大连案例警示：若免疫低下，慎吃活菌酸奶或

发布时间：2020-07-19 来源：大连胃肠医院

案例警示：若免疫低下，慎吃活菌酸奶或益生菌~

今天是第521期日报。

BMJ案例报告：酸奶活菌，造成严重肝脓肿和菌血症

BMJ case reports[IF:N/A]

① 65岁女性，长期规律服用格列齐特等药物，每天至少喝一瓶Actimel酸奶（达能出品，含干酪乳杆菌干酪亚种CNCM I-1518株）；② 确诊严重肝脓肿和菌血症，采用超声引导下穿刺引流和广谱抗生素，但败血症持续，并发右侧胸腔积液、下腔静脉血栓、感染性肺栓塞；③ 利用血琼脂平板，在病人样本中培养出与酸奶中一致的干酪乳杆菌菌株，并经多种实验方法确定；④ 这首次明确特定“益生菌”可能造成肝脓肿，研究者提醒免疫功能低下人群应慎重摄入活菌。

Lactobacillus: the not so friendly bacteria

2017-09-13 DOI: 10.1136/bcr-2016-218423

NEJM：如何应对食物过敏？

The New England Journal of Medicine[IF:72.406]

① 花生是最常见的食物过敏源，食物过敏有多个危险因素，全身性过敏反应的诊断有三类标准；② 获取相应的病史、与过敏性疾病专家一起解读临床检查结果对食物过敏的诊断和治疗至关重要；③ 目前的治疗手段包括：识别全身性过敏反应的症状和体征、肾上腺素自动注射、注射后在急诊室内立即评估监测、严格避免接触食物过敏源、进行食物安全教育；④ 生命早期摄入花生，可显著减少花生过敏的风险，多种免疫治疗的临床研究正在进行。

Food Allergy

2017-09-21 DOI: 10.1056/NEJMcp1611971

Nature子刊：直接从宏基因组识别病毒序列

Nature Protocols[IF:10.032]

① 在对大型微生物数据集的分析中，易感染菌群的病毒是遗传多样性的主要来源，对生物地球化学循环和生物体健康有很大的影响；② 提出了一个从微生物组中直接检测相关病毒的方案，对来自微生物样本的病毒序列进行准确检测和分组；③ 使用一组病毒蛋白家族作为诱饵，直接从宏基因组识别病毒序列；④ 具体介绍了：如何使用病毒蛋白家族目录，如何选择过滤器以检测宏基因组样品中的病毒重叠群，以及如何将病毒序列组织成准物种分类级别的具体参数。

Nontargeted virus sequence discovery pipeline and virus clustering for metagenomic data

2017-08-01 DOI: 10.1038/nprot.2017.063

Microbiome：用于分析16S rRNA基因测序结果的流水线方法

Microbiome[IF:8.496]

① 使用通用PCR引物对原核生物特异性的16S rRNA基因的测序可研究菌群组成，标准化方案有助于可重复分析；② 短读库16S rRNA基因测序流水线（sl1p）可将预先存在的工具组合生成计算方法，自动处理原始的16S rRNA基因测序数据，转换成可读的表格和图形；③ 使用八个OTU聚类算法、两个分类方法和三个16S rRNA基因参考数据库来比较模拟群落生成的数据，④ 结果表明sl1p可通过提供全面的日志文件来促进可重复的研究，并减少用户处理测序数据的难度。

A comprehensive evaluation of the sl1p pipeline for 16S rRNA gene sequencing analysis

2017-08-14 DOI: 10.1186/s40168-017-0314-2

Gastroenterology：小鼠Paneth细胞缺陷，菌群失调内脏高敏感

Gastroenterology[IF:18.392]

① 新生C3H/HeN小鼠与母亲分离后，发展出内脏高敏感性及Paneth细胞缺陷，与大鼠中的研究结果一致；② 与同窝对照相比，Paneth细胞缺陷型小鼠也发展出内脏高敏感性；③ 与母亲分离的小鼠及Paneth细胞缺陷型小鼠的肠道菌群失调，大肠杆菌异常扩增；④ 给正常的C3H/HeN小鼠每日喂食10^9大肠杆菌，也可诱导产生内脏高敏感性；⑤ 每日口服溶菌酶则可抑制大肠杆菌的扩增，并防止新生小鼠与母亲分离后的内脏高敏感性。

Paneth Cell Defects Induce Microbiota Dysbiosis In Mice And Promote Visceral Hypersensitivity

2017-08-30 DOI: 10.1053/j.gastro.2017.08.044

EM：南非的海鸥，或传播病原菌和耐药基因！

Environmental Microbiology[IF:5.395]

① 人畜共患的弯曲杆菌和沙门氏菌是通过食物传播的肠道疾病的常见病原体，但在非洲关于这两种病原菌的宿主所知极少；② 分别研究了西开普海岸的海鸥和燕鸥，弯曲杆菌的检出率为14%，沙门氏菌的检出率为27.5%，这些分离菌都有一定的耐药性；③ 在开普敦医院的海鸟及病人中分离的沙门氏菌与上述沙门氏菌PFGE分型相同或具有极高相似度；④ 海鸥作为弯曲杆菌和沙门氏菌的宿主，在这些细菌的传播和对人体健康的影响方面有重要作用。

Seabirds (Laridae) as a source of Campylobacter spp., Salmonella spp. and antimicrobial resistance in South Africa

2017-07-28 DOI: 10.1111/1462-2920.13874

FM：酱香茅台，何菌发酵？

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 在中国传统白酒固态发酵进程中，发酵相关核心菌群可能对酒类的品质和产量都产生重要影响；② 采用高通量扩增、宏转录组测序，结合超高效液相色谱和顶空固相微萃取-气相色谱-质谱法，在茅台酒发酵进程，鉴定出10个真菌和11个细菌属；③ 酵母和乳酸菌的丙酮酸代谢在酱香发酵过程中被分为两个阶段，主要产物从酒精转变为酸，核心微生物也从裂殖酵母转换为乳酸菌；④ 这充分揭示了酱香型白酒发酵的核心菌群及在不同环境下发酵菌群的变化与特征。

Unravelling core functional microbiota in traditional solid-state fermentation by high-throughput amplicons and metatranscriptomics sequencing

2017-07-14 DOI: 10.3389/fmicb.2017.01294

FI：Nissle 1917或可抑制小鼠的神经炎症并修复肠道屏障

Frontiers in Immunology[IF:6.429]

① 口服大肠杆菌Nissle 1917（ECN），而非其原型菌株K12大肠杆菌MG1655，可在多发性硬化（MS）的小鼠模型中，降低MOG35-55肽诱导的实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的严重性；② 疾病的缓解与外周淋巴结及中枢神经系统中的自身反应性CD4 T细胞的炎症因子分泌减少，及抑炎因子IL-10产生增加相关；③ 口服ECN的小鼠，MOG特异性CD4+ T细胞在外周的数量增加，而中枢神经系统中减少；④ 口服ECN可改善肠道屏障功能，修复肠道渗透性障碍。

Oral administration of the probiotic strain Escherichia coli Nissle 1917 reduces susceptibility to neuroinflammation and repairs EAE-induced intestinal barrier ...

2017-09-14 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01096