大连Sicence观点：慢性疾病能经菌群“传染”

Sicence观点：慢性疾病能经菌群“传染”吗？

标题拼写错误无法修改，特此说明并致歉。今天是第1348期日报。

Science：菌群或是非传染性疾病中的传染性成分（观点）

Science[IF:41.037]

① 非传染性疾病（NCD）与菌群失调有关，个体间的密切接触对菌群组成有塑造作用，动物试验中NCD可经菌群移植传递给健康宿主；② 肥胖（NCD风险因素）具有社会传播特性，2型糖尿病和炎症性肠病等NCD患者的配偶患病风险上升，可能与失调菌群的传播有关，但由于菌群与环境和遗传因素有密切关系，研究时难以将其完全剥离；③ 对于传染性疾病，科赫法则可用来检验微生物的致病性，相似的假设也能用于检验失调的菌群在NCD中的“传染性”作用。

Are noncommunicable diseases communicable?
01-17, doi: 10.1126/science.aaz3834

【主编评语】过去一个世纪中，人类的传染性疾病得到有效控制，而非传染性疾病（如：心血管代谢疾病和癌症等慢性疾病）正变得越来越普遍。越来越多的证据显示，不少非传染性疾病都与肠道菌群失调有关。Science最新发表的一篇观点文章提出，正如致病微生物可在个体之间传播，肠道菌群失调也可能在个体间传播，从而可能使得非传染性疾病也具有“传染性”。这一观点为传统的非传染性疾病概念添加了新的元素，或为这些疾病的预防和治疗带来新启示。（@mildbreeze）

肠菌脂多糖移位或促进心肌梗死患者的动脉血栓形成

European Heart Journal[IF:23.239]

① 与稳定型心绞痛和对照相比，ST段升高心肌梗死（STEMI）患者血液的脂多糖（LPS）和sP-选择素（血小板活化标志物）浓度升高，肠道通透性标志物zonulin浓度升高且与LPS相关；② STEMI冠状动脉血栓中，Toll样受体4（TLR4）、组织蛋白酶G、LPS阳性率分别为100%、80%、25%；③ 给小鼠注射大肠杆菌LPS，会增强动脉血栓形成和血小板活化，这一现象可被TLR4抑制剂削弱；④ 体外试验表明，LPS通过TLR4介导的组织蛋白酶G活化，来增强血小板聚集。

Low-grade endotoxaemia enhances artery thrombus growth via Toll-like receptor 4: implication for myocardial infarction
01-03, doi: 10.1093/eurheartj/ehz893

【主编评语】脂多糖（LPS）是肠道菌群的组成部分，可在血液中检测到（达到一定程度时即为内毒素血症），但其在血栓形成中的作用尚不完全清楚。European Heart Journal发表的这项研究发现，在患有心肌梗塞（MI）的患者中，冠状动脉血栓呈LPS和TLR4阳性，与低度内毒素血症、血小板活化和肠道通透性相关。向小鼠输注大肠杆菌LPS来模拟MI患者的低度内毒素血症，增强了小鼠的血栓形成，而这种作用可被TLR4抑制剂削弱。这些发现说明，MI患者存在肠道通透性增加的现象，这导致LPS移位进入血液循环，最终通过白细胞-血小板互作，在动脉病变部位形成血栓。（@mildbreeze）

真菌鉴定ITS数据库UNITE处理未分类和并行分类

Nucleic Acids Research[IF:11.147]

① UNITE数据库是目前真菌ITS整理最全面的数据库，基于上百万的全长ITS高质量序列，包括45万多个假定物种；② 假定物种包括DOI号，方便在论文中引用提供唯一性；③ 新整合部分ITS2和PacBio高通量数据，并改进末分类物种注释；④ 数据库为主流分析流程QIIME、Mothur和USEARCH都制作了相应格式的文件，方便使用；⑤ UNITE数据库是一个开源的开放访问计划，由真菌学(Mycological)社区驱动。

The UNITE database for molecular identification of fungi: handling dark taxa and parallel taxonomic classifications
2018-10-29, doi: 10.1093/nar/gky1022

【主编评语】UNITE（https://unite.ut.ee）是一个真菌分子鉴定数据库和序列管理环境。它的目标是形成正式的真菌条形码-核糖体内部转录间隔区（ITS）区域-并提供所有～1,000,000公共真菌ITS