大连社会性的细菌：群落特性 ≠ 细菌属性相

发布时间：2020-07-11 来源：大连胃肠医院

社会性的细菌：群落特性 ≠ 细菌属性相加

今天是第609期日报。

COM：细菌群落的固有特性（综述）

Current Opinion in Microbiology[IF:6.635]

① 细菌群落被细菌间复杂的相互作用所塑造，展现出的群落固有特性无法根据群落中每种细菌在孤立环境中的属性加以预测；② 群落固有特性不仅影响菌群中细菌的基因表达和表现型，也影响菌群的构成和整体功能，可对宿主产生影响：比如多物种生物被膜的形成可促进其中所有菌种生长，或增强对抗生素的抗性；③ 结构化环境可辅助并稳定细菌间的相互作用，增加群落固有特性的复杂度；④ 研究群落固有特性对临床、应用和环境微生物学都具有重要意义。

Bacterial social interactions and the emergence of community-intrinsic properties

2017-11-30 DOI: 10.1016/j.mib.2017.11.018

CMI：小肠类器官培养用于病原体感染研究（综述）

Cellular and Molecular Immunology[IF:5.897]

① 小肠类器官是可在体外长期分化的上皮细胞模型，通过模拟小肠细胞性及复杂性，成为研究肠道疾病的载体；② 多能干细胞分化而获得的为organoid，由肠道隐窝经3D培养而获得的称为enteroid；③ 系统可用于宿主-菌群/共生菌互作研究，也可用于传染病及病原体的研究，例如人轮状病毒、原虫感染的发病机制，也可有效促进疫苗及临床治疗学等发展；④ 随着对肠道模型的不断升级优化，有望在未来实现综合人体组织模型和人体器官芯片的开发。

Engineered Human Gastrointestinal Cultures to Study the Microbiome and Infectious Diseases

2017-12-04 DOI: 10.1016/j.jcmgh.2017.12.001

PNAS：地域分布促进哺乳动物肠道菌群的多样化

PNAS[IF:9.661]

研究美洲136种野生哺乳动物的肠道菌群多样性差异；① 菌群的β-多样性与宿主地域分布显著相关，两者的关联不受宿主亲缘关系及饮食的影响；② 共有菌群的比例随宿主分布地域间的距离增加而呈指数递减；③ 捕食者和猎物的肠道菌群间相似度高，存在广泛的菌群共享，表明菌群可通过食物链扩散；④ 宿主地域分布的差异，导致并维持了肠道菌群结构的多样性；⑤ 将菌群多样性与宿主亲缘、饮食和分布因素进行综合考虑，数据分析方法值得借鉴。

Dispersal limitation promotes the diversification of the mammalian gut microbiota

2017-12-11 DOI: 10.1073/pnas.1700122114

FI：给小鼠移植过敏儿童菌群，Th17反应增强

Frontiers in Immunology[IF:6.429]

① 收集3组儿童的粪便：7名无过敏家族史且粪便乳酸杆菌阳性（NH_L）、6名有过敏家族史且粪便乳杆菌阳性（AH_L）、6名有家族过敏史（AH）；② 将3组儿童的粪便移植给无菌小鼠，移植后的小鼠的后代表现出不同的免疫反应及菌群组成；③ 移植了AH组儿童粪便菌群的小鼠，后代表现出肠道黏膜处及系统性的Th17反应增强；④ Th17反应增强是菌群发生过敏风险增加相关变化的标志。

Early-life human microbiota associated with childhood allergy promotes the T helper 17 axis in mice

2017-12-01 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01699

FM：口腔白斑病患者的口腔粘膜白斑菌群

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 分析36名口腔白斑病患者的口腔粘膜白斑菌群和32名健康人的口腔粘膜组织菌群；② 口腔白斑中的梭杆菌门丰度增加，厚壁菌门水平降低，念珠菌属定殖更普遍；③ 口腔白斑的菌群定殖模式变异性高，可辨别出5个不同的细菌簇，这些簇与梭杆菌属、纤毛菌属和弯曲杆菌属共同出现，与结直肠癌中观察到的菌群共存模式相似；④ 口腔白斑的舌下部位的粘滑罗斯菌丰度增加，重度异生与纤毛菌属和简明弯曲菌水平升高相关。

The microbiome of potentially malignant oral leukoplakia exhibits enrichment for Fusobacterium, Leptotrichia, Campylobacter and Rothia species

2017-12-01 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02391

Genes：肺炎患儿的鼻咽菌群及口咽菌群变化

Genes[IF:3.600]

① 在中国，肺炎支原体肺炎（MPP）的发病率显着增加，呼吸道菌群失调与各种呼吸道疾病相关；② 对60名肺炎儿童和59名健康儿童鼻咽（NP）和口咽（OP）采样分析，患者的痰和OP拭子用于病原体检测；③ 肺炎儿童与健康儿童的NP和OP菌群均显著不同，患病儿童的NP和OP中菌群多样性较低和共生网络较简单；④ 在肺炎患者中，NP和OP菌群之间相似性更大，表明NP菌群传播到OP；⑤ 除了临床检测到的病原体外，在7例患者的NP和OP菌群中也鉴定出潜在病原体。

The Alteration of Nasopharyngeal and Oropharyngeal Microbiota in Children with MPP and Non-MPP

2017-12-11 DOI: 10.3390/genes8120380

FCIM：膀胱过度活动症女性的尿液菌群及心理变化

Frontiers in cellular and infection microbiology[IF:4.300]

① 膀胱过度活动症（OAB）是一种复杂病因的常见疾病，常伴有精神疾病；② 分析30名OAB女性患者和25名对照的尿液菌群多样性与心理评分之间的相关性；③ 与对照组相比，OAB组的菌群多样性和丰富度都较低；④ OAB和对照组的菌群显著不同，OAB组的7个菌属（如变形杆菌属和气球菌属）增加，13个菌属（如乳杆菌属和普氏菌属）减少；⑤ OAB组尿液菌群的丰富度和多样性与抑郁量表自评分负相关，一些菌属在有/无焦虑或抑郁的OAB妇女中无显著差异。

Urinary Microbiome and Psychological Factors in Women with Overactive Bladder

2017-11-27 DOI: 10.3389/fcimb.2017.00488

Microbiome：食物影响肉牛瘤胃菌群的耐药性及致病性基因

Microbiome[IF:8.496]

饮食结构对肉牛瘤胃菌群的耐药性具有重要作用；① 50只牛取自三次独立实验，无抗生素使用史，分别食用草料、谷物浓缩料比例为1:1或1:11.5的饲料；② 食用高谷物浓缩料含量的饲料，瘤胃菌群中耐药性、定殖、细胞交流和致病性相关基因的丰度和多样性较高，变形菌门的相对比例较高；③ 使用高草料含量的饲料，氯霉素及微菌素耐药性基因占主要部分；④ 耐药性/致病性相关基因，与变形菌门/厚壁菌门+拟杆菌门的相对比例，可共同作为菌群失衡的指标。

The rumen microbiome as a reservoir of antimicrobial resistance and pathogenicity genes is directly affected by diet in beef cattle

2017-12-11 DOI: 10.1186/s40168-017-0378-z