大连抗生素如何给肠道菌群留下长期的“疤

抗生素如何给肠道菌群留下长期的“疤痕”？

今天是第815期日报。

Cell子刊：严紧反应或导致抗生素的长期影响

Trends in Microbiology[IF:11.776]

① 抗生素对肠道菌群的长期影响尚不明确；② 各种外界压力（包括抗生素筛选压力）引发由信号素(p)ppGpp介导的细菌严紧反应（SR），优先保证细菌存活的同时会导致抗生素耐药性的产生；③ SR信号系统广泛分布于人类肠道菌群中且类型丰富，放映出不同细菌中SR信号和调控的多样性和精密性；④ SR引起的抗生素耐药性会改变菌群的结构和功能，在肠道菌群形成期以及黏膜相关的菌群平衡期都是有害的，并可能对宿主健康产生长期负面影响。

Antibiotic Scars Left on the Gut Microbiota from the Stringent Response

07-16  DOI: 10.1016/j.tim.2018.06.003

Nature子刊：欧洲九国养殖猪和鸡的抗生素耐药组特征

Nature Microbiology[IF:14.174]

① 分析欧洲9个国家181个养猪场和178个养鸡场的动物粪便中的获得性耐药基因池（耐药组）；② 猪和鸡的耐药组在丰度和组成上存在很大差异，且在国与国之间有显著差别；③ 猪的抗生素耐药基因载荷更高，而鸡的耐药组多样性更大；④ 鉴定出mcr-1和optrA等若干新发现的关键抗生素耐药基因，其丰度在宿主物种和国家间存在差异；⑤ 总获得性抗生素耐药水平与国家特异的牲畜抗生素使用情况相关，但耐药基因功能与总体用药的关联性不强。

Abundance and diversity of the faecal resistome in slaughter pigs and broilers in nine European countries

07-23  DOI: 10.1038/s41564-018-0192-9

前列腺癌患者的肠道菌群代谢功能异常

European Urology[IF:17.581]

① 64例前列腺癌患者和41例对照的直肠拭子样本进行前瞻性菌群检测；② 总菌群组成与癌症/非癌症状态显著相关，拟杆菌属和链球菌属的菌种在癌症患者中富集，但癌症和非癌症菌群谱之间有显著重叠；③ 癌症患者中富含与碳水化合物代谢途径相关的细菌，而缺乏产生叶酸等B族维生素和精氨酸代谢途径相关的细菌；④ 基于10个异常代谢通路的菌群分数，或能作为额外的前列腺癌风险因素（AUC=0.64）；⑤ 菌群可能对前列腺癌有微妙影响，但或许是患者特异的。

Metabolic Biosynthesis Pathways Identified from Fecal Microbiome Associated with Prostate Cancer

07-11  DOI: 10.1016/j.eururo.2018.06.033

肠道菌群的差异可能影响疾病小鼠模型的表型

Microbiome[IF:9.133]

① 通过在体内表达促甲状腺素受体，两个实验室分别独立诱导产生了格雷夫斯眼病小鼠模型；② 但两个小鼠模型存在一些显著区别，例如是否表现出甲状腺功能亢进；③ 发现这两种小鼠模型的肠道菌群在α多样性及β多样性上均有显著差异；④ 未表现出甲状腺功能亢进的小鼠模型的乳杆菌属丰度更高，而表型出甲状腺功能亢进的小鼠模型的拟杆菌属及双歧杆菌属丰度更高；⑤ Intestinimonas菌属的丰度与促甲状腺素受体自身抗体呈负相关。

Gut microbiota in experimental murine model of Graves’ orbitopathy established in different environments may modulate clinical presentation of disease

05-25  DOI: 10.1186/s40168-018-0478-4

影响非人灵长类动物肠道菌群的因素

ISME Journal[IF:9.52]

① 选取生活在同一区域的9种非人灵长类动物物种（包括黑猩猩、3种疣猴、5种猕猴），分析肠道菌群组成；② 动物个体拥有独特且稳定的菌群，菌群组成受到宿主物种、社会群体、父母的影响，但不受到同一社会群体间成员社会关系的影响；③ 与所有猴子的菌群表现出系统发育上的聚类不同，黑猩猩的菌群表现出了系统发育上的不平均分布，可能与黑猩猩对疣猴的捕食有关。

Factors influencing bacterial microbiome composition in a wild non-human primate community in Ta? National Park, C?te d'Ivoire

06-28  DOI: 10.1038/s41396-018-0166-1

复旦大学上海医学院：大肠癌中的具核梭杆菌（综述）

Journal of Cancer[IF:3.249]

① 近期研究发现，具核梭杆菌（口腔中的条件共生厌氧菌）与结直肠癌相关；② 结直肠癌患者的肿瘤组织及粪便中，具核梭杆菌的丰度显著升高；③ 具核梭杆菌在结直肠癌组织中的富集或可作为较差预后的生物标志物，结合粪便免疫化学检测与粪便具核梭杆菌定量，可提升结直肠癌的诊断；④ 具核梭杆菌促进结直肠癌发生的机制尚未明确，其表达的两个外膜蛋白Fap2及FadA或促进结直肠癌的发生；⑤ 具核梭杆菌引起的炎症反应也可能促进结直肠癌发生发展。

Association between Fusobacterium nucleatum and colorectal cancer: Progress and future directions

05-18  DOI: 10.7150/jca.24048

术前使用合生制剂或对大肠癌患者有益

Nutrition[IF:3.734]

① 一项前瞻性、随机、双盲、安慰剂对照研究中，73例结直肠癌患者随机分为两组，术前连续7天每天两次服用合生制剂（Simbioflora ?）或安慰剂（麦芽糖糊精）；② 服用合生制剂显著降低了患者的IL-6和C反应蛋白等炎症指标，安慰剂无此作用；③ 合生制剂组的术后30天内感染性并发症发生率（2.8%）、平均抗生素使用时间（1.42±0.5天）、平均住院时间（3.0±1.0天）和死亡事件（0起）显著少于安慰剂组（18.9%，3.74±4.3天，4.0±18天，3起）。

Impact of the preoperative use of synbiotics in colorectal cancer patients: a prospective, randomized, double-blind, placebo-controlled study

07-11  DOI: 10.1016/j.nut.2018.06.004