大连Cell封面+双发！两位Eran指路个性化菌群

Cell封面+双发！两位Eran指路个性化菌群干预

今天是第860期日报。

Cell：未来趋势个性化益生菌干预

Cell[IF:31.398]

① 小鼠和人体中，消化道菌群存在梯度变化，粘膜和腔内的菌群存在差异，均不同于粪便菌群；② 益生菌通过消化道后在粪便中仍保持活性，但在小鼠肠粘膜的定殖受原有菌群的定殖抵抗；③ 益生菌在人肠粘膜的定殖情况，有明显的个体、部位和菌株特异性，可将个体分为“易定殖”和“抗定殖”两类，并可对粘膜菌群组成/功能和人肠道基因表达产生短暂而不同的影响；④ 干预前的宿主和菌群特征，而非干预期间粪便菌群变化，可预测益生菌的肠粘膜定殖。

Personalized Gut Mucosal Colonization Resistance to Empiric Probiotics Is Associated with Unique Host and Microbiome Features

09-06  DOI: 10.1016/j.cell.2018.08.041

Cell：抗生素治疗后，益生菌干预不利于菌群复原

Cell[IF:31.398]

① 在小鼠和人体中，分析混合益生菌干预和自体粪菌移植（aFMT）如何影响抗生素扰动后的肠道菌群和肠转录组恢复；② 人体中抗生素显著促进了人益生菌在肠粘膜的定殖，但该作用在小鼠中较轻；③ 与无干预的自发性恢复相比，益生菌明显推迟了宿主的粪便和肠粘膜菌群的重建及宿主转录组的恢复，且使其难以完全复原；④ 而aFMT可使菌群和宿主肠转录组在几天内近乎完全复原；⑤ 体外实验中，益生菌诱导的菌群抑制作用与乳杆菌属分泌的可溶因子有关。

Post-Antibiotic Gut Mucosal Microbiome Reconstitution Is Impaired by Probiotics and Improved by Autologous FMT

09-06  DOI: 10.1016/j.cell.2018.08.047

Nature子刊：如何定义菌群的“功能”

Nature Microbiology[IF:14.174]

① 在生物学的哲学中，功能可分为两种：因果作用（CR）和选择效应（SE）的功能，一些研究中通常混淆使用这两种不同的概念；② 当菌群中的微生物或者部件移除后能够引起宿主表型的变化时，我们说菌群或者其中的部分具有因果作用的功能；③ 而只有当菌群给宿主带来适应性的变化且这种效应可以遗传的时候，才可以说菌群具有选择效应的功能；④ 因果作用功能基于缺失，而选择效应功能基于自然选择，后者是前者的子集，是长期自然选择的结果。

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