大连癌症精准治疗，就是离不开肠道菌群~

癌症精准治疗，就是离不开肠道菌群~

今天是第563期日报。

梅奥学报：癌症精准治疗，肠道菌群不可或缺！

Mayo Clinic Proceedings[IF:6.686]

① 长期住院、免疫抑制、多次使用抗生素、化疗等因素会导致肠道失调，因而癌症患者是艰难梭菌感染（CDI）的易感人群；② Hefazi等人报告了对23名接受过化疗的癌症患者使用粪菌移植（FMT）治疗复发性CDI，有效率达86%，且无严重不良反应和感染并发症；③ 该研究表明，在高感染风险的癌症患者中，用FMT治疗CDI是安全且有效的；④ 肠道菌群和癌症的关系复杂而密切，可以作为生物标记物、诊断工具、治疗靶点，是癌症精准治疗中不可缺少的因素。

Gut Microbiota and Cancer Patients: A Broad-Ranging Relationship

2017-11-01  DOI: 10.1016/j.mayocp.2017.09.009

梅奥学报：FMT用于化疗后肿瘤患者CDI，安全有效！

Mayo Clinic Proceedings[IF:6.686]

① 2012-2016年间，23名恶性肿瘤患者接受粪菌移植（FMT）以应对艰难梭菌感染（CDI）；② 患者在FMT前平均12个月接受化疗，平均有4次CDI复发且平均接受106天的抗生素治疗；③ FMT后60天内，23人的艰难梭菌均为阴性，除3人外无人复发腹泻，1人在FMT后5天因与FMT无关的心脏骤停而死亡；④ 22人存活60天或以上，11人接受进一步化疗，10人使用更多抗生素，2人分别在FMT后14和22月复发CDI；⑤ 所有案例中，无归因于FMT的其他严重不良反应和感染并发症。

Safety and Efficacy of Fecal Microbiota Transplant for Recurrent Clostridium difficile Infection in Patients With Cancer Treated With Cytotoxic Chemotherapy: A Single-Institution Retrospective Case Series

2017-11-01  DOI: 10.1016/j.mayocp.2017.08.016

TEM：预防1型糖尿病，或可以糖攻糖

Trends in Endocrinology and Metabolism[IF:10.893]

① Zhang等人的研究表明甘露糖具有免疫调节功能，可特异性诱导初始T细胞向调节性T细胞（Treg）分化；② 在小鼠模型中，口服甘露糖可预防和抑制某些自身免疫疾病，包括非肥胖性一型糖尿病和卵清蛋白诱导的呼吸道炎症；③ 甘露糖经SLC2A转运到细胞内，增强线粒体中脂肪酸氧化产生自由基、上调整合素αVβ8的表达，进而激活TGF-β，诱导产生FoxP3+ Treg细胞；④ 该研究表明甘露糖或可用于一型糖尿病等自身免疫疾病的预防和治疗，具有临床意义。

A Sweet Deal for Diabetes

2017-11-01  DOI: 10.1016/j.tem.2017.10.006

Nature子刊：甘露糖诱导Treg并抑制小鼠1型糖尿病

Nature Medicine[IF:29.886]

① D-甘露糖是葡萄糖的差向异构体，存在于植物和水果中；② 细胞实验表明，甘露糖可以诱导人类和小鼠的初始T细胞向Foxp3+调节性T细胞（Treg）分化；③ T细胞中，甘露糖能提升整合素αVβ8的表达、脂肪酸氧化和自由基水平，促使TGF-β活化，从而增强TGF-β信号，诱导Treg细胞生成；④ 在小鼠中，口服甘露糖能增加Treg细胞的比例，抑制自身免疫性的1型糖尿病和卵清蛋白诱导的呼吸道炎症；⑤ 甘露糖的免疫调节作用具有潜在的临床应用价值。

D-mannose induces regulatory T cells and suppresses immunopathology

2017-07-24  DOI: 10.1038/nm.4375

Neurotherapeutics：多发性硬化中的饮食、菌群与维生素（综述）

Neurotherapeutics[IF:5.166]

① 连接多发性硬化中饮食、肠道菌群、维生素D/A的关键是低度炎症；② 高卡路里、高动物脂肪的西式饮食使肠道菌群失调，其引起的肠道炎症导致肠道屏障泄露，从而破坏血脑屏障，最终导致神经炎症；③ 与此相反，富含纤维的素食饮食与肠道生态平衡及健康相关；④ 在低度炎症状态下维生素D的水平缺乏，服用高剂量维生素D3可恢复其正常水平；⑤ 维生素D与其受体结合需要维生素A的参与，从而发挥其抗炎症作用，对于维生素缺乏者，这两种维生素均需提供。

Diet, Gut Microbiota, and Vitamins D + A in Multiple Sclerosis

2017-10-24  DOI: 10.1007/s13311-017-0581-4

GB：不依赖于参考基因组的宏基因组分析算法MetaGen

Genome Biology[IF:11.908]

① 开发一种新的统计宏基因组算法MetaGen，可在不使用参考基因组的情况下，同时鉴定出微生物物种并估计其相对丰度；② 作为取舍，这种算法需要多个宏基因组样品（通常需要不少于10个样品），才能得到高精度的binning结果；③ 与其它不依赖于参考基因组的方法（基于k-mer分布或覆盖信息的算法）相比，该算法的物种binning准确率更高，且在测序覆盖度较低时仍相当有效；④ 通过模拟及真实宏基因组研究验证了该算法的有效性。

MetaGen: reference-free learning with multiple metagenomic samples

2017-10-03  DOI: 10.1186/s13059-017-1323-y

NAR：EBI宏基因组分析平台2017年度报告

Nucleic Acids Research[IF:10.162]

① EBI宏基因组提供了一个对特殊环境中的微生物种群测序数据进行分析并归档的免费平台；② 在过去的20多年内，EBI宏基因组将其数据集的数量增加了10倍，并且在增加通量的同时，添加了最新的计算分析工具及参考数据集；③ 添加了基于大/小亚基RNA标记基因的分类方法，并添加了宏基因组组装作为新的分析服务；④ 从公共数据集中产生了超过2400个组装集合，基于此生成了一个包含超过5000万序列的可搜索、非冗余的蛋白数据库。

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