大连小爆发：3天，2强刊，8篇纯

发布时间：2020-07-26 来源：大连胃肠医院

小爆发：3天，2强刊，8篇纯干货！

今天是第453期日报。

Microbiome：衰老的肠道菌群长啥样？（综述）

Microbiome[IF:8.496]

① 慢性炎症是衰老的特征，老年人肠道菌群的组成及稳定性改变，多样性降低；② 变形菌门（含有许多条件致病菌成员）富集，拟杆菌属及梭菌属增加，产生短链脂肪酸的基因减少，糖分解能力降低，蛋白水解功能增强；③ 上述变化与IL-6、IL-8、CRP、TNF-α等炎症因子/标记物的血浆浓度升高相关，可能与认知衰退、身体虚弱相关；④ 通过使营养吸收能力退化、免疫系统慢性活化、肠道上皮屏障损伤起到致病性作用；⑤ 饮食调节、锻炼、益生菌等是潜在疗法。

(Dis)Trust your gut: the gut microbiome in age-related inflammation, health, and disease

2017-07-14 DOI: 10.1186/s40168-017-0296-0

Microbiome：重新定义“卫生”（综述）

Microbiome[IF:8.496]

① 在手部等皮肤表面，栖息着种类和数量众多的微生物，它们组成了一个生态系统，其中病原体只占极小比例；② 传统的“卫生”定义是指简单粗暴地清除皮肤上的细菌，而共生微生物相关研究提示，正确的“卫生”定义应该是减少致病菌的扩散或传播，从而降低疾病发生率；③ 清晰而一致的“卫生”定义，将避免科学文献中的概念混淆，对手部卫生、皮肤菌群、洗手、手部烘干等研究提供准确指导标准；④ 这也有助于提供更准确实用的卫生建议和监管标准。

Cleanliness in context: reconciling hygiene with a modern microbial perspective

2017-07-14 DOI: 10.1186/s40168-017-0294-2

TM：癌症治后易感染，或须重构强菌群！(综述)

Trends in Microbiology[IF:11.020]

① 接受癌症治疗的患者具有高感染性并发症风险，因上皮屏障破坏而导致菌群迁移至无菌部位；② 多样性的菌群促进对致病菌的定殖抗性，癌症及治疗导致的免疫失调及黏膜炎可造成致病菌易位；③ 粘膜免疫系统的维持依赖于共生菌群的产物（LPS、鞭毛蛋白等）被TLR及NOD受体识别，菌群产生的丁酸盐、多糖A等对免疫系统起调节作用；④ 案例报道提示粪菌移植或可用于治疗癌症患者的感染，临床试验结果表明益生菌/益生元对癌症患者感染的疗效仍需验证。

Impact of the Microbiota on Bacterial Infections during Cancer Treatment

2017-07-17 DOI: 10.1016/j.tim.2017.06.006

TM：基因组冲浪，驱动微生物基因组多样性（综述）

Trends in Microbiology[IF:11.020]

① 种群大小改变可通过基因冲浪（gene surfing）等机制，造成基因组多样性的非适应性变化；② 基因冲浪可解释更新世时期，动植物在冰河期后的范围扩张造成的基因组多样性变化的模式；③ 利用链霉菌属作为模式生物，发现其基因组多样性模式与基因组冲浪模式一致；④ 基因组冲浪提供了一种解释基因组多样性的中性机制；⑤ 对于能够进行水平基因转移（HGT）的微生物，其种群范围扩张可导致基因组冲浪，造成通过HGT获得的基因的频率在泛基因组中增加。

Genome Surfing As Driver of Microbial Genomic Diversity

2017-03-07 DOI: 10.1016/j.tim.2017.02.006

TM：真核微生物组对珊瑚礁的重大意义（综述）

Trends in Microbiology[IF:11.020]

① 珊瑚礁为真核微生物提供多种栖息地，包括沙土、海草、肉质藻类、珊瑚、珊瑚礁泻湖、珊瑚礁顶、珊瑚礁坡等；② 珊瑚相关真菌对珊瑚礁的生活史有重要影响，在珊瑚礁健康状态下降时加速增殖；③ 石内珊瑚真菌可为宿主提供对环境压力的抗性，珊瑚相关真菌也有固氮作用、减少紫外损伤等对珊瑚宿主的益生作用；④ 珊瑚礁石内微藻可在光照状态下大量繁殖，造成珊瑚白化，并形成致密的微生物群落；⑤ 珊瑚相关原生生物可能造成珊瑚礁的骨骼侵蚀带疾病。

The Other Microeukaryotes of the Coral Reef Microbiome

2017-07-15 DOI: 10.1016/j.tim.2017.06.007

Microbiome：预测菌群功能，基因组规模代谢模型大放异彩！(综述)

Microbiome[IF:8.496]

① 细菌难以培养、对表型理解较少、物种间互作的相关知识有限等因素，限制了对菌群失调与疾病之间因果关系的研究；② 基因组规模的代谢模型（GEM）用途广泛，尤其是在预测基本/合成/组合培养基、潜在功能及表型、物种间互作等三方面；③ 这可同时促进对个别物种及菌群整体的理解，可用于设计最精简的培养基，更好理解菌群表型及其对宿主免疫系统的影响，以及饮食干预如何改善人体健康；④ 这终将促进靶向菌群以重建稳态并促进宿主-微生物共生。

More than just a gut feeling: constraint-based genome-scale metabolic models for predicting functions of human intestinal microbes

2017-07-14 DOI: 10.1186/s40168-017-0299-x

Microbiome：宏蛋白质组学揭示健康人肠道菌群的功能

Microbiome[IF:8.496]

① 利用shotgun宏蛋白组学方法分析15名健康人的肠道菌群，旨在明确健康人群的肠道菌群的功能；② 相比于个体差异性较小的宏基因组学特征，肠道菌群的宏蛋白组表现出较高的可塑性；③ 不同分类菌群，具有特异性的功能活动及代谢任务，如一些菌群成员被明确参与多糖降解、多糖转运、糖酵解、短链脂肪酸生成等碳水化合物代谢进程；④ 厚壁菌门（主要是Faecalibacterium）促进的丁酸盐合成有着最高的表达率及代谢活性，个体间差异最小。

Potential and active functions in the gut microbiota of a healthy human cohort

2017-07-14 DOI: 10.1186/s40168-017-0293-3

Microbiome：配合饲料或增加仔猪组胺水平及过敏风险！

Microbiome[IF:8.496]

① 将新生猪在产后的2-21天内分为3组：母猪喂养、喂食基于大豆或乳制品的配合饲料；② 相比于母猪喂养，配合饲料显著改变了结肠菌群，降低菌群多样性，链球菌属等增加；③ 喂食乳制品的仔猪Akk菌、肠球菌属等增加，喂食大豆的仔猪瘤胃球菌数、梭菌属等增加；④ 配合饲料不影响肠道形态，显著增加末端结肠BMP4、CCL11、CCL21等细胞因子的mRNA表达，降低肠嗜铬细胞细胞数量及5羟色胺，增加色胺水平；⑤ 配合饲料可能增加仔猪的组胺水平及过敏风险。

Formula diet driven microbiota shifts tryptophan metabolism from serotonin to tryptamine in neonatal porcine colon?

2017-07-14 DOI: 10.1186/s40168-017-0297-z