大连监测城市污水菌群，帮助改善公众健康

发布时间：2020-06-22 来源：大连胃肠医院

监测城市污水菌群，帮助改善公众健康

今天是第793期日报。

Nature子刊：市政污水菌群反映人群健康状态

Nature Reviews Microbiology[IF:26.819]

① 利用多组学方法监测城市污水菌群，有助于分析人群健康并采取相应促健康措施；② 污水中的细菌相对丰度与人粪便具有相关性，可反映人群的共生菌群状况；③ 污水中的肠道细菌可作为地区性公众健康的生物标记，有研究证明污水菌群可有效反映城市肥胖率；④ 将鸟枪法宏基因组测序数据与基因/菌群功能数据整合，可通过污水菌群了解人群肠道菌群的毒性、抗生素耐药性和代谢特征；⑤ 对污水菌群进行日常监测，有助于对人群和环境菌群作出实时评估。

Surveying what's flushed away

06-21 DOI: 10.1038/s41579-018-0047-7

合成菌群结合数据建模解码肠道菌群互作

Molecular Systems Biology[IF:9.75]

① 使用12种人体肠道微生物构建成对菌群，检测菌群结构和生物量随时间的变化，使用广义Lotka-Volterra构建了多样化菌群预测的动态模型；② 两菌株的成对相互作用是菌群动态变化的主要驱动因素，多菌株间的高阶相互作用影响较小；③ 菌群中存在广泛的正/负相互作用拓扑结构，通过负反馈平衡了单菌株在适应性上的差异，从而达到多菌株的稳定共存；④ 代谢组分析单一菌种的细胞外代谢物，为解释菌群互作的分子机制了提供基础。

Deciphering microbial interactions in synthetic human gut microbiome communities

06-21 DOI: 10.15252/msb.20178157

菌群变化影响肠道氧化还原动态

eLife[IF:7.725]

① 氧化还原电势受到宿主和菌群的共同影响，分析抗生素如何影响宿主肠道中的氧化还原状态；② 使用广谱抗生素后的小鼠，肠道氧化还原电势在几小时内升高；③ 在人体肠道体外模型中发现，肠道氧化还原电势的变化主要来自于抗生素对菌群的抑制，氧化还原动态主要与肠杆菌科的大量生长相关；④ 群落生态演替至抗生素处理前的肠道菌群组成，与肠道氧化还原电势的恢复相关。

Antibiotic-induced changes in the microbiota disrupt redox dynamics in the gut

06-19 DOI: 10.7554/eLife.35987

肠道寄生虫及其产物有望用于治疗免疫疾病

Trends in Parasitology[IF:6.333]

① 免疫疾病发病率上升与肠道寄生虫感染减少相关；② 寄生虫可能通过诱导Th2和Treg的免疫平衡、减少促炎症的Th1/Th17免疫应答，从而抑制过敏和自身免疫病；③ 临床试验尚未证实用猪鞭虫卵等寄生虫疗法治疗免疫疾病足够有效，但动物和流行病学研究均表明基于寄生虫的疗法具有前景；④ 寄生虫分泌组中的多种蛋白和小分子被证实具有免疫调节作用，是潜在的免疫疾病候选药物，比直接用寄生虫安全性更好；⑤ 寄生虫衍生分子也有望用于其它疾病。

The Untapped Pharmacopeic Potential of Helminths

06-25 DOI: 10.1016/j.pt.2018.05.011

寄生虫-菌群-宿主免疫互作及IL-25在其中的作用

Trends in Parasitology[IF:6.333]

① 胃肠道寄生虫可分泌抗菌物质、触发肠上皮释放警报素引起免疫应答改变肠道微环境，影响菌群组成和功能；② 某些共生菌可直接或通过调节宿主免疫来促进/抑制寄生虫定殖；③ 肠上皮产生的IL-25在宿主-寄生虫-菌群互作中起关键介导作用；④ IL-25受菌群调控，寄生虫感染时其表达上调，促进Th2介导的抗寄生虫免疫，调节RORγt+淋巴细胞、维持肠道免疫稳态和屏障完整性；⑤ 感染肠吸虫E. caproni的小鼠模型可用于研究宿主-寄生虫-菌群关系的因果性。

Classic Models for New Perspectives: Delving into HelminthMicrobiotaImmune System Interactions

06-22 DOI: 10.1016/j.pt.2018.05.009

Nature：肠隐窝损伤修复与肠道胚胎发育程序相似

Nature[IF:40.137]

① 多形螺旋线虫侵入小鼠十二指肠粘膜形成肉芽肿结构，引起组织损伤应答；② 多形螺旋线虫感染诱导肠隐窝上皮中277个基因表达改变，抑制Lgr5等干细胞标志物，激活干扰素（IFN）-γ应答及其下游转录程序（如增加Sca-1表达）；③ 其它方法诱导肠上皮损伤也引起类似应答；④ 多形螺旋线虫诱导的肠隐窝细胞表现出与胚胎肠上皮类似的特性：体外培养时可形成球状物，用scRNA-seq鉴定出这些细胞中存在转录程序类似胚胎肠上皮的细胞亚群。

Parasitic helminths induce fetal-like reversion in the intestinal stem cell niche

06-27 DOI: 10.1038/s41586-018-0257-1

巨噬细胞直接作用于平滑肌，促进胃肠蠕动

Immunity[IF:22.845]

① 表达CX3C趋化因子受体1的肌层巨噬细胞（MM）对维持正常胃肠蠕动是必需的；② MM表达的瞬变感受器电位蛋白V4（TRPV4）通道可感知热、机械和化学信号；③ 选择性药物抑制TRPV4或巨噬细胞特异性Trpv4缺陷小鼠表现出胃肠蠕动减弱，并足以逆转与化疗相关的胃肠过度蠕动；④ TRPV4调控MM释放前列腺素E2，以旁分泌方式，经肠平滑肌细胞中的前列腺素E受体信号通路，引起结肠收缩；⑤ 肠神经系统不参与巨噬细胞介导的结肠收缩。

TRPV4 Channel Signaling in Macrophages Promotes Gastrointestinal Motility via Direct Effects on Smooth Muscle Cells

06-26 DOI: 10.1016/j.immuni.2018.04.021