大连瘦子便便里的细菌，真能拯救胖子？ 热

瘦子便便里的细菌，真能拯救胖子？

今天是第531期日报。

Cell子刊：哪些胖子移植瘦子的粪菌会有效？

Cell Metabolism[IF:18.164]

① 纳入38名49-60岁男性，体重指数为32.5-40.4，其中26人移植瘦子的粪菌，12人移植自己的粪菌作为对照；② 尽管在移植后18周未观察到代谢变化，但在移植瘦子粪菌的6周后，胰岛素敏感性显著改善，连同菌群组成和γ-氨基丁酸等血浆代谢产物也发生变化；③ 接受移植前，受体自身的菌群多样性越低，在第6周时代谢改善越为明显；④ 这一定程度说明了肠道菌群与代谢综合征的因果关系，也提示可以通过分析菌群组成预判粪菌移植的效果。

Improvement of Insulin Sensitivity after Lean Donor Feces in Metabolic Syndrome Is Driven by Baseline Intestinal Microbiota Composition

2017-10-03  DOI: 10.1016/j.cmet.2017.09.008

NBT：处理人类粪便样本的标准方法

Nature Biotechnology[IF:41.667]

① 国际人类微生物组标准（IHMS）计划由12个国家的20余家机构发起和参与；② 其致力于在人体微生物组领域推广旨在优化数据质量和可比性的标准操作规程（SOP）；③ 针对同一份粪便样本，采用21种有代表性的DNA提取方法，并量化观察到的微生物群落组成的差异；④ 通过对不同操作流程的对比，明确DNA提取方法对宏基因组分析结果具有最大的影响；⑤ 经过慎重比较，提出一种能在不同实验室通用且经已知组成的群落做进一步基准验证的标准化DNA提取方法。

Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies

2017-10-02  DOI: 10.1038/nbt.3960

NBT：到底是什么造成菌群测序结果的差异？

Nature Biotechnology[IF:41.667]

① 微生物组质量控制（MBQC）计划致力于帮助研究者提前完善实验设计以避免偏差，并提供根据研究具体需求而定的可用方法学指南，以提高数据可重复性；② 在MBQC基线研究（MBQC-base）中，来自人类粪便、恒化器和人工群落的样本，被送到15个实验室测序并利用9种不同生信方法分析；③ 造成差异性的最主要因素是生物样本类型和来源，随后是DNA提取方法、样本处理环境和生信方法；④ 对人工群落样本的分析则揭示了提取效率和生物信息学分类的差别。

Assessment of variation in microbial community amplicon sequencing by the Microbiome Quality Control (MBQC) project consortium

2017-10-02  DOI: 10.1038/nbt.3981

Cell子刊：多形拟杆菌要在肠道活得好，荚膜多糖很关键！

Cell Host & Microbe[IF:14.946]

① 荚膜多糖（CPS）保护细菌免受宿主及环境因素的影响；② 人体肠道共生菌多形拟杆菌在体内可表达多种类型的CPS，并能够动态地转换其表达的CPS类型；③ 在多形拟杆菌中分别单一表达8种荚膜，表达CPS5的多形拟杆菌在适应性免疫反应下有最大优势；④ 相比于表达单一CPS的多形拟杆菌（除CPS5外），可在多种CPS类型中转换的多形拟杆菌更具竞争性；⑤ 抗生素处理后，只有可在多种CPS类型中转换的野生型多形拟杆菌存活，并主要表达CPS5。

A Subset of Polysaccharide Capsules in the Human Symbiont Bacteroides thetaiotaomicron Promote Increased Competitive Fitness in the Mouse Gut

2017-09-30  DOI: 10.1016/j.chom.2017.08.020

Cell子刊：隔日禁食真的能改善代谢么？

Cell Metabolism