大连曙光!对抗多重耐药菌的强力新武器!
曙光!对抗多重耐药菌的强力新武器!
今天是第651期日报。
Science子刊:新型抗菌肽SAAP-148降服多重耐药细菌
Science Translational Medicine[IF:16.796]
① 人LL-37免疫调节蛋白的衍生物SAAP-148蛋白,在血浆内稳定性高,杀菌活性比大部分受检测的抗菌蛋白强;② 该蛋白杀菌能力与剂量有关,反复使用未引发多重耐药菌的耐药性,可清除生物被膜和持留菌,防止生物被膜产生;③ 该蛋白破坏细胞膜的稳定性、改变渗透压,达到广谱杀菌效果;④ 该蛋白可被安全地外敷使用,外敷软膏处理实验鼠体表和离体人皮肤上的伤口,四小时可清除耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和多重耐药鲍曼不动杆菌及其生物被膜。
The antimicrobial peptide SAAP-148 combats drug-resistant bacteria and biofilms
2018-01-10 DOI: 10.1126/scitranslmed.aan4044
Nature子刊:多形拟杆菌的多糖利用位点如何协同合作降解果胶?
Nature Microbiology[IF:N/A]
① Luis等人的最新研究发现,人体内的拟杆菌属(多形拟杆菌)通过多个多糖利用位点(PUL)的协同合作,降解复杂的碳水化合物(果胶多糖);② 不同的PUL编码不同家族的糖苷水解酶,形成的复合体可使鼠李半乳糖醛酸聚糖-I(RGI)骨架解聚,并去除粘附于RGI上的果胶结构域;③ 细菌如何感知并调节PUL中的复杂酶系统的表达仍有待研究,生物信息学分析发现,各个PUL编码的多肽中有一段保守序列,其N端可能为感知结构域。
Let them eat fruit
2018-01-22 DOI: 10.1038/s41564-018-0108-8
Nature子刊:多形拟杆菌是怎样降解果胶多糖的?
Nature Microbiology[IF:N/A]
① 拟杆菌属通过多糖利用位点(PUL)降解复杂的碳水化合物,在多形拟杆菌中,果胶的不同结构域可激活PUL;② PUL编码不同的糖苷水解酶,包括2个之前未知的糖苷水解酶家族,多种酶形成复合体通过协同作用以降解果胶分子,例如:可使复杂的鼠李半乳糖醛酸聚糖-I骨架解聚;③ 这套多糖降解系统中含有几种糖苷水解酶,可去除粘附于鼠李半乳糖醛酸聚糖-I的果胶结构域;④ 以及9种可降解构成鼠李糖-GalA重复单元的骨架的酶。
Dietary pectic glycans are degraded by coordinated enzyme pathways in human colonic Bacteroides
2017-11-18 DOI: 10.1038/s41564-017-0079-1
MNFR:水苏糖调节2型糖尿病大鼠的肠道菌群并改善炎症
Molecular Nutrition and Food Research[IF:4.323]
① 2型糖尿病大鼠随机分为三个组:对照组、水苏糖(STS)组、二甲双胍(MET)组,评估STS对2型糖尿病大鼠的影响及肠道菌群的变化;② STS或MET可降低血清脂多糖、IL-6和TNF-α的mRNA表达;③ STS和MET引起相似的肠道菌群结构变化和关键物种的选择性富集;④ 在属水平,STS选择性富集考拉杆菌属等五种菌属,而MET主要富集萨特氏菌属等4种菌属;⑤ STS通过影响肠道菌群的关键物种,降低胰腺中IL-6和TNF-α的mRNA表达,其机制与MET相似。
Stachyose Improves Inflammation Through Modulating Gut Microbiota of High-Fat Diet / Streptozotocin Induced Type 2 Diabetes in Rats
2018-01-16 DOI: 10.1002/mnfr.201700954
MNFR:不同饮食成分如何调节肠道菌群而影响结肠肿瘤发生
Molecular Nutrition and Food Research[IF:4.323]
① 研究胆酸、丁酸钠、高脂饮食或不同剂量的二氢杨梅素与肠道菌群的相互作用,发现这些膳食因素都可影响肠道菌群组成和结肠肿瘤发生;② 丁酸盐可通过富集普雷沃氏菌科,在宿主的结肠炎相关结肠癌中起保护作用;③ 胆酸作为高脂饮食的代谢产物之一,可抑制感染性细菌,且与低度炎症结肠癌相关;④ 二氢杨梅素可通过在结肠增生阶段维持低浓度丁酸盐,并作为氯离子通道活化剂,低剂量使用时可改善菌群,减少结肠肿瘤易感性。
Dietary Factors Modulate Colonic Tumorigenesis Through the Interaction of Gut Microbiota and Host Chloride Channels
2018-01-13 DOI: 10.1002/mnfr.201700554
FM:新生梅花鹿的小肠菌群及代谢组发育
Frontiers in Microbiology[IF:4.076]
① 分别于新生梅花鹿出生后的第1、42和70天,分析其空肠和回肠的肠道菌群和代谢组学;② 菌群的多样性和丰度随着时间而增加,出生第一天存在高度个体差异性;③ 三个时间点的菌群组成具有显著差异,盐单胞菌属、乳杆菌属、埃希氏杆菌属-志贺氏菌属、拟杆菌属丰度随时间呈下降趋势,Cellulosilyticum等菌属的比例显著增加;④ 三个时间点的代谢物有显著差别,蛋氨酸、苏氨酸和腐胺的含量随时间增加,而肉豆蔻酸和十五烷酸的含量随时间降低。
The development of microbiota and metabolome in small intestine of sika deer (Cervus nippon) from birth to weaning
2018-01-23 DOI: 10.3389/fmicb.2018.00004
CI:“有气味”的人体菌群季节性变化
Chronobiology International[IF:2.562]
① 从2010年至2017年,利用美国的谷歌趋势搜索量和季节模型对人体一些体味进行研究;② 相比零模型,季节模型可显著地更好拟合人体体味,直观地观察变化;③ 季节性因素解释了88%肠胃气、65%腋窝气味、60%脚臭和58%口臭的变化性;④ 肠胃气和口臭往往在1月份达到高峰,脚臭在2月份,腋窝气味在7月份;⑤ 不愉快的体味随季节变化发生很大改变,其峰值和低谷随身体部位的不同而变化,参与产生体味的共生菌群的组成变化或也存在类似的季节性变化。
Population level evidence for seasonality of the human microbiome
2018-01-17 DOI: 10.1080/07420528.2018.1424718
Microbiome:耕作方法影响土壤和根系菌群
Microbiome[IF:8.496]
① 调查不同管理类型(常规、有机)和耕作强度(免耕、少耕、密集耕种),对土壤和小麦根系菌群的影响;② 土壤中,细菌群落主要与耕作强度有关,真菌群落则对管理类型有明显反应;③ 根系中,细菌也受管理类型影响,真菌则随耕作强度变化;④ 耕作方法可解释约10%的菌群变化,耕作敏感菌种类多样,且对耕作方法呈类群式反应,了解其丰度模式可优化植物生长和农业可持续性;⑤ 可通过耕作方法实现菌群操纵,为开发智能农业菌群管理奠定基础。
Cropping practices manipulate abundance patterns of root and soil microbiome members paving the way to smart farming
2018-01-16 DOI: 10.1186/s40168-017-0389-9
PNAS:昆虫内共生菌在进化中分裂为多个谱系
PNAS[IF:9.661]
① 智利的蝉科Tettigades属的昆虫体内,不同谱系的Hodgkinia cicadicola菌株组成内共生菌复合体,同一宿主中存在2-6支不同谱系;② Hodgkinia在4百万年内至少经历6次分化,谱系间基因组结构、大小和基因丰度差别显著;③ 不同谱系的基因组缺失方式差别显著,推测复合体通过基因组互补,行使始祖菌株的完整基因组功能;④ Hodgkinia共生菌复合体间的差异性,预示谱系分化仍在继续;⑤ 这是稳定性丧失导致基因组缺失的又一例证,类似线粒体基因组。
Multiple origins of interdependent endosymbiotic complexes in a genus of cicadas
2017-12-26 DOI: 10.1073/pnas.1712321115
感谢本期日报的创作者:小肠君,沈志勋,女巫,兵兵,this little piggy,小扣啊
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