大连肠道免疫vs菌群+食物：过敏还是耐受，这

发布时间：2020-07-03 来源：大连胃肠医院

肠道免疫vs菌群+食物：过敏还是耐受，这是一个问题

今天是第686期日报。

Nature Reviews：肠道如何对菌群和食物蛋白产生免疫耐受

Nature Reviews Immunology[IF:39.932]

① 免疫系统中的效应性T细胞可识别菌群，接受Treg细胞的监视，对菌群抗原的识别依赖于树突细胞（DC）；② 游走性DC创造耐受环境，DC的游走和口服耐受性的诱导依赖于CCR7；③ 对于食物蛋白等可溶性抗原，诱导免疫耐受需要表达CD103和表达视黄酸的特定DC群；④ 视黄酸驱动T细胞表达肠道归巢标志物，诱导分化为Foxp3+Treg细胞，重新循环至粘膜，通过产生IL-10和/或TGFβ而维持免疫耐受；⑤ 粘膜巨噬细胞通过产生IL-10而协助维持局部Treg细胞的生存。

To respond or not to respond - a personal perspective of intestinal tolerance

02-28 DOI: 10.1038/s41577-018-0002-x

Nature：感受张力的离子通道驱动肠道干细胞分化

Nature[IF:40.137]

① 机械应力激活离子通道Piezo，调控果蝇成虫的中肠干细胞分化；② 鉴定出一种特异表达Piezo的肠内分泌前体细胞，Piezo活性缺失可减少成虫中肠的肠内分泌细胞生成；③ 所有干细胞中异位表达Piezo，可驱动细胞增殖和向肠内分泌细胞的分化；④ Piezo通过钙离子信号行使功能，操控胞浆钙离子水平可恢复Piezo突变和过表达导致的表型，胞浆内钙离子增加所致表型类似Piezo过表达；⑤ 钙离子信号通过不同通路促进干细胞增殖和分化。

Mechanical regulation of stem-cell differentiation by the stretch-activated Piezo channel

03-01 DOI: 10.1038/nature25744

SCR：人胚干细胞来源的胰腺内胚层用于糖尿病治疗

Stem Cell Reports[IF:7.338]

① 干细胞可作为潜在的移植物，替代糖尿病患者体内缺失的功能性β细胞群（FBM）；② 人胚胎干细胞来源的胰腺内胚层（hES-PE）作为移植物，可产生β细胞并缓解小鼠的高血糖；③ 将hES-PE封装至特殊装置内移植入小鼠体内，可实现长达50周的代谢控制；④ hES-PE在小鼠体内可形成足够的β细胞数量，且内分泌纯度超过50%；⑤ FBM在灌流期间的分泌应答、典型分泌囊泡的内容物、核内NKX6.1-PDX1-MAFA的共表达，显示其与人胰腺β细胞有相似的功能状态。

Functional Beta Cell Mass from Device-Encapsulated hESC-Derived Pancreatic Endoderm Achieving Metabolic Control

03-01 DOI: 10.1016/j.stemcr.2018.01.040

Immunity：静息状态的干细胞可逃避免疫监视

Immunity[IF:22.845]

① 活化的T细胞可清除循环上皮干细胞，包括Lgr5+小肠干细胞以及卵巢和乳腺干细胞，而毛囊和肌肉的静息干细胞则耐受T细胞的杀伤作用；② 免疫逃逸是静息干细胞的自主特性，是由抗原呈递元件（包括MHC-I和TAP蛋白）的系统性下调导致的，由反式激活因子NLRC5介导；③ 干细胞静息、抗原提呈、免疫逃逸之间存在密切关联；④ 肿瘤起始细胞可来源于干细胞，因此这项研究或可解释为什么最早期的肿瘤细胞可逃逸免疫监视。

Quiescent Tissue Stem Cells Evade Immune Surveillance

02-20 DOI: 10.1016/j.immuni.2018.02.001

Microbiome：去除宿主DNA的新方法改善宏基因组测序

Microbiome[IF:8.496]

① 开发一种基于渗透裂解及叠氮碘化丙锭处理的新型化学方法（lyPMA），以在唾液菌群样本中去除宿主DNA；② 评估处理后的样本在鸟枪法宏基因组测序中得到的人体基因组序列百分比，与另外3个商业化的宿主DNA去除试剂盒做对比；③ 在所有方法中，lyPMA是最有效的去除宿主DNA序列的方法，与未处理样本相比，处理后的样本中仅包含8.53%的宿主序列，未处理样本的百分比为89.29%；④ 另外，lyPMA方法处理后的样本中，分类学上的偏差最低。

Improving saliva shotgun metagenomics by chemical host DNA depletion

02-27 DOI: 10.1186/s40168-018-0426-3

JAMA子刊：孕期用抗癫痫药，补充叶酸可减少后代自闭症

JAMA Neurology[IF:10.029]

① 纳入超过10万名孕妇，分析孕期补充叶酸是否影响出生前抗癫痫药物暴露的后代的自闭症风险；② 在所有335名出生前抗癫痫药物暴露的后代儿童中，母亲孕期未补充叶酸的儿童在18及36个月时，自闭症风险显著高于母亲孕期补充叶酸的儿童；③ 在未患癫痫的母亲中，孕期补充叶酸的后代儿童的自闭症风险也显著降低；④ 在患癫痫但未接受抗癫痫药物治疗的母亲中，孕期补充叶酸对后代的自闭症风险无显著影响；⑤ 建议服用抗癫痫药物的孕妇在孕期补充叶酸。

Association of Folic Acid Supplementation During Pregnancy With the Risk of Autistic Traits in Children Exposed to Antiepileptic Drugs In Utero

02-01 DOI: 10.1001/jamaneurol.2017.3897

Nature子刊：奶牛瘤胃菌群中的913个细菌/古菌基因组

Nature Communications[IF:12.124]

① 选取43头苏格兰奶牛，对瘤胃菌群进行宏基因组测序；② 从800G的瘤胃宏基因组测序数据中，利用宏基因组分箱及基于Hi-C的proximity-guided拼接法，拼接出913个细菌及古菌基因组；③ 这些基因组中包含了超过69000个与碳水化合物代谢相关的蛋白，其中90%以上不存在于现有的公共数据库中；④ 913个基因组可将公共瘤胃数据库中的数据量扩大5倍，显著提升了瘤胃菌群基因组的覆盖范围。

Assembly of 913 microbial genomes from metagenomic sequencing of the cow rumen

02-28 DOI: 10.1038/s41467-018-03317-6

COB：计算代谢组学在代谢研究中的应用（综述）

Current Opinion in Biotechnology[IF:9.294]

① 基于质谱法的非目标代谢组学推动了新陈代谢中新代谢物的发现，并进一步推动了代谢物生理功能和生物结构的新发现；② 目前主要运用化学信息学平台的“计算性质量碎片”技术探索代谢物数据和存储库中的未知结构；③ 代谢物组被分为已知结构－已知质谱、已知结构－未知质谱、未知结构－已知质谱和未知结构－未知质谱；④ 代谢物分类、建立代谢组学数据和存储库及搜索基因组水平的信息等方法可注解难度较大的后三种代谢组，已有相关“流程”。

Advances in computational metabolomics and databases deepen the understanding of metabolisms

01-29 DOI: 10.1016/j.copbio.2018.01.008