大连肠道菌群的功能可影响疫苗的保护作用
肠道菌群的功能可影响疫苗的保护作用
今天是第754期日报。
肠道菌群的组成及功能,可影响伤寒疫苗的保护作用
mBio[IF:6.956]
① 健康志愿者接种伤寒减毒活疫苗后,对粪便样本进行纵向宏转录组分析;② 鉴定出2种稳定的基因表达模式:甲烷短杆菌为主的转录产物、厚壁菌门中多个菌属的转录产物;③ 接种针对伤寒型肠道沙门氏菌的减毒活疫苗后,对肠道菌群组成及功能的影响很小;④ 以甲烷短杆菌转录产物为主的个体在接种疫苗并感染后,发展出症状的风险更小;⑤ 感染后无症状的个体,基础及感染后的编码抗氧化蛋白、金属稳态、转运蛋白、热休克蛋白的基因表达更高。
Compositional and Functional Differences in the Human Gut Microbiome Correlate with Clinical Outcome following Infection with Wild-Type Salmonella enterica Serovar Typhi
05-08 DOI: 10.1128/mBio.00686-18
Nature子刊:抑制钙网蛋白与整合素α的结合或可用于防治IBD
Nature Communications[IF:12.124]
① 整合素α亚基(ITGA)的活化在炎症性肠病(IBD)中起重要作用,钙网蛋白可结合ITGA,两者的互作可能参与IBD发病机制;② 一种口服活性小分子ER-464195-01可抑制钙网蛋白与ITGA的结合,从而抑制T细胞与中性粒细胞在结肠微血管内皮上的粘附;③ 对结肠炎小鼠模型的结肠炎样本进行转录组分析,发现ER-464195-01可下调促炎症基因的表达;④ 白细胞通过钙网蛋白与ITGA的结合而浸润,在结肠炎的发病及发展中可能是必需的。
Calreticulin and integrin alpha dissociation induces anti-inflammatory programming in animal models of inflammatory bowel disease
05-17 DOI: 10.1038/s41467-018-04420-4
COPD患者的肺部菌群长期变化情况
Thorax[IF:8.272]
① 选取101名慢性阻塞性肺病(COPD)患者,收集共584份不同时间点的痰液样本,包括病情稳定期及恶化期;② 在恶化期,肺部菌群的稳定性随时间下降,且在恶化频率更高的患者中稳定性更低;③ 细菌性及嗜酸性恶化在同一个患者中更容易重复出现,而病毒性恶化不太会重复出现;④ 同时确认了嗜血杆菌属及莫拉克斯氏菌属等细菌属与疾病严重程度、恶化事件、支气管扩张的相关性。
Longitudinal profiling of the lung microbiome in the AERIS study demonstrates repeatability of bacterial and eosinophilic COPD exacerbations
01-31 DOI: 10.1136/thoraxjnl-2017-210408
适度饮酒影响肠道菌群
Addiction Biology[IF:4.603]
① 与对照组相比,隔日自愿饮用20%乙醇溶液的大鼠的肠道菌群多样性显著下降,多样性下降一般与菌群失调相关;② 肠道菌群的整体多样性也有显著变化,以乳酸杆菌为代表的特定菌群的相对丰度也显著改变;③ 公众科学项目American Gut收集的人类粪便菌群数据显示,与大鼠数据相反,人类饮酒者的肠道菌群多样性显著高于非饮酒者;④ 人类受试者中有差异的微生物在大鼠模型中表现出类似的趋势,包括涉及代谢疾病的细菌。
Effects of moderate, voluntary ethanol consumption on the rat and human gut microbiome
05-11 DOI: 10.1111/adb.12626
妊娠中期的肠道菌群组成与孕期体重增加相关
Journal of Women's Health[IF:2.322]
① 纳入参与FinnBrain队列研究的46名孕妇(其中35名体重正常、7名超重,4名肥胖),记录这些孕妇的孕期体重增加,并分析孕期24周时的肠道菌群组成;② 孕期体重过度增加与妊娠中期的肠道菌群组成变化相关;③ 在孕期体重过度增加的孕妇中,肠道菌群中的拟杆菌门增加而厚壁菌门减少,且α多样性降低;④ 细菌属/门的丰度,α/β多样性,孕前身高体重指数或孕期体重增加之间无零级效应(zero-order effect)。
Gut Microbiota Composition in Mid-Pregnancy Is Associated with Gestational Weight Gain but Not Prepregnancy Body Mass Index
05-14 DOI: 10.1089/jwh.2017.6488
吸烟及电子烟对口腔及肠道菌群的影响
PeerJ[IF:2.177]
① 采集10名吸电子烟(EC)、10名吸烟和10名对照的粪便、口腔拭子和唾液样本,进行菌群检测;② 与对照相比,吸烟对所有样本类型的细菌谱都有显著影响,与吸EC者相比,吸烟对粪便和口腔拭子的菌群有显著影响;③ 吸烟与肠道的变化关联最为显著,吸烟者的普氏菌属的相对丰度增加,而拟杆菌属下降;④ 与对照相比,吸烟者粪便样品中的香农多样性也显著降低,而EC使用者中,α多样性、β多样性或分类学相对丰度无显著差异。
Effects of tobacco smoke and electronic cigarette vapor exposure on the oral and gut microbiota in humans: a pilot study
04-30 DOI: 10.7717/peerj.4693
浙江农科院:养殖条件如何影响绍兴鸭的肠道菌群和生理
Scientific Reports[IF:4.259]
① 绍兴鸭养殖于褥草垫料地面或塑料网地面,分析不同养殖条件下的十二指肠、回肠和盲肠菌群;② 养殖于褥草垫料地面的绍兴鸭,十二指肠、回肠和盲肠菌群的主要细菌门分别为变形菌门、变形菌门和拟杆菌门;③ 养殖于塑料网地面的绍兴鸭,十二指肠、回肠和盲肠菌群的主要细菌门分别为厚壁菌门、厚壁菌门和拟杆菌门;④ 养殖于塑料网地面的绍兴鸭,回肠及十二指肠中的绒毛高度、绒毛高度/隐窝深度比值均显著升高。
Different rearing conditions alter gut microbiota composition and host physiology in Shaoxing ducks
05-09 DOI: 10.1038/s41598-018-25760-7
类芽孢杆菌79R4在瘤胃菌群中的潜在益生菌作用
Bioresource Technology[IF:5.651]
① 瘤胃微生物混合物中接种具有脱氮作用的类芽孢杆菌79R4后,在体外发酵24小时,研究该菌在体外对甲烷排放、硝酸盐和亚硝酸盐代谢能力、发酵特性的影响;② 体外模拟的结果显示,与79R4共培养时,大肠杆菌O157:H7及空肠弯曲杆菌的CFU下降了2个log,79R4还原亚硝酸盐后的主要终产物为氮气;③ 在硝酸盐存在下的瘤胃菌群发酵中,接种79R4后减少了甲烷的产生,同时增加了发酵效率,提高了瘤胃的硝酸盐及亚硝酸盐代谢能力。
Isolation, characterization and strain selection of a Paenibacillus species for use as a probiotic to aid in ruminal methane mitigation, nitrate/nitrite detoxification and food safety
04-30 DOI: 10.1016/j.biortech.2018.04.116
感谢本期日报的创作者:沈志勋,女巫
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