大连能治病的天然产物,也许就在我们的共生
能治病的天然产物,也许就在我们的共生菌群中
今天是第783期日报。
Cell子刊:寻找人体菌群中的活性天然产物(综述)
Cell Host and Microbe[IF:14.946]
① 通过功能宏基因组筛选,在人体菌群中发现了GPCR激动剂Commendamide;② 基于功能宏基因组的信息指导生物合成基因的设计,获得了与Commendamide化学性质相似的产物N-酰基酰胺;③ 利用基于宏基因组序列的生物信息学分析,也得到了新型硫肽抗生素、Humimycins、二肽醛、吲哚丙烯酸等类型小分子及其功能;④ 通过代谢组学方法分析菌群的化学图谱,是生物学方法的有益补充,不仅可以发现新型天然产物,也能鉴定基于已知小分子的生物假说。
Accessing Bioactive Natural Products from the Human Microbiome
06-13 DOI: 10.1016/j.chom.2018.05.013
Nature子刊:研究菌群功能的新方法
Nature Microbiology[IF:N/A]
① 菌群生态功能可分为“广泛”和“狭窄”两种类型,前者包括呼吸速率、细胞生产和代谢潜能,后者包括木糖苷酶、几丁质酶、葡糖苷酶和磷酸酶活性;② 相关性分析显示,菌群(尤其是高丰度菌群)丰度与“广泛”功能的相关性强,与“狭窄”功能的相关性较弱;③ 菌群功能互作分析显示,高丰度细菌种系间的负相互作用、低丰度细菌种系间的正相互作用,分别在决定“广泛”和“狭窄”功能中起关键作用;④ 菌群功能互作关系可被群落混合实验证实。
Abundance determines the functional role of bacterial phylotypes in complex communities
06-18 DOI: 10.1038/s41564-018-0180-0
如何建立慢性鼻窦炎的体外模型
Microbiome[IF:8.496]
① 慢性鼻窦炎(CRS)的病因尚不明确,风险因素包括宿主免疫系统、鼻腔菌群紊乱和环境刺激;② CRS病理及防治方法的研究需要可模拟相关组织和菌群的体外模型;③ 现有模型采用了简化的设计理念,仅能进行纯宿主细胞研究、少数呼吸道菌株间的竞争性分析和简单的宿主-致病菌共培养;④ 非简化的CRS体外模型是研究致病菌定植和炎症反应的前提;⑤ 长期模型分析菌群的结构和功能变化,有助于探索是否可以通过菌群干预缓解慢性炎症、恢复菌群稳态。
Modelling upper respiratory tract diseases: getting grips on host-microbe interactions in chronic rhinosinusitis using in vitro technologies
04-24 DOI: 10.1186/s40168-018-0462-z
鼠李糖乳杆菌GG预防小鼠的过敏性哮喘
Allergy: European Journal of Allergy and Clinical Immunology[IF:7.361]
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