大连城市居民多接触动物和微生物，好处多

发布时间：2020-06-28 来源：大连胃肠医院

城市居民多接触动物和微生物，好处多

今天是第736期日报。

生活环境影响过敏症状

PNAS[IF:9.661]

① 犬可作为中介模型，用于研究环境微生物、宿主菌群和免疫系统间互作；② 皮肤菌群反映了犬的生活环境和方式，自发性过敏的发生率与居住环境和生活方式有关，不接触其他动物的城市犬发病率高，而农村犬中不常见；③ 通常在人皮肤上发现的菌群往往是城市犬皮肤菌群的优势菌，而农村犬皮肤菌群中富含环境微生物；④ 短期暴露于环境微生物与过敏无关，城市规划和生活方式的改变应促进人群暴露于环境微生物的程度和持续性，改善城市人口的健康。

Skin microbiota and allergic symptoms associate with exposure to environmental microbes

03-22 DOI: 10.1073/pnas.1719785115

儿时多接触动物，压力引起的炎症或许更少

PNAS[IF:9.661]

① 城市（无宠物）和乡村（接触动物）长大的健康年轻男性各20名，进行特里尔社会应激测试（TSST）；② 与乡村受试者相比，TSST后，城市受试者的外周血单核细胞（PBMC）和血浆IL-6的增幅更高；③ 且Con A刺激时PBMC分泌更多IL-6，而抗炎性IL-10的分泌被抑制；④ 问卷、血浆皮质醇和唾液α-淀粉酶测试却显示TSST对乡村受试者造成更多压力和焦虑；⑤ 经历急性社会压力后，城市居民的系统性免疫活化更剧烈、炎症消退更差，或与儿时缺乏动物接触有关。

Less immune activation following social stress in rural vs. urban participants raised with regular or no animal contact, respectively

04-30 DOI: 10.1073/pnas.1719866115

在菌株水平快速区分细菌的新方法

PNAS[IF:9.661]

① 利用矩阵辅助-激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）将蛋白质和代谢物分析相结合，利用IDBac程序进行数据分析，可快速鉴别培养基上的菌落；② 以枯草芽孢杆菌和小单胞菌为例，通过鉴别抗生素、铁载体或运动蛋白的生产能力可快速区分菌株；③ 分析海绵内可培养细菌，发现蛋白质聚类与细菌种系分类状况高度一致，代谢差异的分析可区分菌株的种内、种间差异；④ 该方法不依赖液体培养，无需提取代谢物及质谱分析，数据分析方法易学且高效。

Coupling MALDI-TOF mass spectrometry protein and specialized metabolite analyses to rapidly discriminate bacterial function

04-05 DOI: 10.1073/pnas.1801247115

哪种测序平台更适合基于16S的肠道菌群研究？

Scientific data[IF:4.836]

① 比较了GS FLX+、Illumina MiSeq、PacBio等3种测序平台对170名韩国人粪便菌群系统发育分辨率的差异；② 与全基因组测序结果相比，PacBio数据与之相关性最弱，数据显示出更高的插入缺失水平，且富集于变形菌门；③ 尽管PacBio有读长优势，但是对菌群分类中，其分配序列的比例最低（39.4%），显示长读长并不能提高菌群系统发育分辨率；④ 不过，应该看到PacBio在16S rRNA基因测序中的适用性近年来不断加强，仍是一项有应用前景的研究平台。

The effects of sequencing platforms on phylogenetic resolution in 16?S rRNA gene profiling of human feces

04-24 DOI: 10.1038/sdata.2018.68

低聚木糖纤维缓解小鼠慢性肾病

Molecular Nutrition and Food Research[IF:4.323]

① 通过调节肠道菌群，饮食中的低聚木糖纤维（XOS）补充剂缓解腺嘌呤致慢性肾病（CKD）小鼠的肾脏损伤、显著降低小鼠血尿素氮、肌酸酐水平；② CKD对菌群的α多样性无影响，但XOS可降低小鼠盲肠肠道菌群的α多样性；③ 在CKD小鼠中富集的9个菌群中，有6个可被XOS降低；④ 盲肠的短链脂肪酸和丙酸含量与血尿素氮负相关，XOS增加短链脂肪酸的产量、降低尿素氮水平；⑤ XOS还能降低血液中对硫甲酚的浓度，原因可能与改变了的微生物酪氨酸代谢有关。

Effects of Prebiotic Fiber Xylooligosaccharide in Adenine induced Nephropathy in Mice

04-20 DOI: 10.1002/mnfr.201800014

肠道菌利用膳食多糖产生抗炎效果

Food Research International[IF:3.086]

① 人肠道中代表性菌种：青春双歧杆菌（Ba）、多氏拟杆菌（Bd）、植物乳杆菌（Lp）、大肠杆菌（Ec）和共生梭菌（Cs）单独/组合培养在菊粉或木聚糖为碳源的培养基中；② 菊粉中菌群生长较快且Ba和Lp为优势菌群，产较多乙酸和乳酸；③ 木聚糖中Bd和Cs为优势菌群，产大量丁酸；④ Bd和Cs联合培养在木聚糖中，产大量丁酸可降低TNF-α共培养的HT-29细胞表达IL-8；⑤ 微生物利用膳食多糖的过程复杂且依赖于基质性质，产较高丁酸的菌群组合具有抗炎作用。

Anti-inflammatory effect of microbial consortia during the utilization of dietary polysaccharides

04-11 DOI: 10.1016/j.foodres.2018.04.008

重庆医科大学：贵州农村布依族儿童的口腔菌群组成

Oral Diseases[IF:2.011]

① 选取40名贵州农村的布依族儿童（30名龋齿患者），分析口腔菌群组成；② 在健康儿童的乳牙期到替牙期期间，存在“健康的核心口腔菌群”，例如奈瑟氏菌属、卟啉单胞菌属、月形单胞菌属等；③ 在替牙早期，也存在“健康的核心口腔菌群”，例如奈瑟氏菌属、链球菌属、普氏菌属等；④ 龋齿组的主要细菌包括：放线菌科、链杆菌属；⑤ 非龋齿组的主要细菌包括：γ-变形菌门、巴斯德氏菌科、绿弯菌门等。

Metagenomic analysis of oral microbiome in young children aged 6-8 y living in a rural isolated Chinese province

04-18 DOI: 10.1111/odi.12871

川大王国庆等：Akk菌对糖尿病大鼠的益生作用

Pathogens and Disease[IF:2.335]

① 链脲霉素诱导的糖尿病大鼠及正常大鼠口服Akk菌；② 糖尿病大鼠口服活性或巴氏杀菌后的Akk菌，血液中的高密度脂蛋白浓度增加，肝糖原减少，血清中的纤溶酶原激活物抑制剂-1、TNF-α、脂多糖、丙二醛、胰高血糖素样肽-1降低；③ 另外，糖尿病大鼠口服Akk菌后，肠道菌群的物种α多样性及基因功能增加；④ Akk菌科改善糖尿病大鼠的肝功能，减少糖毒性/脂毒性，缓解氧化应激，抑制炎症，恢复正常的肠道菌群，从而缓解2型糖尿病。

Akkermansia muciniphila can reduce the damage of gluco/lipotoxicity, oxidative stress, and inflammation and normalize intestine microbiota in streptozotocin-induced diabetic rats

04-16 DOI: 10.1093/femspd/fty028