大连病毒：悬在人类头上的达摩克利斯之剑

发布时间：2020-07-02 来源：大连胃肠医院

病毒：悬在人类头上的达摩克利斯之剑

今天是第695期日报。

Science：全球病毒组计划启动

Science[IF:37.205]

① 2018年启动全球病毒组计划（GVP），以确定主要的病毒威胁，并为防止病毒大流行及时提供信息以进行公共卫生干预；② GVP面临的挑战包括：费用、远距离采样的安全性、如何评估新型病毒的威胁等；③ 目标是通过提高对病毒爆发的监测，提高应对病毒流行的效率，并对人和家畜的症状进行监测，以鉴定病毒反复爆发的野生动物区域；④ 以及聚焦RNA病毒、扩大经济规模等；⑤ GVP可加速发现病毒的步伐，使病毒学、系统发生学和模型方法获得更丰富的数据。

The Global Virome Project

02-23 DOI: 10.1126/science.aap7463

高福院士：病毒不断涌现，防控任重道远

Cell[IF:30.41]

① 流感病毒不断发生基因演化和重组，是典型的再现病原体，后者还包括埃博拉和寨卡病毒；② 应谨防禽流感与季节性人流感病毒重组产生高致死率的新毒株，改变传统活禽交易或是可行方法；③ SARS和MERS冠状病毒都是新发病原体，2003年SARS爆发后，中国政府联合学术、产业和医疗机构建立监控系统，以监视、预报和预防疾病爆发；④ 应积极应对潜在的病毒爆发：监控病原体、开发疫苗和抗病毒疗法，这需要国际合作，同时也不能忽略病毒相关基础研究。

From "A"IV to "Z"IKV: Attacks from Emerging and Re-emerging Pathogens

03-08 DOI: 10.1016/j.cell.2018.02.025

复旦+疾控中心：利用宏基因组学深入研究RNA病毒

Cell[IF:30.41]

① 宏基因组、宏转录组等方法为研究病毒的进化、基因组和功能提供了丰富信息，揭示病毒遗传学多样性，也为病毒分类学带来挑战；② RNA病毒基因组具有多样化、结构复杂、长短不一等特点，呈现明显的动态变化，其基因复制和缺失、基因组重排、基因水平转移发生率高于想像；③ RNA病毒进化是基因水平转移、节段数量变化等一系列基因组加工的过程；④ 对RNA病毒之间、RNA病毒与菌群/宿主之间的互作，及这些互作如何影响疾病仍知之甚少。

Using Metagenomics to Characterize an Expanding Virosphere

03-08 DOI: 10.1016/j.cell.2018.02.043

Cell子刊：膳食补充剂硫酸软骨素可能致癌

Molecular Cell[IF:14.714]

① 膳食补充剂硫酸软骨素（CHSA）是一种用于骨关节炎的粘多糖；② CHSA可选择性促进BRAF V600E基因突变的黑色素瘤细胞生长，并导致对BRAF抑制剂耐药性的产生；③ 在PTEN野生型BRAF V600E突变的黑色素瘤细胞中，硫酸软骨素葡萄糖醛酸转移酶（CSGlcA-T）可催化产生CHSA以抑制PTEN，并维持PIP3水平从而持续激活AKT，促进细胞生长；④ NRAS及PI3KCA的突变可直接激活PI3K-AKT通路，不依赖于CHSA。⑤ 膳食补充剂也会产生促癌作用，对其选择要极其慎重。

The Dietary Supplement Chondroitin-4-Sulfate Exhibits Oncogene-Specific Pro-tumor Effects on BRAF V600E Melanoma Cells

03-15 DOI: 10.1016/j.molcel.2018.02.010

TMM：利用代谢组学寻找药物成瘾的生物标志物

Trends in Molecular Medicine[IF:10.732]

① 药物代谢组学分为靶向和非靶向代谢组学，是利用GC-MC、LC-MS、NMR等技术对不同来源的生物样本的内/外源性物质进行分析；② 以阿片成瘾性为例，代谢组学方法可用于寻找与成瘾性相关的生物标志物，确定靶点、监控疾病，从而进行有目的的药物或营养干预；③ 体内实验设计应注意基因、生活方式、微生物等因素对实验结果的影响；④ 应进行临床和流行病学的调查，细胞、动物实验应注意剂量和时间，从动物模型到人体的过度应注意关联。

Using Metabolomics to Investigate Biomarkers of Drug Addiction

02-01 DOI: 10.1016/j.molmed.2017.12.005

TEM：应谨慎选择对照组的饮食

Trends in Endocrinology and Metabolism[IF:10.893]

① 在一项最新的研究中，Dalby等人强调了选择正确的对照组饮食在动物实验中的重要性；② 饮食可显著影响营养、肠道菌群、肥胖发展之间的互作，错误的对照组饮食选择可能导致产生错误的结论；③ 对比普通饲料、精制低脂食物（rLFD）或精制高脂食物（rHFD），发现rLFD饮食喂食的小鼠与普通饲料喂食的小鼠相比，肠道菌群组成、肠发酵能量获取、肠道形态等均有显著差异；④ 研究HFD的影响时，选择LFD还是普通饲料作为对照组，对结果有显著影响。

Do we choose control diets wisely?

03-01 DOI: 10.1016/j.tem.2018.02.007

SR：研究小鼠肠道菌群，饲养环境不可忽视

Scientific Reports[IF:4.259]

① 采用全交叉纵向研究设计，考察三种常见的饲养变量：垫料（压缩纸和碎木屑），鼠笼通风方式（静态微型隔离器和独立通风笼罩）和饮食（不同含量的蛋白、脂肪）对小鼠肠道菌群组成的影响；② 收集小鼠粪便及空肠、回肠、盲肠内容物进行16S rRNA检测；③ 饲养环境可以相互作用，引起肠道某些区域（尤其是盲肠）菌群组成的变化；④ 饲养环境可能影响实验结果的可重复性；⑤ 盲肠取样可能是研究环境对肠道菌群变化影响的最佳选择。

The influence of caging, bedding, and diet on the composition of the microbiota in different regions of the mouse gut

03-06 DOI: 10.1038/s41598-018-21986-7

PR：家里带毛宠物越多，胎便菌群多样性越高

Pediatric Research[IF:2.882]

① 对218名新生儿的第一次胎便进行菌群测序；② 检测到每个新生儿的胎便菌群的OTU数量为0-448个；③ 丰度最高的为厚壁菌门，相对丰度为44%，其后为变形菌门和拟杆菌门，相对丰度分别为28%、15%；④ 多因素分析表明，家庭环境的生物多样性（依据带毛宠物数量）增加了胎便菌群的多样性，而分娩方式、分娩时接触抗生素等围产期因素并不会影响胎便菌群；⑤ 肠道菌群的发育或许始于胎儿时期，菌群在子宫内可转移，并在怀孕期间受母体因素的影响。

Maternal influence on the fetal microbiome in a population-based study of the first-pass meconium

03-14 DOI: 10.1038/pr.2018.29