大连Nature：幼年关键期肠道免疫如何塑造菌

Nature：幼年关键期肠道免疫如何塑造菌群？

今天是第831期日报。

Nature：幼年期先天免疫对菌群塑造的长期影响

Nature[IF:41.577]

① 肠上皮细胞表达的先天免疫受体中，鞭毛蛋白受体Toll样受体5（TLR5）在小鼠出生头2周内高度表达，之后迅速降低，提示TLR5在这一时期可能有重要作用；② TLR5与其衔接蛋白MYD88以及下游的抗细菌c型外源凝集素REG3γ，可选择性的抑制鞭毛细菌在新生小鼠肠道内定殖，促进非鞭毛细菌定殖；③ 新生儿期是TLR5塑造小鼠肠道菌群的关键时期，TLR5的早期高表达对菌群组成的影响持续至成年后；④ 生命早期因素塑造肠道菌群，对菌群组成有长期作用。

Neonatal selection by Toll-like receptor 5 influences long-term gut microbiota composition

08-08  DOI: 10.1038/s41586-018-0395-5

Nature子刊：细菌的竞争关系为抗菌素研发提供灵感

Nature Medicine[IF:32.621]

① 细菌间竞争机制以及益生菌、有益菌对致病菌的抵御作用，有助于开发窄谱新型抗菌药物；② 干扰和剥削是典型的细菌竞争机制，干扰机制包括分泌特殊代谢产物、细菌相互接触或干扰群体感应，剥削机制包括竞争能源物质和金属；③ 益生菌和有益菌具有分泌抗菌代谢产物、转化宿主物质增加抗菌性、竞争铁和能源物质以及依赖于细胞接触的杀伤等特异性抑菌机制；④ 研究细菌定植、菌群剧烈变化下的细菌代谢产物，并建立有效动物模型有助于药物研发。

Learning from bacterial competition in the host to develop antimicrobials

08-06  DOI: 10.1038/s41591-018-0145-0

Nature子刊：甄别试剂中的菌群污染

Nature Microbiology[IF:14.174]

① 试剂菌群常由已知的水源/土源微生物构成，对生物量低的样品会造成显著影响；② 将菌群测序结果与环境因素、可培养微生物信息做比较，可判断是否存在试剂菌群污染；③ 实验设计需要考虑批次效应，可通过样品间非参数化相关性分析、热图分析并参考原始样品DNA质量来判断试剂污染情况；④ 利用寡核苷酸配型技术进行菌株水平的分析，有助于分辨试剂污染；⑤ 设置多重负对照和有效正对照，以及用多种处理处理同一样品，有助于分辨试剂污染。

Recognizing the reagent microbiome

07-25  DOI: 10.1038/s41564-018-0202-y

脂肪酸类型影响肥胖

Microbiome[IF:9.133]

① 与棕榈油相比，猪油配合胆汁酸的饮食增加了小鼠的脂肪量，伴随糖耐量受损、空腹胰岛素水平降低、内分泌细胞减少、脂肪肝以及肝甘油三酯、胆甾醇酯和单不饱和