大连生命早期的细菌，影响脑细胞的生和死

发布时间：2020-07-20 来源：大连胃肠医院

生命早期的细菌，影响脑细胞的生和死

今天是第512期日报。

BBI：围产期小鼠的脑细胞，受肠道菌群深入影响！

Brain Behavior and Immunity[IF:5.964]

① 分析比较新生无菌小鼠与对照小鼠脑中的抑炎/促炎细胞因子表达、发育细胞的死亡、小神经胶质细胞的定殖；② 促炎症因子IL-1β及TNF-α在无菌小鼠中的表达被显著抑制，无菌小鼠的脑细胞死亡也发生变化；③ 下丘脑室旁核及海马起层CA1区域的细胞死亡频率增加，下丘脑弓状核的细胞死亡频率则降低；④ 无菌小鼠的小神经胶质细胞的细胞大小及数量均增加；⑤ 细胞因子表达、细胞死亡及小神经胶质细胞的差异在出生时显著，胎龄18.5天时无上述差别。

The microbiota influences cell death and microglial colonization in the perinatal mouse brain

2017-09-07 DOI: 10.1016/j.bbi.2017.08.027

BBI：抗生素伤菌促抑郁，益生菌或有助逆转

Brain Behavior and Immunity[IF:5.964]

① 抗生素扰动小鼠肠道菌群，造成炎症并导致肠道中某些内源性大麻素成员的改变；② 抗生素处理改变了小鼠的行为，包括在悬尾实验中的不动性增加，社交认知降低，这些改变与海马体中的BDNF/TrkB信号通路、TRPV1磷酸化、神经元放电的变化相关；③ 在控制情感行为的脑区域中，抗生素处理造成了非神经细胞的形态重排；④ 在使用抗生素之后使用益生菌，可逆转肠道炎症，并恢复行为、生化及功能上的改变；⑤ 毛螺菌科与菌群失调小鼠的行为变化显著相关。

Antibiotic-induced microbiota perturbation causes gut endocannabinoidome changes, hippocampal neuroglial reorganization and depression in mice

2017-09-07 DOI: 10.1016/j.bbi.2017.09.001

ACSN：改造来源于沙门氏菌的蛋白，治疗IBD！

ACS Nano[IF:13.942]

① 肠道致病菌可抑制哺乳动物的炎症及免疫调节通路；② 对沙门氏菌的乙酰转移酶（AvrA）进行工程化改造，可抑制IBD患者中常见的急性炎症反应；③ 利用AvrA及载体蛋白设计直径为125nm的交联蛋白纳米颗粒，载体蛋白可在无沙门氏菌的状态下递送AvrA；④ AvrA纳米颗粒可在体内及体外被肠道屏障上皮及固有层中的单核细胞吞噬，并可抑制炎症信号通路，在体外及结肠炎小鼠模型体内起到细胞保护作用，并降低临床及组织学炎症参数。

Bioengineering Bacterially Derived Immunomodulants: A Therapeutic Approach to Inflammatory Bowel Disease

2017-09-05 DOI: 10.1021/acsnano.7b03239

Science：肠道Paneth细胞如何应对细菌入侵？

Science[IF:37.205]

① 肠道Paneth细胞通过分泌抗菌蛋白（包括溶菌酶）抑制细菌入侵；② 入侵的致病菌可破坏高尔基体，干扰分泌从而抑制肠道的抗菌防御；③ 在细菌感染期间，溶菌酶可通过分泌性自噬（一种基于自噬的替代性分泌途径）被分泌，从而绕开传统的分泌途径；④ 细菌引起的内质网应激触发Paneth细胞的分泌性自噬，需要来自天然免疫细胞的外源信号；⑤ 携带自噬基因Ath16L1突变的小鼠，其Paneth细胞的分泌性自噬受损，该突变与人的克罗恩病风险上升相关。

Paneth cells secrete lysozyme via secretory autophagy during bacterial infection of the intestine

2017-09-08 DOI: 10.1126/science.aal4677

APT：一文读懂肠道病毒组（综述）

Alimentary Pharmacology & Therapeutics[IF:7.286]

① 人类病毒组由动物细胞病毒、噬菌体、内源性逆转录病毒、导致持续感染和潜伏性感染的病毒组成；② 肠道病毒组具有个性化、稳定的特征，主要由噬菌体组成；③ 在出生后的几年内发展成熟，噬菌体能通过杀伤其宿主细菌或改变宿主细菌的表型，从而改变菌群的结构，以维持微生态平衡；④ 对病毒组的了解仍是碎片化的，需要标准化的病毒分离方法和测序方法才能进行更详细的描述，从而理解病毒组与疾病之间的关联，并将病毒组作为干预的靶点。

Review article: the human intestinal virome in health and disease

2017-09-04 DOI: 10.1111/apt.14280

Gut：抑制NAD可缓解肠道炎症

Gut[IF:16.658]

① 烟酰胺磷酸核糖转移酶（NAMPT）在维持细胞的NAD供应中是必需的，催化NAD补救合成途径中的限速步骤；② NAMPT在IBD等炎症中显著上调，FK866（NAMPT的小分子抑制剂）可缓解DSS诱导的小鼠结肠炎，并抑制炎症相关的肿瘤发生；③ FK866可降低粘膜NAD，导致NAD依赖性酶（包括PARP1、Sirt6、CD38）的丰度及活性降低；④ 并降低NF-κB活性，减少炎症性单核细胞、巨噬细胞及活化后的T细胞的浸润；⑤ FK866可降低IBD患者LPMNC的细胞因子释放。

NAD metabolism fuels human and mouse intestinal inflammation

2017-09-06 DOI: 10.1136/gutjnl-2017-314241

Microbiome：16S有局限，转录组更宜洞察菌群功能

Microbiome[IF:8.496]

① 野生型及围脂滴蛋白2缺失小鼠在接受高脂/低碳水化合物（HF）或低脂/高碳水化合物（LF）饮食后，宏转录组分析菌群转录产物的表达；② HF饮食显著改变了两种小鼠的菌群转录产物表达，但群落结构未发生变化；③ 在缺失围脂滴蛋白2的小鼠中，菌群转录产物的变化包括产生脂肪酸、核苷酸、氨基酸的代谢酶的上调；④ LF饮食不会引起菌群转录产物或代谢通路表达的显著变化；⑤ 16S测序分析菌群组成有局限性，转录组等精细方法能更好分析菌群功能变化。

Perilipin-2 modulates dietary fat-induced microbial global gene expression profiles in the mouse intestine

2017-09-06 DOI: 10.1186/s40168-017-0327-x

BB：微生物差异丰度法无法控制错误发现率

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS[IF:5.134]

① 差异丰度法用于检测细菌物种的丰度与之间的关联；② 在鉴定可作为预后或诊断生物标记物的菌群，或分析前体药物及抗生素药物的疗效时，差异丰度法十分重要；③ 通过参数化/非参数化模拟以及真实数据，对比不同的差异丰度法的表现；④ 不同方法均表现出过高的错误发现率，让人对之前的菌群研究的可靠性及可重复性产生怀疑；⑤ 多数模拟研究忽略了物种间的相关性，但这种相关性可能对差异丰度法产生负面影响。

A broken promise: microbiome differential abundance methods do not control the false discovery rate

2017-08-22 DOI: 10.1093/bib/bbx104