大连Nature：人肠道菌群的新基因组蓝图热心

发布时间：2020-05-28 来源：大连胃肠医院

Nature：人肠道菌群的新基因组蓝图

今天是第1012期日报。

Nature：发掘未知的肠道细菌

Nature[IF:41.577]

① 从11850个人类肠道菌群基因组中，鉴别出1952种潜在的、未被培养的肠道细菌；② 这些潜在细菌，将已知肠道细菌的总种类数量增加了281% ；③ 新发现的细菌在欧美人群中并不普遍，但却极大地丰富了对非洲、南美人群肠道细菌种类的了解，对已知细菌种类的增幅超过200%；④ 潜在细菌的基因组上存在上百种新的生物合成基因簇，可能在宿主中发挥特殊作用；⑤ 潜在细菌的基因组的发现，显著增加了对肠道菌群种类和功能的了解。

A new genomic blueprint of the human gut microbiota
02-11, doi: 10.1038/s41586-019-0965-1

【主编评语】解读肠道菌群结构存在的宿主差异有助于阐释菌群对宿主健康的具体影响。Nature近期发表研究，鉴别出了1925种潜在肠道细菌，极大地丰富了已知肠道菌群种类和功能，尤其丰富了非洲和拉美地区人群的肠道菌群信息。该研究对详细阐释肠道菌群种类和功能具有参考价值。（@小肠）

Nature子刊：分析细菌重组率的新方法

Nature Methods[IF:26.919]

① 新开发的mcorr分析平台，可以利用全基因组数据和宏基因组鸟枪法测序数据，推断细菌中同源重组参数；② mcorr可分析实验室细菌重组，还可用于推断细菌的全球分布和重组情况，验证了幽门螺杆菌分布具有区域性；③ mcorr可利用宏基因组数据，测定婴儿肠道中多重耐药大肠杆菌 ST131的重组情况；④ 利用细菌DNA样品，mcorr可分析古代人体细菌的重组参数；⑤ mcorr可使用未组装的原始数据分析细菌重组情况，通用于微生物生态学、进化和流行病学领域。

Inferring bacterial recombination rates from large-scale sequencing datasets
01-21, doi: 10.1038/s41592-018-0293-7

【主编评语】细菌重组与进化，与抗生素耐药性和致病因素的获得及传播有关。本研究开发了一种新的数据分析平台，可利用全基因组数据和宏基因组鸟枪法测序数据，分析细菌重组情况，适用微生物生态学、进化和流行病学领域，值得参考。（@小肠）

Cell子刊：抑制mTORC1活化肝癌精准医疗新方向

Cell Metabolism[IF:20.565]

① 在β-连环蛋白突变引起的肝细胞癌小鼠模型中，谷氨酰氨合成酶（GS）及活化的mTORC1表达增加，且肝脏中谷氨酸盐水平升高；② 破坏β-连环蛋白信号通路或GS的活性，可抑制p-mTOR-S2448（mTORC1活化的标志）表达；③ 在缺失β-连环蛋白的肝脏中表达β-连环蛋白，可促进p-mTOR-S2448的表达；④ 在β-连环蛋白突变的临床前肝细胞癌小鼠模型中，单独抑制mTORC1或同时抑制Met，可通过抑制癌细胞的增殖与存活，从而起到很好的疗效。

Inhibiting Glutamine-Dependent mTORC1 Activation Ameliorates Liver Cancers Driven by β-Catenin Mutations
01-31, doi: 10.1016/j.cmet.2019.01.002

【主编评语】β-连环蛋白突变引起的肝癌尚无有效的疗法。来自Cell Metabolism上发表的一项最新研究，发现在β-连环蛋白突变引起的肝细胞癌小鼠模型中，抑制mTORC1信号通路，可显著抑制肿瘤增殖并提高小鼠存活率。（@沈志勋）