大连大数据与机器学习：医疗健康领域的必然

发布时间：2020-07-01 来源：大连胃肠医院

大数据与机器学习：医疗健康领域的必然趋势

今天是第704期日报。

JAMA：医疗健康领域的大数据与机器学习

JAMA[IF:44.405]

① 大数据和机器学习产生新算法，自动根据数据完成任务或作出决策，无需预设程序；② 深度学习模型，为复杂的人工神经元网络，可直接从原始数据中建立准确的模型，虽然对人类的指导需求较少，但需要海量数据以捕捉真实世界中的细节；③ 大数据的核心是可真实应用于卫生保健的机会；④ 机器学习并不是将数据转换成金子的神器，是传统统计学方法的自然延伸，是现代卫生保健系统有价值的和日益必要的工具，可节约医生的人力，影响数百万人的生命。

Big Data and Machine Learning in Health Care

03-12 DOI: 10.1001/jama.2017.18391

MM: 胆汁酸和肠-脑轴参与血糖调节

Molecular Metabolism[IF:6.799]

① 灌喂牛磺胆酸激发成纤维细胞生长因子（FGF）在回肠中的表达，提高瘦素缺乏（ob/ob）小鼠对葡萄糖的耐受；② 下丘脑神经元的FGF受体被激活后，通过抑制神经肽（AGRP/NPY）的表达沉默黑皮质素信号通路，提高对葡萄糖的耐受，该作用可能由植物神经介导；③ 下丘脑内源性FGF可能持续激活AGRP/NPY的表达，该作用可被内分泌型FGF通过拮抗作用抑制；④ 用短肽拮抗下丘脑内源性FGF，可在不引发低血糖的条件下改善葡萄糖耐受，降低日平均血糖。

A gut-brain axis regulating glucose metabolism mediated by bile acids and competitive fibroblast growth factor actions at the hypothalamus

02-01 DOI: 10.1016/j.molmet.2017.12.003

TEM：胆汁酸或为肠-脑轴通路的新信号

Trends in Endocrinology and Metabolism[IF:10.893]

① 胆汁酸可作为肠-脑轴通路中的信号物质，激发成纤维细胞生长因子(FGF)，通过受体FGFR1影响下丘脑相应神经元的刺鼠相关肽（AgRP）的表达，以此向大脑传递营养饱和信号，产生降糖作用；② 该糖代谢调节通路不需要依赖胰岛素；③ FGF1的降糖机制、FGFR1受体对血液中FGF15/19的感应情况、该肠-脑调节的下游通路以及是否利用植物神经等问题，尚待探究；④ AgRP可能调节胆汁酸生物合成和运输，与胆汁酸-FGF-AgRP通路形成回路，维持代谢稳态。

Hypothalamic Sensing of Bile Acids, a Gut Feeling

02-21 DOI: 10.1016/j.tem.2018.02.001

NAR：分析宏基因组基因多样性的高效新工具

Nucleic Acids Research[IF:10.162]

① GraftM是一个以基因为中心的，分析宏基因组内基因多样性的分类工具；② 该工具按需求构造基因特异性的GraftM包（gpkgs），使用HMM或DIAMOND比对工具，搜索宏基因组中的相应基因，并与pplacer程序预构建的新系统发生树比对，得出群落多样性信息；③ GraftM在科分类水平上的准确率在81%以上，保证分类结果一致性的前提下可将运算速度提高2-3.7倍；④ 对NCBI nr数据库、湿地环境宏基因组样品的数据分析结果良好；⑤ 通过使用不同的gpkgs扩展功能。

GraftM: a tool for scalable, phylogenetically informed classification of genes within metagenomes

03-19 DOI: 10.1093/nar/gky174

四川大学等：中老年人的肠道菌群特征及其与免疫老化的关联

Gut Pathogens[IF:2.756]

① 148例健康成年人分为中年组（50-59岁）和老年组（≥60岁）；② 与年龄负相关的菌属：别样杆菌、（中年组）脱硫弧和栖粪杆菌、（老年组）毛杆菌和草酸杆菌；③ 老年组中粪球菌属丰度显著升高，萨特氏菌属与年龄正相关；④ 拟杆菌门（中年组）和以Akk菌为代表的疣微菌门（老年组），与血清免疫球蛋白（两组分别对应IgG和IgA）水平和CD8+T细胞正相关、与CD4+/CD8+T细胞比值负相关；⑤ 衰老过程中，肠道菌群组成改变和多样性下降，或与免疫老化相关。

Possible correlation between gut microbiota and immunity among healthy middle-aged and elderly people in southwest China

02-09 DOI: 10.1186/s13099-018-0231-3

SR：在膀胱切除术患者中研究人体回肠菌群

Scientific Reports[IF:4.259]

① 收集实行膀胱切除+回肠尿路改道的27名老年患者的回肠样本，用16S rRNA测序分析回肠菌群；② 菌门层面，厚壁菌门和放线菌门在远端回肠丰度最高，变形菌门较少；③ 主要菌属包括链球菌属、颗粒链菌属、放线菌属、Solobaterium、罗氏菌属、孪生球菌属和TM7(G-1)，并鉴定出若干常见菌种；④ 远端回肠和结肠均拥有丰富的厚壁菌门，但前者多为兼性厌氧的杆菌纲，后者多为严格厌氧的梭菌纲；⑤ 这些患者的回肠菌群类似口腔菌群，与结肠菌群显著不同。

Species Level Description of the Human Ileal Bacterial Microbiota

03-16 DOI: 10.1038/s41598-018-23198-5

Gut：肝硬化患者血液循环中的菌群

Gut[IF:16.658]

① 分析7名失代偿性肝硬化患者的门静脉（肠入肝）、肝静脉、中央静脉、外周静脉血，鉴定出4个菌门65个菌属；② 不同于粪便菌群，静脉血中主要是变形菌门；③ 不同静脉血中未发现菌群整体结构特征，但存在数个菌属的丰度差异；④ 体外成功培养了患者血液中的葡萄球菌属和不动杆菌属，说明血液中的菌群有活性；⑤ 患者血液中的炎性细胞因子与血液中的特定菌属相关，表明血液循环中的菌群与系统性炎症可能存在关联。

Circulating microbiome in blood of different circulatory compartments

03-26 DOI: 10.1136/gutjnl-2018-316227

Lancet：或可用于治疗NASH的新药

Lancet[IF:47.831]

① Harrison等采用NGM282治疗82例NASH受试者，用药12周；② 治疗组肝脂肪绝对含量减少，血清转氨酶下降，炎症和纤维化标志物恢复，但11%患者因不良事件提前终止治疗；③ 应注意FGF-19诱导的血脂异常增加心血管疾病风险，因为NASH患者心血管疾病所致死亡高于肝病；④ NASH为慢性病，数十年间少部分纤维化的NASH患者进展为肝硬化；⑤ 需要长期的试验验证其疗效和全部不良事件，NGM282相关的不良事件特征和生理学作用提示该剂量下长期给药的难度。

FGF-19 agonism for NASH: a short study of a long disease

03-05 DOI: 10.1016/S0140-6736(18)30425-2