂养

羡煞动物：植物与细菌的亲密相互喂养

今天是第554期日报。

TPS：植物如何通过根系分泌物喂养根部菌群？(综述)

Trends in Plant Science[IF:11.911]

① 植物的根系分泌物可由植物根尖边缘细胞、植物内生菌分泌其代谢产物并转运至植物根围，也可由植物根围菌群分泌其代谢产物并转运至植物根内；② 根系分泌物中含有糖类、磷酸糖类、氨基酸、有机酸、核苷酸、脂肪酸、无机物、次级代谢产物、激素等，分别通过不同的转运蛋白家族运输；③ 植物将糖类、有机酸、脂质传递给根部菌群，菌群将磷、氮及其它营养元素传递给植物；④ 与植物与菌群之间的营养及信号分子运输相关的转运蛋白有待进一步研究。

Feed Your Friends: Do Plant Exudates Shape the Root Microbiome?

2017-10-16  DOI: 10.1016/j.tplants.2017.09.003

Nature子刊：如何全面、客观地评估宏基因组分析方法？

Nature Methods[IF:25.062]

① 宏基因组解析的批判性评估（CAMI）旨在全面、客观地评估宏基因组分析方法，通过社会团体参与标准数据集、评估流程、性能标准的选择以及聚集的问题的设计而建立标准；② CAMI以来自近700个新测序的微生物和近600个新病毒、质粒的高度复杂真实数据集为基准；③ 基因组组装和聚类在检测个体化基因组时性能良好，但易受其它相关菌株的影响；④ 分类分析和聚类在高分类级别上表现良好，科以下水平性能下降，参数设置明显影响性能。

Critical Assessment of Metagenome Interpretationa benchmark of metagenomics software

2017-10-02  DOI: 10.1038/nmeth.4458

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