大连尼泊尔大地震，震出饮用水菌群的波动

发布时间：2020-07-11 来源：大连胃肠医院

尼泊尔大地震，震出饮用水菌群的波动

今天是第602期日报。

FM：2015年尼泊尔地震后，饮用水中菌群受到短期影响

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 在经历过2015年尼泊尔地震的2个地区收集饮用水样本，分析季节变化及地震对水中菌群的影响；② 重点关注维持地球生物化学性质的菌群（氨氧化细菌、亚硝酸盐氧化细菌、古细菌、硫酸盐还原细菌）及常见条件致病菌（不动杆菌属）；③ 对于维持地球生物化学性质的菌群，地震导致其中一个区域的该类菌属的丰度显著上升，8个月后下降，另一个区域的该类菌群保持稳定；④ 通过菌群来源追踪分析，发现地震后，一些采样点的饮用水受到了人类粪便污染。

The effect of the 2015 Earthquake on the bacterial community compositions in water in Nepal

2017-12-06 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02380

Martin等：孕鼠用抗生素，后代菌群受损并易得结肠炎

Nature Microbiology[IF:N/A]

① 野生型和IL10缺陷型的无菌孕鼠，移植被抗生素扰乱（STAT）的小鼠肠道菌群或正常小鼠的肠道菌群；② 孕鼠菌群可传递给后代并长期持续，后代菌群结构和菌群基因组成受宿主基因型和母体菌群的共同影响；③ IL10缺陷小鼠易患结肠炎，相较对照菌群，移植STAT菌群使IL10缺陷孕鼠的后代结肠炎病情加剧，相关基因表达情况恶化；④ 使用LEfSe分析和Random Forest建模鉴定出潜在的抗IBD菌和促IBD菌；⑤ 孕期使用抗生素扰乱菌群可能影响后代疾病易感性。

Intergenerational transfer of antibiotic-perturbed microbiota enhances colitis in susceptible mice

2017-11-27 DOI: 10.1038/s41564-017-0075-5

Nutrients：或存在对衰老至关重要的肠道-肌肉轴（综述）

Nutrients[IF:3.550]

① 营养不良和活动不足是老年人原发性肌肉减少症的主要病理生理因素；② 肠道菌群通过代谢营养物质产生叶酸、维生素B2、维生素B12、甜菜碱、色氨酸、短链脂肪酸、尿石素等，影响骨骼肌功能；③ 粪便菌群的组成、物种丰度、多样性与老年人的虚弱及残疾相关，粪便菌群组成变化可能与肌肉性能及肌肉量的下降相关；④ 锻炼影响肠道菌群组成，益生菌和益生元的干预影响肌肉功能；⑤ 可能存在“肠道-肌肉轴”，肠道菌群可作为营养对肌肉细胞作用的中介。

Aging Gut Microbiota at the Cross-Road between Nutrition, Physical Frailty, and Sarcopenia: Is There a Gut-Muscle Axis?

2017-11-30 DOI: 10.3390/nu9121303

Nanoscale：利用纳米颗粒抑制幽门螺旋杆菌感染

Nanoscale[IF:7.367]

① 肠道细菌可能会导致严重的疾病，其感染途径与一些不同的纳米颗粒（NP）的胃肠道吸收途径重叠；② NP可与幽门螺旋杆菌（HP）和肠道病原体形成复合物，组装迅速，不受生理温度变化的影响，但受NP物理化学特性的影响，表面带负电荷的小NP结合HP的能力更强；③ NP包被不能抑制HP对胃上皮细胞及胃3D类器官模型的附着，但非杀菌性二氧化硅NP可通过减少CagA磷酸化、细胞骨架重排和IL-8分泌减弱HP感染。

Nanoparticle binding attenuates the pathobiology of gastric cancer-associated Helicobacter pylori

2017-12-05 DOI: 10.1039/C7NR06573F

Food Microbiol：中国南北泡菜各有何亚硝酸盐还原菌？

Food Microbiology[IF:3.759]

① 利用16S rRNA基因扩增子测序，分析呼和浩特及贵阳两地的泡菜中的细菌组成差异；② 鉴定出亚硝酸盐还原细菌属，大多数为乳杆菌属（73.37%），其余包括片球菌属、不动杆菌属、明串珠菌属、魏斯氏菌属、链球菌属、巨单胞菌属、肠球菌属及Alistipes菌属；③ 在南北两地的泡菜中，乳杆菌属均占主要部分，且其丰度与泡菜中的亚硝酸盐含量呈显著负相关，贵阳泡菜中的乳杆菌属丰度高于呼和浩特泡菜；④ 利用测序可全面评估泡菜等食品的微生物组成。

Effects of microbial diversity on nitrite concentration in pao cai, a naturally fermented cabbage product from China

2017-12-06 DOI: 10.1016/j.fm.2017.12.003

AEM：除了酒曲，白酒车间是发酵微生物重要来源

Applied and Environmental Microbiology[IF:3.807]

① 设置新老车间两个环境，利用高通量测序、多相代谢物靶标等方法分析白酒发酵过程中的微生物演替及代谢变化；② 大曲贡献了发酵过程大多数的真菌群落，而环境（室/内外地面、工具等）贡献了发酵过程中的大多数细菌群落；③ 新车间环境中芽孢杆菌属、魏斯氏菌属等5种菌属丰度下降，假单胞菌属、泛生菌属属等6个菌属丰度上升；④ 且新车间发酵过程中乙酸、乳酸、苹果酸、乙酸乙酯增加，乳酸乙酯减少；⑤ 环境微生物是发酵过程中微生物的重要来源。

Environmental Microbiota Drives Microbial Succession and Metabolic Profiles during Chinese Liquor Fermentation

2017-12-01 DOI: 10.1128/AEM.02369-17

Science子刊：GPR55如何增加肠道通透性

Science Immunology[IF:N/A]

① 小肠中的肠道上皮内淋巴细胞（IEL）与上皮细胞密切相关，GPR55在其中起负向调节作用；② GPR55可抑制溶血磷脂酰肌醇（LPI）诱导的IEL迁移，负向调节TCRγδ IEL在小肠中的积累；③ 活体成像研究揭示，GPR55缺陷型IEL的迁移速度更快，且与上皮细胞的结合更为紧密；④ GPR55可负向调节T细胞向小肠的归巢，以及γδ T细胞从派尔集合淋巴结的迁出；⑤ GPR55缺陷或短效GPR55拮抗剂处理，可在非甾体类抗炎药引起的肠道通透性增加中起保护作用。

GPR55 regulates intraepithelial lymphocyte migration dynamics and susceptibility to intestinal damage

2017-12-08 DOI: 10.1126/sciimmunol.aao1135

FM：干酪乳杆菌胞外多糖蛋白复合物抑制斑马鱼感染

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 干酪乳杆菌BL23可显著增加维氏气单胞菌感染的斑马鱼的存活率；② 干酪乳杆菌BL23在斑马鱼中的抗感染作用不依赖于菌群，鉴定出一种具有抗感染作用的胞外多糖蛋白复合物（EPSP）；③ 这种EPSP由一个40-45KD大小的蛋白及包含α-Rha、α-Glc、β-GlcNAc、β-GalNAc的胞外多糖组成；④ 1020 μg/ml剂量的EPSP可显著提升无菌斑马鱼在感染维氏气单胞菌后的存活率；⑤ EPSP诱导TLR1及TLR2的高表达，调节斑马鱼肝脏细胞中的促炎因子及抑炎因子表达谱。

EPSP of L. casei BL23 protected against the infection caused by Aeromonas veronii via enhancement of immune response in zebrafish

2017-12-08 DOI: 10.3389/fmicb.2017.02406