大连人类的菌群，是如何一步步进化到现在的

发布时间：2020-07-08 来源：大连胃肠医院

人类的菌群，是如何一步步进化到现在的样子的？

今天是第631期日报。

BMCB：人体微生物组的进化（综述）

BMC Biology[IF:6.779]

① 不同种群的人类体内微生物组差异显著，但在高级灵长类动物的比较中，人类自身的差异就很小了；② 将视角放大到脊椎动物谱系，可知物种进化对微生物组影响显著，进化上越相近的物种微生物组越相似；③ 宿主体内的微生物组进化的可能机制：宿主为肠道菌群设定多种过滤器，使菌群更加多样化；④ 某种微生物进化后获得某个功能，与宿主某个基因的功能相似；⑤ 当宿主的基因组发生突变，该基因功能丢失后，含有进化后的物种的微生物组适应性更高。

The human microbiome in evolution

2017-12-27 DOI: 10.1186/s12915-017-0454-7

Gut：PPI促胃癌？认定是否使用PPI的方法可能存在问题

Gut[IF:16.658]

① Cheung等人报道，在幽门螺旋杆菌（HP）清除治疗后使用质子泵抑制剂（PPI），与胃癌风险增加相关；② 但胃癌风险与PPI使用的显著关联可能来自于两种与时间相关的偏差；③ 第一种偏差：一些患者在接受HP清除治疗后的某个时间段内可能使用过PPI，并且未诊断出胃癌，可能被错误认定为非PPI使用者；④ 第二种偏差：一些患者在接受HP清除治疗后的某个时间段内可能使用过PPI，但在很久后才被诊断出胃癌，可能被错误认定为非PPI使用者。

Proton-pump inhibitors and increased gastric cancer risk: time-related biases

2018-01-03 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315729

AR：疾病易感性或与遗传背景对肠道菌群的影响有关

Arthritis and Rheumatology[IF:6.918]

① 肠道菌群介导大鼠中HLA-B27转基因诱发的脊柱关节炎；② 分析3种遗传背景的HLA-B27转基因大鼠的炎症状况、基因表达和肠道菌群构成；③ Lewis和Fischer大鼠均发生肠道炎症且免疫失调情况相似，由结肠和盲肠中IL-23/IL-17、IFN等细胞因子和通路的激活导致，而DA大鼠中细胞因子失调低水平且无炎症；④ HLA-B27转基因对肠道菌群的影响在不同遗传背景下显著不同，Lewis和Fisher大鼠有所重叠，DA大鼠则缺乏促进CD4+Th17 T细胞发育的分节丝状细菌。

Effects of HLA-B27 on Gut Microbiota in Experimental Spondyloarthritis Implicate an Ecological Model of Dysbiosis

2017-12-29 DOI: 10.1002/art.40405

EJN：孕期补充益生菌，改变基因甲基化

European Journal of Nutrition[IF:4.370]

① 孕期补充益生菌或可减少产后肥胖和子女体重过度增长的风险；② 15位孕妇随机分成益生菌组（n=7）和对照组（n=8），分析与肥胖和体重增加相关基因的DNA甲基化状态；③ 相比对照组，益生菌组妇女的DNA甲基化水平在37个基因启动子中显著降低，在1个启动子中升高；④ 益生菌组的子女中68个基因启动子DNA甲基化水平显著降低；⑤ 孕期补充益生菌可影响产妇及其后代的肥胖和体重增加相关基因的DNA甲基化状态，进而影响健康，该结论仍需进一步验证。

The impact of probiotic supplementation during pregnancy on DNA methylation of obesity-related genes in mothers and their children

2018-01-03 DOI: 10.1007/s00394-017-1601-1

Inflammopharmacology：益生菌治疗类风湿关节炎，似乎无效

Inflammopharmacology[IF:2.590]

① 共计153名受试者的4项随机对照试验纳入荟萃分析；② 与安慰剂相比，补充益生菌并没有显著性地改变炎症参数（红细胞沉降率、TNF-α、IL1β、IL-6、IL-10、IL-12）和氧化应激指标（总抗氧化能力和丙二醛含量）;③ C反应蛋白显著降低，疾病活动度评分（DAS）显著提高；④ 由于试验数量太少，无法确定是否存在应变、剂量或持续反应效应；⑤ 益生菌在类风湿关节炎治疗中似乎没有多大疗效，需要进一步的证据得出确切的结论。

The efficacy of probiotic supplementation in rheumatoid arthritis: a meta-analysis of randomized, controlled trials

2018-01-04 DOI: 10.1007/s10787-017-0436-y

EJCN：合生元或可缓解部分囊性纤维化青少年儿童患者的炎症

European Journal of Clinical Nutrition[IF:3.057]

① 评估合生元补充剂对儿童/青少年囊性纤维化（CF）患者炎症反应的影响；② 招募17名对照组（CG）、19名安慰剂-CF组（PCFG）和22名合生元-CF组（SCFG）进行随机、安慰剂对照双盲临床试验；③ 肺功能标志物（FEV1）和营养状态标志物的基线和最终评估之间无显著差异；④ 在PCFG和SCFG组之间，发现IL-12和髓过氧化酶之间显著的相互作用；⑤ 在SCFG组补充合生元后，一氧化氮代谢物（NOx）显著减少；⑥ 在细菌学阳性SCFG中，补充后发现IL-6和IL-8减少。

Effect of synbiotic supplementation in children and adolescents with cystic fibrosis: a randomized controlled clinical trial

2017-12-26 DOI: 10.1038/s41430-017-0043-4

ACS：做韩式泡菜时加点膨润土，菌群构成有变化

Applied Clay Science[IF:3.101]

① 采集自韩国不同区域、经处理含不同矿物质（钠、钾、镁）的膨润土，添加至泡菜中发酵；② 发酵初始，泡菜中菌群表现出多样性；③ 发酵10天后，魏斯氏菌属、乳杆菌属和乳球菌属为优势菌群，占菌群数量的大部分；④ 不同膨润土处理的泡菜样品中7种核心乳酸菌种（L. gelidum、L. gasicomitatum、W. koreensis、 L. citreum、 L. lactis、 L. sakei,和W. cibaria）的相对丰度有明显差异；⑤ 粘土矿物质可改变泡菜发酵过程的菌群，改善风味及其功能。

Impact of clay minerals on bacterial diversity during the fermentation process of kimchi

2017-12-30 DOI: 10.1016/j.clay.2017.12.018

Microbiome：鼻拭子样本或可用于婴儿的支气管炎诊断

Microbiome[IF:8.496]

① 对入院的815名支气管炎婴儿的鼻拭子和鼻咽吸出样本进行16S rRNA 基因测序；② 个体两个部位的菌群间存在很强的相关性，都含有较高丰度的嗜血杆菌和莫拉克斯氏菌属；③ 但也存在较大差异，葡萄球菌属在鼻拭子样品中相对丰度较高，在鼻咽吸出样本很少，可能是样品处理方法带来的差异，后续还需验证；④ 尽管个体之间鼻拭子和鼻咽吸出样本的处理方法和菌群存在差异，菌群之间也存在大量重叠，表明鼻拭子可以为年幼儿童的诊断提供有用的样本。

The association between anterior nares and nasopharyngeal microbiota in infants hospitalized for bronchiolitis

2018-01-03 DOI: 10.1186/s40168-017-0385-0