大连合生制剂：巨头的新欢，初创公司的机遇

发布时间：2020-07-11 来源：大连胃肠医院

合生制剂：巨头的新欢，初创公司的机遇

今天是第604期日报。

MB：如何研发合生制剂？

Microbial Biotechnology[IF:3.513]

① 达能、雀巢、通用磨坊等食品公司在传统益生菌市场中占据最大市场份额，近年来制药公司开始获得益生菌市场份额，一些初创公司也开始尝试以菌群作为靶点治疗疾病；② 他们现在也把目光投向了包括益生菌与支持益生菌生长的碳源底物的合生制剂；③ 设计合生制剂要综合考虑：益生菌可在宿主中促进特定效应、益生菌的安全性、益生菌定殖的暂时/可逆/可控性、益生元可特异性促进益生菌的生长、益生元无害、组合的效果优于单独的益生菌或益生元。

Designing synbiotics for improved human health

2017-12-04 DOI: 10.1111/1751-7915.12885

FM：比起特定菌株，粪菌移植更有效恢复肠道免疫细胞

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 广谱抗生素处理小鼠8周后，分别定殖大肠杆菌或约氏乳杆菌，或粪菌移植小鼠混合菌群；② 抗生素处理后，小肠、大肠及肠系膜淋巴结中的免疫细胞减少，粪菌移植或定殖特定细菌物种可部分或完全恢复；③ 约氏乳杆菌定殖后，小肠及脾脏中的CD4+及CD8+细胞数量最高，大肠杆菌及约氏乳杆菌定殖均可恢复结肠中的上述细胞类群；④ 大肠杆菌及约氏乳杆菌定殖增加Treg及活化DC的比例，但恢复程度不及粪菌移植，并可完全恢复肠道记忆性/效应T细胞。

Fecal Microbiota Transplantation, Commensal Escherichia coli and Lactobacillus johnsonii Strains Differentially Restore Intestinal and Systemic Adaptive Immune Cell Populations Following Broad-spectrum Antibiotic Treatment

2017-12-11 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02430

BMJ O：益生菌有益于中低收入国家早产儿

BMJ Open[IF:2.369]

① 选取在4个大陆的10个中低收入国家进行的23项随机对照试验，进行系统性综述与meta分析，研究益生菌在降低早产新生儿的死亡率及发病率中的安全性与有效性；② 结果表明，补充益生菌可显著降低坏死性小肠结肠炎（NEC）、晚发性败血症的风险及全因死亡率；③ 随机效应模型分析的结果显著，排除具有高误差风险的研究后，差异仍然显著；④ 并无显著不良事件报道。

Benefits of probiotics in preterm neonates in low-income and medium-income countries: a systematic review of randomised controlled trials

2017-12-07 DOI: 10.1136/bmjopen-2017-017638

FAN：巴戟天低聚果糖或有助于应对阿尔兹海默症

Frontiers in Aging Neuroscience[IF:4.504]

① 研究巴戟天低聚果糖（OMO）对阿尔兹海默症（AD）的作用；② OMO处理可缓解AD大鼠模型的学习及记忆能力障碍，改善氧化应激及炎症疾病，调节神经递质的合成与分泌；③ OMO可缓解脑组织肿胀、神经元凋亡，并下调AD的胞内标记物（Tau蛋白及Aβ1-42）的表达；④ OMO可维持肠道菌群的多样性及稳定性；⑤ 另外，OMO还可调节抗生素诱导的IBD小鼠模型的肠道菌群组成及代谢。

Prebiotic effect of fructooligosaccharides from Morinda officinalis on Alzheimer's disease in rodent models by targeting the microbiota-gut-brain axis

2017-12-08 DOI: 10.3389/fnagi.2017.00403

FAN：阿尔兹海默症vs口腔健康vs菌群内分泌vs营养（综述）

Frontiers in Aging Neuroscience[IF:4.504]

① 慢性牙周炎与阿尔兹海默症（AD）的发展可能存在因果关联，外源性炎症可能是引发AD的次要因素；② 口腔菌群的失调导致牙龈卟啉单胞菌（一种关键牙周致病菌）及其伴生菌种破坏宿主的免疫系统，若口腔软组织存在损伤，可能导致菌血症；③ 对口腔致病菌的系统性炎症反应导致多种代谢及炎症并发症，包括AD；④ 必需微量营养素的缺乏可能通过促进牙周致病菌生长而导致菌群失调；⑤ 乳杆菌属中的益生细菌可能分泌抗炎性神经化学物质影响大脑。

Exploring the association between Alzheimer's disease, oral health, microbial endocrinology and nutrition

2017-12-01 DOI: 10.3389/fnagi.2017.00398

FI：溃疡性结肠炎的菌群特征及潜在干预靶点（综述）

Frontiers in Immunology[IF:6.429]

① 溃疡性结肠炎患者的肠道菌群组成发生变化；② 有益菌（柔嫩梭菌群、梭菌属IV及XIVa簇、双歧杆菌属、拟杆菌属、Roseburia菌属等）减少、有害菌（粘附入侵性大肠杆菌、梭杆菌属、白色念珠菌）增加；③ 菌群变化对肠道炎症的影响机制包括：调节Treg细胞其它免疫细胞、调节促炎及抑炎因子、产生丁酸盐等短链脂肪酸、直接侵入肠道上皮细胞等；④ 溃疡性结肠炎的潜在靶点包括：NLRP炎症小体、维生素D受体、包括细胞因子在内的分泌蛋白。

Influence of microbiota on intestinal immune system in ulcerative colitis and its intervention

2017-11-28 DOI: 10.3389/fimmu.2017.01674

FCIM：同样压力条件下，无菌小鼠焦虑较弱

Frontiers in cellular and infection microbiology[IF:4.300]

① 无菌小鼠及SPF小鼠分为4组，其中2组接受慢性束缚应激（CRS）处理；② 相同的CRS条件处理下，相比于SPF小鼠，无菌小鼠的焦虑样行为较轻，且下丘脑-垂体-肾上腺（HPA）轴中的CRH、ACTH、CORT及ALD水平较高，Nr3c2 mRNA水平下降；③ 无菌小鼠的激素及激素受体也与SPF小鼠存在显著差异；④ 肠道菌群造成的HPA轴失衡可能影响脑中的神经内分泌系统，造成焦虑样行为。

Microbiota Modulate Anxiety-like Behavior and Endocrine Abnormalities in Hypothalamic-Pituitary-Adrenal Axis

2017-11-30 DOI: 10.3389/fcimb.2017.00489

NAR：性能更优的菌群数据分析新算法

Nucleic Acids Research[IF:10.162]

① 用全长蛋白质校准翻译的测序序列，以注释测定的序列“亲代蛋白质”分子功能性，建立功能性测序序列注释（faser）算法；② 利用faser算法分析不同油污染阶段的沙滩沙粒、饮食干预的PWS患儿的68个宏基因组数据库以及11例克罗恩氏病患者及家属肠道菌群的数据；③ 鉴定出BP溢油数据内的油降解特异性功能、饮食干预时PWS患儿个体化的特异性肠道菌群应答以及CD患者的促炎菌群富集；④ 鉴别功能的分辨率水平优于PSI-BLAST，精准性优于MG-RAST。

Functional sequencing read annotation for high precision microbiome analysis

2017-11-29 DOI: 10.1093/nar/gkx1209