张友明和尹佳等详述，怎样从肠道菌群天然产物中挖宝~

今天是第919期日报。

肠道菌群代谢产物

张友明+尹佳：挖掘肠道菌群天然产物的“宝藏”（综述）

Trends in Biotechnology[IF:13.578]

① 肠道菌群可产生大量不同结构和生物活性的次生代谢产物，在药物研发等方面很有应用前景；② 除了代谢饮食成分，菌群还能通过生物合成基因簇，生成有独特结构和功能的天然产物；③ 挖掘这些“宝藏”的策略主要基于基因组/宏基因组、培养组和代谢组学，三者各有优劣，且彼此间的边界正在消失，将两种或以上的策略相结合，有助于加速对这些代谢物质的挖掘研究；④ 机器学习可用于在临床和实验室中开发代谢组学数据库和构建代谢网络模型。

Natural Products from Mammalian Gut Microbiota

11-01  DOI: 10.1016/j.tibtech.2018.10.003

【主编评语】肠道菌群有巨大的生物合成潜力，生成的天然产物在医药、农业和食品加工业有广泛的应用前景。Cell旗下刊物Trends in Biotechnology近期发表了由山东大学张友明和湖南师范大学尹佳等共同撰写的综述，详细介绍了哺乳动物肠道菌群次生代谢产物的结构和功能的多样性，探讨了挖掘这些“宝藏”的策略和方法，非常值得专业人士关注。（@mildbreeze）

氧化三甲胺

TMAO水平与心衰不良结局相关

European Journal of Heart Failure[IF:10.683]

① 氧化三甲胺（TMAO）水平是否受到指南推荐的治疗方法和药物影响尚未明确；② 选取2234例新发或逐渐恶化的心力衰竭患者，其TMAO水平与不良结局（死亡率和/或再住院）有很强的相关性；③ 对972例患者的血浆进行分析，发现使用基于指南的治疗方法可以降低b型利钠肽水平，但无法降低TMAO的水平；④ TMAO水平与不良结局相关，但在基于指南的药物治疗后，其水平未发生改变。

Association with outcomes and response to treatment of trimethylamine N-oxide in heart failure (from BIOSTAT-CHF)

10-29  DOI: 10.1002/ejhf.1338

【主编评语】来自European Journal of Heart Failure上发表的一项最新研究，发现菌群衍生物氧化三甲胺（TMAO）水平与心力衰竭患者的不良结局（死亡率和/或再住院）显著相关，但基于指南的药物治疗不影响TMAO的水平。（@沈志勋）

氧化三甲胺

口服肉碱试验可检测菌群产生TMAO的能力

Gut[IF:17.016]

① 选取23位素食者和34位杂食者中进行口服肉碱挑战试验（OCCT），验证肠道菌群产生氧化三甲胺（TMAO）的能力；② 比起空腹血浆TMAO检测，OCCT能更好地检测人体内菌群产生TMAO的能力；③ 杂食者产生的TMAO水平比素食者高10倍，粪便CntA基因与TMAO的产生无关，可能涉及到其他关键的相关微生物基因；④ 在人源化限菌小鼠模型中获得的结果与人体试验中类似；⑤ 尿液TMAO与血浆TMAO呈强正相关，提高了OCCT的可行性，可作为防治心血管疾病的个性化手段。

Identification of TMAO-producer phenotype and hostdietgut dysbiosis by carnitine challenge test in human and germ-free mice

10-11  DOI: 10.1136/gutjnl-2018-317155

【主编评语】Gut上发表的一篇最新研究文章，发现口服肉碱试验（OCCT）比起空腹血浆氧化三甲胺（TMAO）检测，可更好地分析人体肠道菌群产生TMAO的能力，或可作为防治心血管疾病的一种个性化手段。（@沈志勋）

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