大连金砖兄弟已占先，巴西微生物组计划启动

发布时间：2020-07-18 来源：大连胃肠医院

金砖兄弟已占先，巴西微生物组计划启动~

今天是第531期日报。

BM：巴西微生物组计划介绍

The Brazilian Microbiome[IF:N/A]

① 巴西拥有全球20%的宏观生态多样性，但巴西的微生物多样性研究未受到足够重视；② 为了发展微生物研究并与国际接轨，以及更好地研究微生物多样性、动力学以及与环境的相互关系，巴西开展了由地方发起并协调全国微生物组研究的微生物组计划；③ 微生物研究依赖于科学共同体的整合、综合的研究模型和开展保护工作揭示其潜力来造福当地社区和公民；④ 巴西微生物组计划将主要关注植物、动物、土壤、水生环境、人类、生物勘探中的菌群多样性。

The Brazilian Microbiome Project

2017-09-23 DOI: 10.1007/978-3-319-59997-7_1

Immunity：子宫颈阴道细菌调控女性生殖道炎症

Immunity[IF:22.845]

① 乳杆菌属被认为与维护女性生殖健康密切相关；② 研究了146名南非健康年轻女性的生殖道菌群，发现乳杆菌属的丰度较低，菌群多样性较高；③ 高度多样性的生殖道菌群与生殖道促炎细胞因子浓度密切相关；④ 转录谱分析表明，生殖道抗原呈递细胞通过TLR4信号感应革兰氏阴性细菌产物，通过激活NF-κB信号通路和产生趋化因子募集淋巴细胞来促进生殖道炎症；⑤ 提出了一种子宫颈阴道菌群影响生殖道感染，进而影响女性生殖健康的相关机制。

Cervicovaginal bacteria are a major modulator of host inflammatory responses in the female genital tract

2015-05-21 DOI: 10.1016/j.immuni.2015.04.019

BB：厌氧菌消化池内菌群碳水化合物活性酶的多样性

Biotechnology for Biofuels[IF:5.203]

① 厌氧菌消化池（AD）是研究碳水化合物活性酶（CAZyme）的独特生态位；② 在丹麦选取4个嗜常温AD，负责处理专门处理市政废水处理厂来源的初级和剩余污泥，功能性CAZyme被分泌进入AD环境；③ 鉴定出19335个CAZyme，30%与已知蛋白质的一致性低于50%；④ 4个宏基因组中鉴定出许多不同的α-葡聚糖反应性CAZyme，包括糖苷水解酶家族13、纤维素和木聚糖酶CAZyme；⑤ AD是研究新的植物生物量降解和修饰酶的适宜场所，提供从生物炼制产生附加产物的基础。

Diversity of microbial carbohydrate-active enzymes in Danish anaerobic digesters fed with wastewater treatment sludge

2017-06-30 DOI: 10.1186/s13068-017-0840-y

SR：茶叶中的茶皂素可改善菌群并抑制认知衰退

Scientific Reports[IF:4.259]

① 茶皂素是茶叶主要活性组分，有抗炎和改善菌群的作用，利用高脂饮食（HF）诱导C57BL / 6J雄性小鼠为模型；② 在饮食中添加0.5％茶皂素，6周后，发现茶皂素改善了HF诱导的识别记忆障碍、神经炎症、神经胶质增生，并促进海马中脑源性神经营养因子增加；③ 此外，茶皂素降低内毒素和结肠促炎巨噬细胞水平，逆转HF诱导的拟杆菌-普雷沃氏菌属的降低、双歧杆菌和乳酸菌的增加，④ 并改善葡萄糖耐受，降低体重的增加，机理可能与降低有害菌群相关。

Dietary teasaponin ameliorates alteration of gut microbiota and cognitive decline in diet-induced obese mice

2017-09-22 DOI: 10.1038/s41598-017-12156-2

Nature Reviews：如何基于菌群制定个性化营养方案

Nature Reviews Microbiology[IF:26.819]

① 餐后血糖水平（PPGR）取决于饮食及肠道菌群等多种因素；② 800人的测量结果显示PPGR随个体饮食改变而变化，且与临床参数及肠道菌群的组成相关；③ 研究发现变形菌门、肠杆菌科和放线菌门的丰度与PPGR升高呈正相关，而梭菌和普雷沃氏菌科的存在与较低的PPGR相关；④ 用机器学习算法整合这些信息集成个性化的营养计划；⑤ 分析26名个性化的营养计划参与者的PPGR及肠道菌群结构显示，饮食干预改善PPGR并改变肠道菌群的组成。

Microbiome: Microbiota-based nutrition plans

2015-12-07 DOI: 10.1038/nrmicro.2015.10

Microbiome：温带珊瑚菌群随季节变化

Microbiome[IF:8.496]

① 大多数珊瑚-菌群关联是有益的，但珊瑚菌群组成的机制仍未知；② 季节变化对珊瑚Astrangia poculata的菌群组成有很强的影响；③ 在冬季到春季过渡期间季节性变化最大，在此期间，不同珊瑚宿主之间的菌群组成更相似；④ 在四季中，菌群组成与周围海水的差异显著，但在共生和非共生珊瑚之间是一致的；⑤ 即使在夏季，棕色和白色菌落之间的共生密度差异很大，说明观察到的季节性变化不太可能是由于共生密度的波动引起。

Season, but not symbiont state, drives microbiome structure in the temperate coral Astrangia poculata

2017-09-15 DOI: 10.1186/s40168-017-0329-8

Immunity：一文读懂宿主、菌群、代谢产物的互作

Immunity[IF:22.845]

① 菌群来源的代谢产物对寄主各有利弊，影响不限于肠道和免疫系统；② 短链脂肪酸和多糖A增强Treg细胞功能，抑制结肠炎，防止肺部过敏性炎症；③ 肽聚糖影响骨吸收，氧化三甲胺（TMAO）提高心脏疾病风险，4-乙基苯酚硫酸盐（4EPS）影响脑功能导致类似于自闭症的焦虑行为；④ 代谢物也会产生新基因簇，类似已知肠道细菌内天然产物聚酮化合物，非核糖体合成的肽等；⑤ 膳食和菌群干预治疗对过敏、发炎性和自身免疫性疾病相对安全。

Finding the missing links among metabolites, microbes, and the host

2014-06-21 DOI: 10.1016/j.immuni.2014.05.015

EM：胃肠道中的宿主-菌群互作（综述）

Environmental Microbiology[IF:5.395]

① 动物实验尤其是无菌动物模型已经证实，从生命初期到宿主-菌群共生的成年时期，肠道菌群在肠道发育和健康中都发挥重要作用；② 宿主的肠腔环境决定肠道菌群的空间分布，而菌群的定殖又影响先天性及和适应性粘膜免疫系统发育、上皮细胞更新、屏障完整性以及肠神经系统等；③ 无菌动物菌群移植实验说明了不同生理系统宿主-菌群之间的相互作用及信号通路共享；④ 同时，体外细胞实验和数学模型可以为宿主-菌群的分子和信号通路的研究提供思路。

Host-microbe interaction in the gastrointestinal tract

2017-09-11 DOI: 10.1111/1462-2920.13926