大连《自然医学》背靠背:菌群特征检测大-大连春柳中医院

大连《自然医学》背靠背:菌群特征检测大

发布时间:2020-05-23    来源:大连胃肠医院

《自然医学》背靠背:菌群特征检测大肠癌不是梦!

今天是第1060期日报。


Nature子刊:全球数据揭示结直肠癌特征菌群

Nature Medicine[IF:32.621]

① 纳入来自欧美、东亚地区的8项人群对照研究共计768参与者,发现在结直肠癌(CRC)患者的粪便菌群中有29个菌种丰度升高;② 来自单个CRC研究的特征菌群,同样可预测其他研究中的CRC患者;③ CRC患者的粪便菌群基因组中,分解蛋白质和粘蛋白的基因较多,降解碳水化合物的基因减少;④ CRC患者体内的次级胆汁酸产量可能增加,CRC相关的肠道菌群变化很可能与高脂、高肉类的饮食相关;⑤ CRC相关的特征菌群及其功能,有望在全球用于CRC诊断。

Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer
04-01, doi: 10.1038/s41591-019-0406-6

【主编评语】《Nature Medicine》近期发表一项涵盖全球多个地区结直肠癌研究的荟萃分析,发现了29个具有全球代表性的特征肠道菌群,以及与结直肠癌相关的菌群代谢特点,这些宏基因组信息有望用于全球范围内的结直肠癌诊断。(@小肠君)

Nature子刊:跨越人群的大肠癌肠道菌群特征和诊断标志物

Nature Medicine[IF:32.621]

① 对7个队列的数据集进行荟萃分析,寻找通用的结直肠癌(CRC)肠道菌群标志物,并在2个额外队列中进行验证,共涉及969个粪便宏基因组;② CRC肠道菌群比对照具有更高的丰富度,口腔菌种的富集是部分原因;③ 菌群功能中,糖异生以及腐败和发酵通路与CRC相关,而水苏糖和淀粉降解通路与对照相关;④ 用机器学习鉴定出含16个菌群物种的最小集合,可较准确的区分CRC与对照(AUC>0.8);⑤ 菌群基因中,胆碱三甲胺裂解酶基因(cutC)在CRC中富集。

Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation
04-01, doi: 10.1038/s41591-019-0405-7

【主编评语】不少研究报道了肠道菌群与结直肠癌(CRC)之间的密切关系,但在不同队列和人群之间是否存在通用的菌群诊断标志物,仍需进一步探究。《Nature Medicine》刚刚上线的一项研究,对涉及5个国家人群的已报道的队列和意大利的2个新队列的粪便宏基因组数据集,进行了荟萃分析,鉴定出在不同人群间共通的CRC相关肠道菌群组成和功能特征,构建了含16个物种的CRC疾病预测模型,并在两个额外的队列数据中得到验证。该研究再次证实了,不同人群中的CRC菌群特征存在异质性,但综合分析多个队列获得的菌群标志物,能提高诊断准确性。这些发现对于用菌群标志物进行疾病诊断,以及研究菌群成员在CRC中的潜在作用,均有参考价值。(@李丹宜)

Science子刊:纳米疫苗可通过免疫调节提高免疫原性

Science advances[IF:11.511]

① TLR5敲除小鼠感知肠道菌群的能力受影响,且导致代谢综合征,聚乳酸-羟基乙酸(PLGA)纳米疫苗可进一步改变肠道菌群;② 小鼠TLR5的缺失限制了PLGA纳米疫苗向淋巴组织的转运,减少其引起的生发中心免疫应答,从而限制体液免疫应答;③ 抗生素处理证实肠道菌群失调导致了交叉的疫苗应答;④ Pyr-pHEMA纳米凝胶能够通过TLR2介导体液免疫,从而提高免疫原性;⑤ 先进的纳米材料可在肠道菌群失调介导的代谢综合征下起到免疫调节作用。

Immunomodulatory nanogels overcome restricted immunity in a murine model of gut microbiomemediated metabolic syndrome
03-27, doi: 10.1126/sciadv.aav9788

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