大连低碳水饮食改善脂肪肝，菌群来帮忙

发布时间：2020-07-05 来源：大连胃肠医院

低碳水饮食改善脂肪肝，菌群来帮忙

今天是第664期日报。

Cell子刊：低碳水饮食迅速改变菌群改善脂肪肝

Cell Metabolism[IF:18.164]

① 短期低碳水饮食（LCD）干预为肥胖的非酒精性脂肪肝患者带来多种代谢益处，用多组学法分析；② LCD显著减少脂肪生成、增强β-氧化（血清β-羟基丁酸浓度大幅上升），使肝脏脂肪含量急剧下降；③ LCD诱导肠道菌群快速转变，25个菌属丰度显著变化，产叶酸的链球菌属和乳球菌属迅速增多，伴随着血清叶酸水平上升，或与脂代谢、氧化应激和炎症的改善相关；④ 肝脏中基因表达改变，脂肪酸合成通路下调、叶酸介导的碳代谢和脂肪酸氧化通路上调。

An Integrated Understanding of the Rapid Metabolic Benefits of a Carbohydrate-Restricted Diet on Hepatic Steatosis in Humans

02-07 DOI: 10.1016/j.cmet.2018.01.005

Nature子刊：LGG能否改善哮喘高风险婴儿的肠道菌群

Nature Communications[IF:12.124]

① 哮喘高风险婴儿分为LGG组（10例）和安慰剂组（15例），前者出生后每天口服鼠李糖乳杆菌GG（LGG）持续6个月；② 与哮喘低风险婴儿（29例）相比，高风险婴儿有明显不同的胎便菌群，肠杆菌科和拟杆菌科富集，Akk菌属、栖粪杆菌属和罗氏菌属等缺失；③ 且肠道菌群多样性发育迟缓，菌群功能偏向糖酵解，缺乏多种抗炎性脂代谢物；④ 这些不足在LGG组婴儿中得到部分补救，其菌群代谢物可在体外增加调节性T细胞，停止LGG补充后6个月这些效果消失。

Delayed gut microbiota development in high-risk for asthma infants is temporarily modifiable by Lactobacillus supplementation

02-16 DOI: 10.1038/s41467-018-03157-4

ARI：一文读懂肠道菌群相关IgA（综述）

Annual Review of Immunology[IF:28.396]

① IgA具有中和毒素和病毒、阻止过多活菌的粘附或转位、清除上皮表面多余的大分子结构等功能；② IgA结合可预测促炎症菌群，适当多样化的IgA是维持菌群分类多样性所必需的；③ 导致IgA多样性的体细胞突变过程可在肠道次级淋巴样组织中进行，而不需要高亲和性B细胞受体参与；④ 结合型IgA可修饰菌群代谢，消除粘膜炎症应答；⑤ 通过高通量测序技术分析菌群或IgA的多样性，有助于选择性靶向不同类型的菌群，并帮助研究IgA多样化的轨迹。

IgA Function in Relation to the Intestinal Microbiota

01-26 DOI: 10.1146/annurev-immunol-042617-053238

Nature子刊：心血管疾病的个性化治疗应考虑哪些因素

Nature Medicine[IF:29.886]

① 个性化医疗已经推动癌症治疗领域的改革，对心血管疾病相关的遗传机制和生物标记物的研究，也将把个性化医疗带到心血管疾病治疗领域；② 患者的遗传因素可影响心血管药物的效果，如抗凝血的华法林和氯吡格雷、调控血脂的他汀类药物和达塞曲匹；③ 炎症状态也是重要的参考指标，血液标记物主要是C-反应蛋白，抗炎症的他汀和卡纳单抗可用于针对疗法；④ 血细胞炎症和血液中神经酰胺水平或应纳入考虑，特定的肠道菌群也与心血管疾病相关。

Taking personalized medicine to heart

02-07 DOI: 10.1038/nm.4495

Cell子刊：果蝇如何调控由菌群肽聚糖引发的免疫反应

Cell Host and Microbe[IF:14.946]

① 果蝇中，源自肠道细菌的肽聚糖（PGN）可激活肠细胞和远端器官中的NF-κB信号通路；② PGRP-LB基因位点编码PGN裂解酶，包括胞质和分泌两种亚型，分别在局部和全身两个层面调控对PGN的反应；③ 胞质亚型可控制肠细胞中的NF-κB强度，分泌亚型可降解肠道中的PGN、防止PGN在果蝇体内扩散，这些功能依赖其酰胺酶活性；④ 肠道中的PGN扩散至血淋巴，可引起脂肪体代谢功能紊乱等NF-κB介导的系统性免疫反应，危害果蝇的生理和健康，缩短生存期。

Cytosolic and Secreted Peptidoglycan-Degrading Enzymes in Drosophila Respectively Control Local and Systemic Immune Responses to Microbiota

02-01 DOI: 10.1016/j.chom.2017.12.007

Microbiome：新方法预测ARG，更准确

Microbiome[IF:8.496]

① 新的DeepARG-DB数据库整合了三大常用耐药基因检索数据库，扩展了耐药基因的检索范围；② DeepARG方法能够检索／预测宏基因组短序列（DeepARG-SS模块）和基因组、开放阅读框等长序列（DeepARG-LS模块）中的耐药基因；③ 新方法显著降低对基因相似度的要求，保证比对准确度的同时显著降低假阳性率，可避免大量遗漏耐药基因；④ 新方法的准确度依赖于DeepARG-DB的录入信息以及训练用数据库，对多重耐药基因和条目少的基因类别准确度欠佳。

DeepARG: a deep learning approach for predicting antibiotic resistance genes from metagenomic data

02-01 DOI: 10.1186/s40168-018-0401-z

香港理工大学等：PM2.5传播抗生素耐药基因的城乡和季节差异

Environmental Science & Technology[IF:6.198]

① 相比工业区和城市，农村的PM2.5中气载细菌和抗生素耐药基因（ARG）的季节性差异最为明显：冬季细菌总数显著降低且特定ARG富集（春季稀释）；② ARG与可动遗传因子intI1的统计相关性，沿农村、城市、工业区依次减弱，其他机制或可动遗传因子可能参与调控不同土地利用度地区的气载ARG传播；③ 对于人们对环境中特定ARG和intI1的日常摄入，气载PM2.5与饮水和误食耕种土壤的影响程度相似；④ PM2.5对于在环境和人群中传播常见的ARG有重要作用。

Seasonal Disparities in Airborne Bacteria and Associated Antibiotic Resistance Genes in PM2. 5 between Urban and Rural Sites

01-18 DOI: 10.1021/acs.estlett.7b00561

中科院城市环境研究所：抗生素对土壤昆虫有何影响

Environmental Science & Technology[IF:6.198]

① 用10mg/kg抗生素处理两周后，土壤跳虫（Folsomia candida）的生长明显受到抑制，16s rRNA基因丰度减少了约10倍；② 抗生素改变土壤跳虫肠道菌群的结构，降低菌群多样性；③ 抗生素处理组土壤跳虫体重的降低，可能与厚壁菌门:拟杆菌门比例降低有关；④ 抗生素暴露显著增加土壤跳虫肠道内耐药基因的种类和丰度，耐药基因组和肠道菌群显著相关；⑤ 抗生素可引起非目标生物的肠道菌群变化（如土壤跳虫），影响其生长、增加耐药基因。

Antibiotics Disturb the Microbiome and Increase the Incidence of Resistance Genes in the Gut of a Common Soil Collembolan

01-29 DOI: 10.1021/acs.est.7b04292