大连Cell+Nature+Science：菌群研究就是“壕”~

发布时间：2020-07-08 来源：大连胃肠医院

Cell+Nature+Science：菌群研究就是“壕”~

今天是第638期日报。

Cell：皮肤共生菌诱导CD8+T细胞并促进伤口愈合

Cell[IF:30.410]

① 通过小鼠和细胞实验发现，皮肤共生菌群可诱导一种兼有抗感染和组织修复功能的适应性免疫；② 皮肤表面的表皮葡萄球菌衍生的fMet多肽，经树突细胞上H2-M3 MHCIb分子呈递给CD8+T细胞（主要是Tc1和Tc17细胞），使这些T细胞聚集到创口处；③ RNA-seq分析表明，被表皮葡萄球菌诱导的CD8+T细胞，除表达免疫效应基因外，多种免疫调节和组织修复相关基因（Vegf, Fgf, Pdgf, Areg, Mmp等）的表达水平上升；④ 共生菌特异的CD8+T细胞可促进伤口愈合。

Non-classical Immunity Controls Microbiota Impact on Skin Immunity and Tissue Repair

2018-01-18 DOI: 10.1016/j.cell.2017.12.033

Nature：子宫里的胎儿有菌无菌？可能有但争议犹存

Nature[IF:40.137]

① 科学界一直认为胎儿在母体内是处于无菌环境中，而近期研究表明人体的初始菌群定殖可能发生在出生前；② 2014年Aagaard等人从320名女性的胎盘内部取样，在严格无菌和实验对照下，通过基因测序在部分胎盘中检测出细菌DNA；③ 其他研究也有类似报导，有些研究表明在羊水和胎便中也存在细菌，也有动物实验支持胎儿在母体内获得菌群的假说；④ 然而争议尚存，最主要的一点是实验过程中是否存在细菌及其DNA的污染，相关研究仍在进行。

Could baby’s first bacteria take root before birth?

2018-01-17 DOI: 10.1038/d41586-018-00664-8

Science：霍乱弧菌拮抗肠道菌群以提高毒力与适应性

Science[IF:37.205]

① 霍乱弧菌的VI型分泌系统（T6SS）是一种纳米机器，将毒性效应蛋白递送到靶细胞中并杀伤细胞；② 在小鼠体内发现，T6SS可攻击宿主共生菌群的成员，促进了病原体对肠道的定殖；③ 这种菌群间的拮抗互作通过增强细菌的肠道定殖、毒力基因表达，并激活宿主的先天性免疫基因，以驱动霍乱弧菌的致病性显著增加；④ 霍乱弧菌对肠道菌群的拮抗作用通过提升其传播至新的易感宿主中的能力，增加了其在小鼠体内的适应性。

Antagonism toward the intestinal microbiota and its effect on Vibrio cholerae virulence

2018-01-12 DOI: 10.1126/science.aap8775

NC：肠道菌群发育不成熟，或触发儿童哮喘的遗传风险

Nature Communications[IF:12.124]

① 人体肠道菌群的组成在出生后的第一年内即发育成熟，该阶段的菌群组成变化可能与免疫失调相关，或可导致哮喘；② 对690名儿童出生后第一年内的肠道菌群组成进行分析，发现拥有不成熟的菌群组成的1岁儿童，在5岁时拥有更高的哮喘风险；③ 菌群发育不成熟与哮喘的关联，仅在那些母亲也患有哮喘的儿童中显著，提示出生后第一年内缺少菌群的刺激，可触发哮喘的遗传。

Maturation of the gut microbiome and risk of asthma in childhood

2018-01-10 DOI: 10.1038/s41467-017-02573-2

Gut：胎儿期而非婴儿期接触抗生素，或增加IBD风险

Gut[IF:16.658]

① 基于2006-2013年在瑞典出生的827239名儿童，评估妊娠期或婴儿期使用抗生素与和非常早期的炎症性肠病（VEO-IBD）之间的关联；② 胎儿期接触抗生素的儿童与对照组儿童相比，IBD的发病风险增加，溃疡性结肠炎（UC）及克罗恩病（CD）的风险均增加；③ 排除IBD诊断前12个月内发生肠胃炎的儿童，胎儿期接触抗生素与IBD的关联不再显著，与CD的关联仍显著；④ 婴幼儿时期接触抗生素的儿童，UC及CD发病风险均未显著增加。

Fetal and early life antibiotics exposure and very early onset inflammatory bowel disease: a population-based study

2018-01-10 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-314352

Gut：与IBS风险增加相关的蔗糖酶-异麦芽糖酶基因突变

Gut[IF:16.658]

① 在7个家族性肠易激综合征（IBS）病例中，对蔗糖酶-异麦芽糖酶（SI）的外显子进行测序；② 相比于健康对照，先天性蔗糖酶-异麦芽糖酶缺陷（CSID）突变在IBS患者中更为常见；③ 15Phe在6/7的病例中可被检测到，这一突变与IBS风险增加相关；④ 15Phe等位基因的剂量与排便频率、粪便菌群中Parabacteroides的丰度显著相关；⑤ 带有15Phe的SI蛋白，在体外表现出显著降低（降低35%）的酶活性。

Functional variants in the sucrase-isomaltase gene associate with increased risk of irritable bowel syndrome

2018-02-01 DOI: 10.1136/gutjnl-2016-312456

Gut：饮食淀粉或肠道菌群或都是IBS高风险人群病发的促因

Gut[IF:16.658]

① Henstr?m等人在一项最新研究中报道，编码蔗糖酶-异麦芽糖酶（SI）基因中存在一个突变（15Phe，rs9290264）；② 带有该突变的SI在体外酶活性降低35%，该突变增加了肠易激综合征（IBS）的风险，并且与排便频率显著相关；③ 在2个德国人群中进行横断面研究，发现SI 15Phe相关的IBS风险增加在较少食用淀粉的个体中更为显著；④ 在携带SI 15Phe突变的个体中，IBS患者粪便菌群中Blautia菌属的丰度更高。

Sucrase-isomaltase 15Phe IBS risk variant in relation to dietary carbohydrates and faecal microbiota composition

2017-12-29 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315841

Gut：质子泵抑制剂使用增加胃癌风险？尚无定论

Gut[IF:16.658]

① Cheung等人报道了进行根除幽门螺旋杆菌（HP）治疗的患者在长期使用质子泵抑制剂（PPI）后，胃癌风险增加，这一发现引起了广泛争论；② 但PPI与胃癌的关联还不应下定论，首先，两项meta分析表明，胃癌与长期使用PPI并无显著关联，而另一项meta分析表明PPI使用与胃癌风险增加40%相关；③ 其次，PPI使用者通常同时患有心血管及代谢疾病，本身就有较高的胃癌风险；④ 另外，Cheung等人的研究并未充分评估HP根除治疗的影响。

Risk factors for gastric cancer: is it time to discard PPIs?

2017-12-24 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315621