大连狼狈为奸:大肠癌的细菌帮凶~ 热心肠
狼狈为奸:大肠癌的细菌帮凶~
今天是第582期日报。
Science:具核梭杆菌随大肠癌细胞一起转移!
Science[IF:37.205]
① 具核梭杆菌是结直肠癌组织中最常见的细菌物种;② 在结直肠癌远端转移后,人结直肠癌组织中的梭杆菌属及其它相关菌群(包括拟杆菌属、月形单胞菌属、普氏菌属)也随着肿瘤转移,提示原发肿瘤与转移肿瘤间的菌群稳定性;③ 原位杂交分析揭示,梭杆菌属主要与转移病灶中的肿瘤细胞相关;④ 移植了人原发性结直肠腺癌的小鼠,在连续传代中保留了梭杆菌属及其相关菌群;⑤ 甲硝唑处理结直肠癌小鼠后可减少梭杆菌属负载、癌细胞增殖及总体肿瘤生长。
Analysis of Fusobacterium persistence and antibiotic response in colorectal cancer
2017-11-23 DOI: 10.1126/science.aal5240
Cell:具核梭杆菌帮助大肠癌细胞抵抗药物的机制
Cell[IF:30.410]
① 在化疗后复发的大肠癌患者的癌组织中,发现具核梭杆菌的丰度占优,并与病人的临床病理特征相关;② 通过生物信息学和功能分析发现具核梭杆菌促进针对化疗的大肠癌耐药;③ 相关机制是:具核梭杆菌靶向TLR4、MYD88先天免疫信号和特定的微小RNA,激活自噬通路并改变大肠癌的化疗响应;④ 未来可通过检测和靶向具核梭杆菌及相关信号通路,对大肠癌的临床管理产生重要价值,并可能改善大肠癌患者的预后。
Fusobacterium nucleatum Promotes Chemoresistance to Colorectal Cancer by Modulating Autophagy
2017-07-27 DOI: 10.1016/j.cell.2017.07.008
Gastroenterology:具核梭杆菌促进大肠癌的信号通路
Gastroenterology[IF:18.392]
① 具核梭杆菌可增加结肠直肠癌(CRC)细胞系的增殖及侵袭能力;② 感染了具核梭杆菌的CRC细胞系可更快在小鼠体内形成更大的肿瘤;③ 灌服了具核梭杆菌的小鼠发展出更多的结肠直肠肿瘤,且生存时间更短;④ IL-17F、IL-21、IL-22及MIP3A等炎症因子在感染了具核梭杆菌的小鼠的血清中显著升高;⑤ 感染了具核梭杆菌的小鼠体内的microRNA-21水平上升了超过4倍;⑥ 具核梭杆菌激活了TLR4通路,通过MYD88使NFκB活化。
Fusobacterium nucleatum Increases Proliferation of Colorectal Cancer Cells and Tumor Development in Mice by Activating TLR4 Signaling to NFκB, Upregulating Expression of microRNA-21
2016-11-19 DOI: 10.1053/j.gastro.2016.11.018
Cell子刊:让具核梭杆菌与癌细胞“抱团”的分子连接
Cell Host and Microbe[IF:14.946]
① 具核梭杆菌是口腔菌群的关键成员,它很少在健康肠道定殖,而在结直肠癌(CRC)中存在并促进肿瘤生成;② 人类CRC、转移瘤和临床前CRC模型均高表达Gal-GalNAc;③ Fap2是梭杆菌中能与Gal-GalNAc结合的凝集素,它介导具核梭杆菌与CRC中过表达的Gal-GalNAc结合;④ 表达Fap2的具核梭杆菌通过血液循环进入结肠,并定殖在小鼠的原位结肠肿瘤上;⑤ 靶向具核梭杆菌的Fap2或宿主上皮的Gal-GalNAc或可降低梭杆菌对CRC的增强作用。
Fap2 Mediates Fusobacterium nucleatum Colorectal Adenocarcinoma Enrichment by Binding to Tumor-Expressed Gal-GalNAc
2016-08-10 DOI: 10.1016/j.chom.2016.07.006
Microbiome:具核梭杆菌的潜在毒性蛋白
Microbiome[IF:8.496]
① 口腔中的具核梭杆菌与炎症及结肠直肠癌相关,但其中的因果关联尚未明确;② 鉴定出具核梭杆菌的假定分泌蛋白(FusoSecretome),与已知的细菌毒力因子有着相似的特征;③ FusoSecretome与人体蛋白互作,参与感染相关的细胞过程,定位于宿主-病原体界面中;④ 基于网络的分析鉴定出人体互作组中的31个功能模块可作为138个FusoSecretome的靶点;⑤ 选择其中的26个作为候选毒性蛋白,最终确定6个功能模块靶点与IBD及结肠直肠癌的发生及发展相关。
Perturbed human sub-networks by Fusobacterium nucleatum candidate virulence proteins
2017-08-10 DOI: 10.1186/s40168-017-0307-1
Gut:具核梭杆菌检测+FIT,或更好检出大肠癌
Gut[IF:16.658]
① 选取104名结肠直肠癌患者、103名高危腺瘤患者及102名健康人;② 对其粪便中的具核梭杆菌等3种细菌的丰度进行检测;③ 结肠直肠癌患者的3种生物标记物都显著高于健康人,高危腺瘤患者的具核梭杆菌丰度高于健康人;④ 在检测结肠直肠癌及高危腺瘤时,结合具核梭杆菌检测与粪便免疫化学检测(FIT),相比与单独的FIT,可显著提升检测敏感度及AUC曲线下方面积。
Quantitation of faecal Fusobacterium improves faecal immunochemical test in detecting advanced colorectal neoplasia
2016-10-24 DOI: 10.1136/gutjnl-2016-312766
Nature Reviews:细菌如何促进癌症?(综述)
Nature Reviews Microbiology[IF:26.819]
① 感染可能造成了人类约20%的肿瘤发生;② 病毒能够诱导细胞转化,而幽门螺杆菌、肠道沙门氏菌肠道亚种伤寒血清型等细菌也与某些特定癌症相关;③ 虽然因果关系尚未明确,但沙眼衣原体、具核梭杆菌、脆弱拟杆菌等也与癌症发展相关;④ colibactin及CagA可通过影响宿主细胞的代谢通路(WNT及ATM通路)直接促进癌症发生;⑤ 也可能通过诱导组织损伤及炎症反应等间接促进癌症;⑥ 本综述讨论了细菌病原体如何与宿主细胞互作从而在癌症发展中起作用。
Collateral damage: insights into bacterial mechanisms that predispose host cells to cancer
2017-01-03 DOI: 10.1038/nrmicro.2016.171
Cell子刊:肠道菌群帮助噬菌体感染更多种类细菌
Cell Host and Microbe[IF:14.946]
① 利用种群比较基因组学,在体外及小鼠肠道内对包含三组分的网络(噬菌体、细菌宿主、对噬菌体不敏感的细菌)进行分析;② 在野生型小鼠的肠道内(而非体外或仅有2种细菌定殖的小鼠肠道内),噬菌体可在三组分共存的情况下感染原本对噬菌体不敏感的细菌;③ 与噬菌体宿主谱扩展相关的分子水平变化包括:噬菌体基因组中的单个氨基酸替换,以及不常见的基因组内同源重组;④ 噬菌体感染原本不敏感的细菌,需要通过对噬菌体敏感的中间细菌宿主。
The Gut Microbiota Facilitates Drifts in the Genetic Diversity and Infectivity of Bacterial Viruses
2017-11-22 DOI: 10.1016/j.chom.2017.10.010
FI:干酪乳杆菌BL23抑制小鼠的结直肠癌
Frontiers in Immunology[IF:6.429]
① 氧化偶氮甲烷+右旋糖酐硫酸酯钠诱导小鼠产生结直肠癌;② 干酪乳杆菌BL23可在小鼠的结直肠癌发展中起到显著的保护作用;③ 干酪乳杆菌BL23可降低组织学评分及增殖参数,降低细胞因子IL-22的水平介导免疫调节作用,上调caspase-7、caspase-9及Bik的表达介导抗增殖作用;④ 干酪乳杆菌BL23可抵消结直肠癌诱导的小鼠粪便菌群失调;⑤ 干酪乳杆菌BL23或可作为防治结直肠癌的潜在新策略。
Probiotic strain Lactobacillus casei BL23 prevents colitis-associated colorectal cancer
2017-11-17 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01553
FI:缓解小鼠对原肌球蛋白过敏的婴儿双歧杆菌
Frontiers in Immunology[IF:6.429]
① 原肌球蛋白(Tm)是贝类过敏的主要过敏原;② 在小鼠模型中由Tm诱导产生过敏反应,益生菌(婴儿双歧杆菌14.518,Binf)处理可起到预防及治疗的作用;③ Binf促进树突细胞的成熟及CD103+ 致耐受性树突细胞在肠道相关淋巴组织中的积累,随后诱导调节性T细胞的分化,并抑制Th2型免疫反应;④ Binf可改变肠道菌群的组成,Dorea菌属的增加及罗尔斯通菌属的减少与Th2/Treg比例高度相关。
Bifidobacterium infantis Potentially Alleviates Shrimp Tropomyosin-Induced Allergy by Tolerogenic Dendritic Cell-Dependent Induction of Regulatory T Cells and Alterations in Gut Microbiota
2017-11-10 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01536
FM:植物乳杆菌MYS6缓解肉鸡肝肾损伤
Frontiers in Microbiology[IF:4.076]
① 选取48只肉鸡,分析植物乳杆菌MYS6对伏马菌素B1(FB1)引起的毒性及氧化损伤的影响;② 植物乳杆菌MYS6可有效提升肉鸡的采食量、体重及饲料转化效率;③ 并可缓解FB1引起的血液指标改变,例如全血球计数、血红蛋白、血细胞压积,同时使血清中的谷草转氨酶、谷丙转氨酶、肌酸酐、胆固醇、甘油三酯、白蛋白水恢复;④ 另外,植物乳杆菌MYS6可降低血清及肝脏中的氧化应激压力标记物。
Lactobacillus plantarum MYS6 ameliorates fumonisin B1-induced hepatorenal damage in broilers
2017-11-22 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02317
PIDJ:唾液链球菌K12无法预防A型链球菌引起的咽炎
Pediatric Infectious Disease Journal[IF:2.486]
① 将1314名急性风湿热(ARF)高风险的儿童分为2组,分别口服唾液链球菌K12或安慰剂,持续干预1学年;② 801名儿童报告至少一次咽喉痛,每次报告产生一份咽拭子样本;③ 1525份咽拭子样本来自口服K12的411名儿童,其中119份(7.8%)样本在常规培养中显示出A型链球菌阳性;④ 1402份咽拭子样本来自对照组的390名儿童,其中124份(8.8%)为A型链球菌阳性;⑤ K12无法显著预防A型链球菌引起的咽炎。
The Effect of the Oral Probiotic Streptococcus salivarius (K12) on Group A Streptococcus Pharyngitis: A Pragmatic Trial In Schools
2017-11-15 DOI: 10.1097/INF.0000000000001847
CB:宽吻海豚口腔菌群的多样性及功能分析
Current Biology[IF:8.851]
① 通过对两只宽吻海豚口腔龈沟菌群进行宏基因组分析,获得了24个已知的菌门,1个古细菌门、2个暂定门Candidatus Delphibacteria、Candidatus Fertabacteria;② Delphibacteria类群在养殖和野生海豚中均有发现,具有反硝化能力,可能促进海豚的健康;③ 预测Cas9蛋白丰富,包括迄今为止最长的2个预测Cas9蛋白;④ 暂定门辐射成员能够编码II型CRISPR-Cas系统,并根据其间隔序列,构建了完整的Saccharibacteria噬菌体基因组。
Novel Microbial Diversity and Functional Potential in the Marine Mammal Oral Microbiome
2017-11-16 DOI: 10.1016/j.cub.2017.10.040
JE:组学在群落生态学研究中的应用
Journal of Ecology[IF:5.813]
① 基因组学及转录组学方法可用于群落生态学研究,目前大多集中关注物种共生的驱动力;② 两项研究表明,功能种系基因组学方法结合邻近人口模型,可帮助理解邻近异种特异性物种在focal tree demography中的作用;③ 两项研究展示了基因如何在不同的竞争环境中差异表达,以及与物种共生的关系;④ 另一项研究采用宏基因组方法,证实在热带地区土壤真菌与树木的生物多样性之间有着不可思议的联系;⑤ 群落生态学现在已经集成了组学工具。
Community transcriptomics, genomics and the problem of species coa occurrence
2017-04-16 DOI: 10.1111/1365-2745.12771
感谢本期日报的创作者:沈志勋,热心肠先生,熙子,桃李不言
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