大连菌群移植爆火，加强监管的声音也爆大

发布时间：2020-07-10 来源：大连胃肠医院

菌群移植爆火，加强监管的声音也爆大

今天是第610期日报。

Science：如何对菌群移植加强监管？

Science[IF:37.205]

① 目前进行的粪菌移植中，部分使用的是患者的亲戚或朋友提供的未经感染性病原体检测的粪便，部分使用的是经检测的来自粪便银行的粪便，但对于后者缺少监管措施；② 粪菌移植应作为药物进行监管，除了用于治疗艰难梭菌感染或满足临床创新条件，进行粪菌移植应新药临床试验申请；③ 粪便银行储存的供体粪便需进行监管，需对供体进行筛选及检测并提供安全性数据；④ 从粪便中培养的细菌、特定细菌的组合也需要像其它生物制品或药品一样进行监管。

Improving regulation of microbiota transplants

2017-12-15 DOI: 10.1126/science.aaq0034

CTI：肠道菌群显著影响幼年动物发育（综述）

Calcified Tissue International[IF:3.124]

① 肠道菌群对宿主幼体的成长具有明显作用，尤其是在次优营养条件下；② 结合遗传学、发育生物学等学科工具，已对果蝇、线虫、大型蚤、斑马鱼、鸡、小鼠的肠道菌群对宿主幼体生长的影响进行了广泛研究；③ 在小鼠模型中发现，即使在最佳的饮食条件下，无菌幼年小鼠的生长速率较慢，但干净的环境可促进生长；④ 亚临床或间断性使用抗生素可促进生长，益生菌可通过与生长激素轴互作促进生长，NOX及细胞保护通路调控肠道细胞增殖对菌群的应答。

Gut Microbiota and Host Juvenile Growth

2017-12-06 DOI: 10.1007/s00223-017-0368-y

FM：可预测婴儿肠道菌群代谢互作的数学模型

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 利用包含了4种肠道细菌（婴儿长双歧杆菌、大肠杆菌、嗜酸乳杆菌、普通拟杆菌）及1种底物（低聚果糖）的系统获取体外代谢数据，并建立包含了代谢共享和抑制的数学模型；② 经参数优化，该模型准确预测了菌群丰度，实验数据与预测的低聚果糖消耗量和产酸量相关性好，婴儿长双歧杆菌亚种和嗜酸乳杆菌占主导地位；③ 婴儿肠道菌群的活性及丰度变化可由代谢互作解释，可应用Monod动力学建立互作模型。

Modeling Metabolic Interactions in a Consortium of the Infant Gut Microbiome

2017-12-14 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02507

COM：系统生物学在细菌研究领域的应用

Current Opinion in Microbiology[IF:6.635]

① 细菌系统生物学依靠大型数据集的分析及建模完成对细菌功能和特性的系统性综合研究，其研究领域广泛而多样；② 研究的开展得益于DNA/RNA下一代测序、蛋白质组学、代谢组学、全基因组遗传方法等技术的进步；③ 目前系统生物学在各类细菌研究领域的最新应用包括：全基因组RNA调控研究、系统级蛋白质组学方法研究；④ 以及蛋白质-代谢物相互作用空间的综合测绘、系统生理学、宿主-病原体互作的系统级研究、菌群功能障碍与药物干扰的全球性分析。

Editorial overview: Bacterial systems biology

2017-12-11 DOI: 10.1016/j.mib.2017.11.024

Nutrients：混合益生元预防小鼠的肠易激综合征

Nutrients[IF:3.550]

① 在动物和细胞水平揭示由低聚果糖、低聚半乳糖、菊粉和花青素组成的新的混合益生元（PB）可有效预防肠应激综合征（IBS）；② 感染后IBS（PI-IBS）小鼠模型用PB、PB+益生菌菌株处理8周；③ PB使PI-IBS模型和感染鼠伤寒沙门氏菌14028的Caco-2细胞的促炎细胞因子表达量显著降低；④ PB可显著改善因感染造成的体重减少、闭合蛋白OCLN表达量减少以及肠道菌群结构改变；⑤ 蛋白质组学揭示这一变化与过氧化物酶增殖体激活受体γ（PPAR-γ）通路有关。

A Novel Prebiotic Blend Product Prevents Irritable Bowel Syndrome in Mice by Improving Gut Microbiota and Modulating Immune Response

2017-12-09 DOI: 10.3390/nu9121341

JI：CCL28缺陷减少小鼠的IgA分泌细胞，并改变结肠菌群

Journal of Immunology[IF:4.856]

① CCL28缺陷小鼠粪便提取物种的总IgA及抗原特异性IgA浓度显著减少，结肠中单个IgA分泌细胞（ASC）分泌的平均IgA水平降低结肠固有层中的IgA ASC减少且分布异常；② 在体外，CCL28可显著增加单个IgA ASC分泌的平均IgA水平；③ 派尔集合及盲肠淋巴结中的IgA ASC不受CCL28缺陷的影响；④ CCL28缺陷小鼠粪便提取物中的芽孢杆菌纲增加，提示CCL28对蜡样芽胞杆菌及粪肠球菌的抗菌活性；⑤ CCL28缺陷小鼠的DSS诱导结肠炎恶化，抗生素处理可缓解。

CCL28-Deficient Mice Have Reduced IgA Antibody-Secreting Cells and an Altered Microbiota in the Colon

2017-12-13 DOI: 10.4049/jimmunol.1700037

SR：分娩期间，阴道菌群多样性上升

Scientific Reports[IF:4.259]

① 收集256名女性在孕期第36周及分娩时的阴道拭子，分析菌群组成；② 个体的阴道菌群随时间变化表现得较为稳定，某些细菌科为混合群落状态类型（CST）IV的特征，在分娩时增加；③ 在孕期第36周至分娩期间，阴道菌群的α-多样性趋向于增加；④ 在大多数女性中，阴道菌群CST在研究期间保持不变，一些女性的CST发生变化，约一半转换为CST IV；⑤ CST IV与阴道疾病、早产及婴儿出生体重无显著关联，益生菌补充不影响阴道菌群。

Diversity of vaginal microbiota increases by the time of labor onset

2017-12-14 DOI: 10.1038/s41598-017-17972-0

Microbiome：鉴定出第四类迁移性磺胺类药物耐药基因

Microbiome[IF:8.496]

① 从被污染的印度河流沉积物中提取DNA，利用3套靶向第一类整合子的引物进行分析；② 鉴定出的开放阅读框中，至多有89%编码已知的耐药基因；③ 鉴定出一些新的抗生素耐药基因，包括氨基糖甙类、β-内酰胺类、甲氧苄氨嘧啶、利福平、氯霉素、碳青霉烯类等；④ 鉴定出一种新的二氢蝶酸合成酶基因，与已知的3种迁移性磺胺类药物耐药基因的氨基酸相似性不到34%；⑤ 在大肠杆菌中表达后，可提供完整的磺胺类药物耐药性。

Discovery of the fourth mobile sulfonamide resistance gene

2017-12-15 DOI: 10.1186/s40168-017-0379-y