大连榜样：有效的益生菌RCT，登上JAMA子刊~

发布时间：2020-07-14 来源：大连胃肠医院

榜样：有效的益生菌RCT，登上JAMA子刊~

今天是第573期日报。

JAMA子刊：三联益生菌应对中度特应性皮炎，有效！

JAMA Dermatology[IF:5.817]

① 2016年3-6月间，在西班牙针对50名4-17岁中度特应性皮炎患者，进行为期12周的随机双盲安慰剂对照干预试验；② 试验组每日服用一粒益生菌胶囊，含10^9 CFU的乳双歧杆菌CECT 8145、长双歧杆菌CECT 7347和干酪乳杆菌CECT 9104；③ 在特应性皮炎评分（SCORAD）方面，试验组比对照组平均减少19.2分，相对来说，试验组降低83%，对照组仅降低24%；④ 在试验组中，有7.7%（161/2084）的病人日需要使用局部类固醇治疗，对照组则为10.8%（220/2032）。

Effect of Oral Administration of a Mixture of Probiotic Strains on SCORAD Index and Use of Topical Steroids in Young Patients With Moderate Atopic Dermatitis: A Randomized Clinical Trial

2017-11-08 DOI: 10.1001/jamadermatol.2017.3647

TM：化疗引发的耐药性

Trends in Microbiology[IF:11.020]

① 化疗可能损伤肠道上皮细胞并引起黏膜炎，破坏共生菌群，导致致病菌扩增，引起肠道菌群紊乱；② 化疗介导的细菌DNA损伤可造成细菌的SOS系统激活及de novo突变的形成；③ 若化疗与抗生素结合使用，抗生素将选择那些因化疗诱变产生的耐药性细菌，从而引起致病菌的过度生长并向血液中转移；④ 在化疗之外，癌症免疫疗法也可能影响共生菌群：免疫检查点抑制剂可增强T细胞对共生细菌的应答，例如CTLA-4抑制剂可引起自身免疫性小肠结肠炎。

Not Just Antibiotics: Is Cancer Chemotherapy Driving Antimicrobial Resistance?

2017-11-13 DOI: 10.1016/j.tim.2017.10.009

Cell子刊：食物对小鼠菌群影响复杂，对照选择极关键

Cell Reports[IF:8.282]

① 小鼠分三组：喂食8周普通饲料、精制低脂食物（rLFD）或精制高脂食物（rHFD）；② 在肠道菌群构成（OTU丰度、厚壁菌门/拟杆菌门比值）、肠发酵能量获取、肠道形态等方面，rLFD小鼠和rHFD小鼠相比虽存在细节差异但整体相似，与普通饲料组小鼠有明显区别；③ 只有rHFD小鼠表现出肥胖和葡萄糖不耐受；④ 以rLFD小鼠或普通饲料组小鼠为对照，得出的与肥胖和葡萄糖耐受度相关的因素是不同的；⑤ 为避免得出错误结果，研究菌群应谨慎选择对照组食物。

Dietary Uncoupling of Gut Microbiota and Energy Harvesting from Obesity and Glucose Tolerance in Mice

2017-11-07 DOI: 10.1016/j.celrep.2017.10.056

FF：槲皮素+白藜芦醇，调节大鼠肠道菌群并减肥

Food and Function[IF:3.247]

① 将大鼠分为正常饮食组（ND），高脂饮食（HFD）组和槲皮素与白藜芦醇（CQR）组，CQR组喂食HFD并口服槲皮素和白藜芦醇；② CQR降低体重增加、能量摄入和内脏脂肪组织重量，并降低血脂、血清炎症性标志物（IL-6、TNF-α、MCP-1）、逆转血清生化指标（脂联素，胰岛素，瘦素等）；③ CQR调节肠道菌群组成，相比于HFD组，显著减低毛螺菌科等与肥胖相关的菌科的丰度，增加Akk菌等与缓解肥胖相关的菌科/菌属的丰度。

Combination of quercetin and resveratrol reduces obesity in high-fat diet-fed rats by modulation of gut microbiota

2017-11-01 DOI: 10.1039/C7FO01383C

FM：食品相关菌群研究必用的测序技术（综述）

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 16S rDNA测序、宏基因组和宏转录组已是食品相关菌群的3种常用测序方法；② 二代测序（NGS）可用于监测食品原材料及生产环境、即食食品的表面菌群、食品贮存相关菌群、抗生素耐药环境传播等，还可用于鉴定食品中的特定细菌；③ 提升食品中提取核酸的质量/数量、测序中使用合适的阳性及阴性对照，可更好地改善基于NGS的食品菌群研究；④ 单分子长时间读取测序SMRT、HeliScope、MinION等第三代测序（TGS）平台在未来可能用于食品相关菌群检测。

A Review on the Applications of Next Generation Sequencing Technologies as applied to Food-related Microbiome Studies

2017-09-21 DOI: 10.3389/fmicb.2017.01829

CID：宏基因组二代测序用于感染诊断（综述）

Clinical Infectious Diseases[IF:8.216]

① 宏基因组二代测序（mNGS）可无偏倚地平行测序标本中所有的核酸，未来可能成为感染性疾病诊断的通用检测方法；② 可对细菌、真菌、寄生虫和病毒进行鉴定及基因组分型，且不需要提前知道临床样本中特定病原体的相关知识；③ 可通过宿主核酸扩增测序，评估与感染的存在及类型相关的宿主免疫应答；④ 通过对细菌负载进行定量及监测宿主免疫应答，可鉴别定殖与感染；⑤ mNGS的方法标准化、数据贮存、保护、分析、结果解读等方面仍需改进。

Understanding the Promises and Hurdles of Metagenomic Next-Generation Sequencing as a Diagnostic Tool for Infectious Diseases

2017-10-12 DOI: 10.1093/cid/cix881

Microbiome：通过富集系统检测宏基因组中低丰度的耐药组分

Microbiome[IF:8.496]

① 抗生素耐药是宿主、菌群和环境互作的复杂现象，在宏基因组样本中，耐药组仅占一小部分；② 利用MEGaRICH诱饵捕获和富集系统，可显著提高耐药组-病毒组靶点测序比例，检测出额外的1441个基因，低丰度部分多样性更高，组成上不同于传统宏基因组测序法的结果；③ 该部分含有与全球健康相关的耐药基因，如超广谱β-内酰胺酶，而在传统方法未检出；④ 诱饵捕获和富集系统可鉴定出罕见耐药基因的单倍型，不影响总体耐药组的组成，可鉴别样本起源。

Enrichment allows identification of diverse, rare elements in metagenomic resistome-virulome sequencing

2017-10-17 DOI: 10.1186/s40168-017-0361-8

Gut：肠嗜铬细胞在神经精神性疾病中发挥作用

Gut[IF:16.658]

① Stevens等发现，连蛋白及脂肪酸结合蛋白2的增加，与焦虑或抑郁患者的LPS升高及肠道菌群组成异常相关；② IBS患者抑郁症发生率高于健康个体，神经精神性疾病与肠道菌群失衡相关，机制可能为肠道细胞间紧密连接开放，多种毒素入血，导致一系列神经精神症状；③ 人体内90%以上的5-羟色胺由肠嗜铬细胞（EC）释放，突出间隙的5-羟色胺缺失与抑郁症相关，EC还可使氯胺酮执行其药理学功能；④ EC在神经精神性疾病的发病和治疗机制中发挥重要作用。

Enterochromaffin cells in the gut: a distant regulator of brain function?

2017-10-28 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315406