大连环境太干净，或真的伤菌群促慢病~ 热

环境太干净，或真的伤菌群促慢病~

今天是第537期日报。

FM：环境“脏”一点，对肠道健康有好处？

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 在剖腹产、奶粉喂养和抗生素使用之外，城市“干净”环境对婴儿3岁前的肠道微生态建立或有不利影响；② 尽管土壤和人体肠道共有的微生物种类有限，但很多研究支持原始部落、农场等环境有利于建立肠道菌群多样性并预防慢性炎症性疾病；③ 环境、肠道菌群和炎症的研究正如火如荼展开，一些分子和细胞水平的免疫学机制被阐明；④ 主要挑战包括：如何量化环境中的微生物丰度和多样性，如何实现全球通力合作以深入阐述宿主-菌群-环境的相互作用。

Linking the Gut Microbial Ecosystem with the Environment: Does Gut Health Depend on Where We Live?

2017-10-06  DOI: 10.3389/fmicb.2017.01935

NC：动脉粥样硬化患者的肠道菌群

Nature Communications[IF:12.124]

① 对218名动脉粥样硬化性心血管疾病（ACVD）患者及187名健康对照的粪便菌群进行对比分析；② 相比于健康人，ACVD患者的肠道菌群中肠杆菌科、链球菌属的丰度显著增加，某些与心血管健康相关的具有代谢或转运功能的分子增加；③ 上述细菌的丰度增加明显抑制了有益菌群（如柔嫩梭菌），链球菌属的丰度与血压呈正相关，肠杆菌科的丰度与心肌指标呈正相关；④ 基于47种肠道细菌构建了中国动脉粥样硬化风险预测模型，AUC可达86%。

The gut microbiome in atherosclerotic cardiovascular disease

2017-10-10  DOI: 10.1038/s41467-017-00900-1

Nature：肠道菌群的丰度越低，越可能肥胖？

Nature[IF:40.137]

① 对123名非肥胖和169名肥胖的丹麦人进行肠道菌群分析；② 两个群体的肠道菌群基因数量存在差异，因此肠道菌群丰度也不同，且含不同比例的已知和未知的细菌种属；③ 相比高菌群丰度个体，低菌群丰度个体整体肥胖比例更高，胰岛素抵抗和血脂异常更为明显，具有更显著的炎症表型；④ 低菌群丰度群体中的肥胖者的体重随时间增加得更多；⑤ 即便是在瘦和胖个体之间进行比较，仅有少数细菌种属可用于区分高/低菌群丰度个体。

Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers

2013-08-29  DOI: 10.1038/nature12506

Science：移植胖人粪菌的小鼠，长得更胖！

Science[IF:37.205]

① 将成年女性双胞胎（一瘦一胖）的粪便菌群移植给无菌小鼠，小鼠喂食低脂饮食，饮食中含有不同水平的饱和脂肪酸；② 移植了胖子的粪便菌群的小鼠，体重及脂肪质量增加，且表现出肥胖相关代谢表型；③ 对于同一对双胞胎，将移植了瘦子菌群的小鼠与移植了相应的胖子菌群的小鼠同窝饲养，可抑制移植了胖子菌群的小鼠的体重增加及肥胖相关代谢表型；④ 对肥胖的抑制与瘦子菌群中的拟杆菌门里的特殊成员相关。

Gut microbiota from twins discordant for obesity modulate metabolism in mice

2013-09-06  DOI: 10.1126/science.1241214

Science：病原菌在肠道的定殖，受毒力基因表达调控

Science[IF:37.205]

① 无菌小鼠不能根除鼠柠檬酸杆菌，后者是一种人体感染模型；② 在感染早期，病原菌毒力基因的表达对其在正常小鼠中的生长是必需的，而在无菌小鼠中非必需；③ 感染后期毒力基因表达下调，导致病原菌重新定位到肠内，之后在生存竞争中被共生菌群淘汰；④ 共生菌群在与鼠柠檬酸杆菌竞争中胜出的能力，部分是由于致病菌与共生体均可在结构相似的碳水化合物上生长；⑤ 病原菌定殖由细菌毒力和与代谢相关共生菌群的竞争控制。

Regulated virulence controls the ability of a pathogen to compete with the gut microbiota

2012-05-10  DOI: 10.1126/science.1222195

Nature：菌群产生丁酸盐，促T细胞分化并缓解结肠炎

Nature[IF:40.137]

① 梭状芽胞杆菌（Clostridia）可诱导结肠调节性T细胞（Treg），但之前机制未知；② 研究者鉴定出大肠中的菌群发酵产物丁酸盐，其可在小鼠中促进Treg分化；③ 结肠腔内的丁酸等短链脂肪酸的浓度与结肠中的Treg细胞数量呈正相关；④ 丁酸盐可在体外及体内诱导Treg的分化，并缓解小鼠的结肠炎发展；⑤ 在Treg极化条件下，用丁酸盐处理naive T细胞，可增加Foxp3基因位点启动子及保守非编码区域的组蛋白H3乙酰化。

Commensal microbe-derived butyrate induces the differentiation of colonic regulatory T cells

2013-11-13  DOI: 10.1038/nature12721

Nature：控制肠道拟杆菌定殖的关键基因

Nature[IF:40.137]

① 利用拟杆菌属研究共生细菌如何稳定定殖于胃肠道中；② 无菌小鼠单独定殖单一拟杆菌属物种后，对相同的物种而非不同物种产生定殖抗性；③ 通过体内遗传筛选发现了一种独特的多糖利用位点ccf，在肠道拟杆菌属物种中保守；④ 敲除模式共生菌脆弱拟杆菌中的ccf基因，可导致小鼠的共生细菌定殖缺陷，并减少菌群的水平传播；⑤ 在肠道定殖期间，结肠表面的脆弱拟杆菌的ccf基因表达上调，脆弱拟杆菌穿过结肠粘膜并进入隐窝的过程也依赖于ccf基因。

Bacterial colonization factors control specificity and stability of the gut microbiota

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