大连宏转录组炙手可热，菌群秘密将被更精确

发布时间：2020-07-08 来源：大连胃肠医院

宏转录组炙手可热，菌群秘密将被更精确揭示~

今天是第637期日报。

Nature子刊：老年男性粪便菌群中的宏转录组

Nature Microbiology[IF:N/A]

① 收集308名成年男性（65-81岁）的粪便菌群，分析372份宏转录组样本及929份宏基因组样本；② 鉴定出了宏转录组中的“核心”，包括19个核苷酸生物合成通路、19个糖酵解及碳水化合物代谢通路、15个氨基酸合成通路、非氧化戊糖磷酸循环通路等；③ 在“核心”转录组之外，还鉴定出了宏转录组中的“可变”部分，包括长链脂肪酸、萜类化合物、多胺、辅因子、(p)ppGpp信号素的生物合成通路、酒精、糖类降解通路、硫酸盐还原通路等。

Metatranscriptome of human faecal microbial communities in a cohort of adult men

2018-01-15 DOI: 10.1038/s41564-017-0084-4

Nature子刊：老年男性的粪便宏基因组比宏转录组稳定

Nature Microbiology[IF:N/A]

① 对308名老年男性（65-81岁）的粪便菌群的宏转录组及宏基因组进行测序分析；② 受试者共提供4份粪便样本，前两份（相隔24-72小时）与后两份（相隔24-72小时）之间间隔6个月；③ 粪便菌群的个体内分类学及功能差异始终低于个体间的差异，但在宏转录组上，个体内的差异及个体间差异的程度相似；④ 宏基因组稳定性高于宏转录组，宏基因组不稳定性约占相应宏转录组不稳定性的74%；⑤ 拟杆菌属/链球菌属分别是最稳定/最不稳定的转录组的主要贡献者。

Stability of the human faecal microbiome in a cohort of adult men

2018-01-15 DOI: 10.1038/s41564-017-0096-0

Nature子刊：转录组揭示IBD患者的菌群基因表达水平复杂性

Nature Microbiology[IF:N/A]

① 分析炎症性肠病患者和对照个体多个时间点的肠道菌群，得到78个配对的宏基因组和宏转录组及额外222个宏基因组数据；② 很多菌的丰度与其基因表达水平相符，但有些菌种在某些通路的转录活性上起主导作用（如普拉梭菌），对肠道健康可能极为重要；③ 有些菌虽含量丰富，活性却很低；④ 有些菌虽在患者和健康个体中含量差异不大，但基因表达水平差异很大（如普通拟杆菌）；⑤ 整合宏转录组和宏基因组数据，对研究菌群在疾病中的作用机制至关重要。

Dynamics of metatranscription in the inflammatory bowel disease gut microbiome

2018-01-08 DOI: 10.1038/s41564-017-0089-z

Lancet子刊：减肥手术或增加患者的自杀及自残风险

The Lancet Diabetes and Endocrinology[IF:19.742]

① 选取超过20000名接受过减肥手术的肥胖患者，及约16000名接受强化生活方式干预的肥胖患者进行对比分析；② 相比于接受生活方式干预的患者，自杀或非致命性自残行为在接受过减肥手术的患者中更高；③ 三种不同的减肥手术（胃旁路术、胃束带手术、垂直捆绑式胃形成术）均与较高的自杀或自残风险相关；④ 药物滥用比例在接受过减肥手术的患者中显著升高；⑤ 减肥手术与自杀/自残风险升高相关，但绝对风险较低，需在手术前对患者进行精神病史评估。

Risk of suicide and non-fatal self-harm after bariatric surgery: results from two matched cohort studies

2018-01-09 DOI: 10.1016/S2213-8587(17)30437-0

Lancet：进行减肥手术，需关注患者的精神病史

The Lancet Diabetes and Endocrinology[IF:19.742]

① 减肥手术是广泛使用的治疗严重肥胖及肥胖并发症的有效治疗方法；② 但减肥手术也存在副作用，Martin Neovius等人在一项最新的研究中发现，相比于接受生活方式干预的患者，接受减肥手术的患者自杀或自残的风险显著升高；③ 三种减肥手术（胃旁路术、胃束带手术、垂直捆绑式胃形成术）与自杀或自残风险的升高均显著相关；④ 肥胖患者通常表现出明显的精神病理学，减肥手术不一定是造成自杀/自残行为的原因。

Bariatric surgery: many benefits, but emerging risks

2018-01-09 DOI: 10.1016/S2213-8587(17)30435-7

PO：基于家庭的行为干预帮助肥胖儿童有效减肥（综述）

Pediatric Obesity[IF:3.400]

① 80%的儿童肥胖会延续到成人阶段，早期干预至关重要；② 基于家庭的行为干预（FBT）针对肥胖儿童及家长，通过使用行为改变策略（设立目标、自我监督、家庭奖励、刺激控制等）达到有效减肥和长期维持体重的目的；③ 关键要素包括改变饮食习惯、增加能量消耗、家庭的参与和支持、改变社会环境等；④ 未来应加强FBT的个性化干预，并在基层医疗中加入行为健康要素，FBT对肠道菌群的影响、及其在患有精神疾病的共病患儿中的作用也是未来研究方向。

Family-Based Behavioral Interventions for Childhood Obesity

2017-10-12 DOI: 10.1007/978-3-319-68192-4_32

Gut：菊粉或改善血管内皮功能紊乱，但还需更精确证据

Gut[IF:16.658]

① Catry等人的研究表明，菊粉型果聚糖可在饮食缺少n-3不饱和脂肪酸的apoE基因敲除小鼠中，改变肠道菌群构成，使产NO细菌增多并活化NO合成通路，逆转血管内皮功能紊乱；② 益生元干预可改变肠道菌群，进而改善血管内皮情况，这为预防心血管疾病提供了新思路；③ 然而，基于16S测序等技术的菌群构成分析还难以细化到菌种和菌株，而菌群构成的细微变化可对功能产生很大影响，因此根据这些数据推断菌群功能、阐释机制时需谨慎。

Endothelial dysfunction: what is the role of the microbiota?

2017-06-28 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-314012

FC：刺梨果多糖的潜在益生作用

Food Chemistry[IF:4.529]

① 热水法提取刺梨果获得的水溶性多糖（ RTFP），糖醛酸和蛋白质含量分别为14.8?±?0.06%和4.10?±?0.58%；② 单糖组成为阿拉伯糖：半乳糖：葡萄糖：甘露糖：木糖：海藻糖（33.8：37.3：20.7：1.74：3.43：2.9）；③ 具有良好的持油性、发泡性，乳化性，典型的剪切性和粘弹性；④ 对α-葡糖苷酶（混合抑制类型）和α-淀粉酶（非竞争性抑制类型）具有良好的抑制活性；⑤ RTFP可开发成多功能添加剂或降血糖剂，应用于食品、药品和化妆品。

Physicochemical, functional, and biological properties of water-soluble polysaccharides from Rosa roxburghii Tratt fruit

2017-05-30 DOI: 10.1016/j.foodchem.2018.01.011